| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略语表 | 第15-16页 |
| 1 引言 | 第16-33页 |
| 1.1 益生菌 | 第16-17页 |
| 1.1.1 乳杆菌属 | 第16-17页 |
| 1.1.2 干酪乳杆菌Zhang | 第17页 |
| 1.2 抗生素 | 第17-30页 |
| 1.2.1 抗生素的分类 | 第17-21页 |
| 1.2.2 细菌耐药性的出现 | 第21-22页 |
| 1.2.3 细菌抗性基因的转移 | 第22-23页 |
| 1.2.4 乳酸菌耐药性的研究 | 第23-27页 |
| 1.2.5 乳酸菌耐药性的检测 | 第27-30页 |
| 1.3 细菌进化的研究 | 第30-32页 |
| 1.3.1 细菌在含有抗生素环境中的进化 | 第31-32页 |
| 1.3.2 基因组重测序 | 第32页 |
| 1.4 主要研究内容及实验目的和意义 | 第32-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-50页 |
| 2.1 菌株来源 | 第33-34页 |
| 2.2 主要试剂 | 第34页 |
| 2.3 主要设备 | 第34-35页 |
| 2.4 实验方法 | 第35-50页 |
| 2.4.1 干酪乳杆菌和植物乳杆菌耐药性的研究 | 第35-39页 |
| 2.4.2 干酪乳杆菌和植物乳杆菌抗性基因的检测 | 第39-41页 |
| 2.4.3 植物乳杆菌IMAU60045链霉素抗性基因的初步鉴定 | 第41-43页 |
| 2.4.4 干酪乳杆菌Zhang在含有抗生素的培养基中连续传代的研究 | 第43-49页 |
| 2.4.5 数据分析 | 第49-50页 |
| 3 结果与分析 | 第50-136页 |
| 3.1 干酪乳杆菌和植物乳杆菌抗生素耐药性 | 第50-55页 |
| 3.2 干酪乳杆菌和植物乳杆菌抗性基因的检测 | 第55-58页 |
| 3.3 植物乳杆菌IMAU60045链霉素抗性基因的初步鉴定 | 第58-60页 |
| 3.4 干酪乳杆菌Zhang在含有抗生素的培养基中的连续传代 | 第60-68页 |
| 3.4.1 干酪乳杆菌Zhang的生长曲线和代数计算 | 第60-62页 |
| 3.4.2 干酪乳杆菌Zhang在抗生素环境中传代过程中MIC的变化 | 第62-65页 |
| 3.4.3 干酪乳杆菌Zhang在去抗生素选择压力培养基的传代 | 第65页 |
| 3.4.4 干酪乳杆菌Zhang对β-内酰胺类和氨基糖苷类抗生素耐药性的变化 | 第65-66页 |
| 3.4.5 干酪乳杆菌Zhang在传代过程中活菌数和OD值的变化 | 第66-68页 |
| 3.5 干酪乳杆菌Zhang传代过程中各谱系基因组重测序 | 第68-123页 |
| 3.5.1 基因组重测序样品DNA的质量控制 | 第69-73页 |
| 3.5.2 样品纯度的检测 | 第73-77页 |
| 3.5.3 干酪乳杆菌Zhang基因组重测序数据预处理 | 第77-86页 |
| 3.5.4 各代不同传代环境干酪乳杆菌Zhang基因组中基因突变检测 | 第86-118页 |
| 3.5.5 干酪乳杆菌Zhang质粒中基因突变的检测 | 第118页 |
| 3.5.6 突变基因产物直系同源簇和代谢通路的分析 | 第118-123页 |
| 3.6 干酪乳杆菌Zhang对阿莫西林和庆大霉素耐药性增强机理的研究 | 第123-136页 |
| 3.6.1 传代过程中干酪乳杆菌Zhang对阿莫西林耐药性增强机理研究 | 第124-132页 |
| 3.6.2 传代过程中干酪乳杆菌Zhang对庆大霉素耐药性增强机理研究 | 第132-134页 |
| 3.6.3 其他耐药机理 | 第134-136页 |
| 4 讨论 | 第136-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 参考文献 | 第140-156页 |
| 作者简介 | 第156-157页 |
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