| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-15页 |
| 1 公猪繁殖性状在养猪生产中的重要经济意义 | 第8-9页 |
| 2 公猪繁殖性状的 QTL 定位结果 | 第9-11页 |
| ·7 号染色体上公猪繁殖性状的 QTL 定位结果 | 第9-10页 |
| ·其它染色体上公猪繁殖性状的 QTL 定位结果 | 第10-11页 |
| 3 公猪繁殖性状候选基因的研究状况 | 第11-12页 |
| ·7 号染色体公猪繁殖性状候选基因研究进展 | 第11页 |
| ·其它染色体公猪繁殖性状候选基因研究进展 | 第11-12页 |
| 4 基因型填补（Genotype Imputation） | 第12-13页 |
| ·基因型填补的原理 | 第12页 |
| ·常用的算法和软件 | 第12-13页 |
| 5 基因型填补 GWAS 在哺乳动物中的研究状况 | 第13-14页 |
| 6 MEA1、TEP1 基因在哺乳动物中的研究进展 | 第14页 |
| 7 本研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| 第二章 研究正文 | 第15-41页 |
| 1 引言 | 第15页 |
| 2 实验材料与方法 | 第15-24页 |
| ·实验动物及 DNA 样品制备 | 第15页 |
| ·主要试剂和实验设备 | 第15-16页 |
| ·主要试剂 | 第15-16页 |
| ·实验设备 | 第16页 |
| ·公猪繁殖性状 QTL 精细定位 | 第16-19页 |
| ·新增 SNP 标记的选择 | 第16-17页 |
| ·SNPs 位点的基因型判定 | 第17-19页 |
| ·精细定位统计方法 | 第19页 |
| ·公猪繁殖性状基因型填补 GWAS 统计分析 | 第19页 |
| ·位置候选基因的鉴别研究 | 第19-24页 |
| ·位置候选基因的筛选 | 第19页 |
| ·MEA1 基因多态位点与公猪繁殖性状的关联性分析 | 第19-21页 |
| ·TEP1 基因多态位点与公猪繁殖性状的关联性分析 | 第21-23页 |
| ·MEA1、TEP1 基因在附睾及不同组织中的表达 | 第23-24页 |
| 3 实验结果 | 第24-35页 |
| ·7 号染色体影响公猪繁殖性状的 QTL 精细定位 | 第24-25页 |
| ·7 号染色体影响公猪繁殖性状的基因型填补 GWAS 分析结果 | 第25-28页 |
| ·7 号染色体影响公猪繁殖性状的基因型填补 GWAS 验证结果 | 第28-29页 |
| ·位置候选基因多态位点与公猪繁殖性状的关联性分析和 F-drop 分析结果 | 第29-32页 |
| ·位置候选基因的表达分析结果 | 第32-35页 |
| ·MEA1 基因型与该基因在附睾组织表达量的关联性 | 第32-33页 |
| ·TEP1 基因型与该基因在附睾组织表达量的关联性 | 第33页 |
| ·MEA1、TEP1 基因 QTT 分析结果 | 第33-34页 |
| ·MEA1、TEP1 基因在不同组织中的表达情况 | 第34-35页 |
| 4 分析与讨论 | 第35-40页 |
| ·7 号染色体公猪繁殖性状 QTL 精细定位 | 第35-36页 |
| ·公猪繁殖性状基因型填补 GWAS 分析 | 第36-37页 |
| ·影响公猪繁殖性状的两个位置功能候选基因的鉴别研究 | 第37-40页 |
| 5 小结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
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