Abstract | 第7-8页 |
摘要 | 第9-10页 |
缩略语表 | 第10-11页 |
1 Introduction | 第11-34页 |
1.1 Brassica as a crop | 第11页 |
1.2 The Genetic Interrelationship among Brassica Crop Species | 第11-12页 |
1.3 Brassica rapa (B.rapa) | 第12-14页 |
1.4 Polyploidization | 第14-17页 |
1.4.1 Distribution of polyploidy | 第14-15页 |
1.4.2 Types of polyploidy | 第15-16页 |
1.4.3 Autopolyploidization | 第16-17页 |
1.5 Cytogenetics of Autopolyploidy | 第17-20页 |
1.6 Genetics of Polyploidy | 第20-26页 |
1.6.1 Chromosome rearrangement | 第20页 |
1.6.2 Genome imprinting | 第20-21页 |
1.6.3 Genome paramutation | 第21页 |
1.6.4 Gene sequence change | 第21-22页 |
1.6.5 Gene dosage effect(Indel) | 第22-23页 |
1.6.6 Gene expression control | 第23页 |
1.6.7 Effect of transposable element | 第23-24页 |
1.6.8 Tissue specific gene expression | 第24-25页 |
1.6.9 Epigenetic change of polyploidy | 第25-26页 |
1.7 Phenotypic Change of Polyploidy | 第26-28页 |
1.7.1 Cell size | 第26-27页 |
1.7.2 Physiology and development | 第27-28页 |
1.7.3 Reproductive biology | 第28页 |
1.8 Frequency of Autopolyploidy than Allopolyploidy | 第28-30页 |
1.9 Advantages and Disadvantages of being Polyploidy | 第30-32页 |
1.10 Aims and Objective of the Study | 第32-34页 |
2 Materials and Methods | 第34-38页 |
2.1 Plant Materials | 第34页 |
2.2 Identification of Chromosome Number | 第34页 |
2.3 Study of Meiotic Behavior | 第34-35页 |
2.4 Identification of Pollen Fertility | 第35页 |
2.5 RNA-seq Library Preparation and Sequencing | 第35页 |
2.6 Reads Filtering and Alignment | 第35-36页 |
2.7 Analysis of Differentially Expressed Genes(DEGs) | 第36页 |
2.8 The Method for Fatty Acid Composition | 第36-37页 |
2.9 Statistical Analysis | 第37-38页 |
3 Results | 第38-51页 |
3.1 Phenotypic Study | 第38-40页 |
3.2 Morphological Study | 第40-41页 |
3.3 Cytogenetical Analysis | 第41-44页 |
3.4 Transcriptomic Analysis | 第44-50页 |
3.4.1 General characteristics of the whole sillique transcriptome | 第44-45页 |
3.4.2 Novel gene expression and silencing in doubled plant | 第45-46页 |
3.4.3 Distribution of DEGs on chromosomes | 第46-47页 |
3.4.4 Identification of transgressively expressed genes | 第47-48页 |
3.4.5 Functional annotation of DEGs | 第48页 |
3.4.6 Number of DEGSs and total gene of three subgenome of doubled plant | 第48-49页 |
3.4.7 Gene copy number variation in doubled plant | 第49-50页 |
3.5 The Fatty Acid Composition | 第50-51页 |
4 Discussion | 第51-56页 |
4.1 Autopolyploidy Evidence | 第51-56页 |
4.1.1 Phenotypic effect | 第51页 |
4.1.2 Cytogenetical effect | 第51-53页 |
4.1.3 Genetics effect | 第53-56页 |
References | 第56-71页 |
Acknowledgement | 第71-73页 |
Appendix | 第73-80页 |