| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 主要符号对照表 | 第12-13页 |
| 第1章 引言 | 第13-23页 |
| 1 低氧对鱼类的影响 | 第13-15页 |
| 1.1 低氧对鱼类种群结构和生长发育的影响 | 第13-14页 |
| 1.2 鱼类应对低氧的适应策略 | 第14-15页 |
| 2 转录组测序技术及其在鱼类中的应用 | 第15-16页 |
| 3 低氧相关基因的研究进展 | 第16-21页 |
| 3.1 低氧诱导因子 | 第16-18页 |
| 3.1.1 低氧诱导因子的概述 | 第16-18页 |
| 3.1.2 HIF在低氧适应中的研究进展 | 第18页 |
| 3.2 促红细胞生成素及其受体 | 第18-20页 |
| 3.2.1 促红细胞生成素及其受体的概述 | 第18-19页 |
| 3.2.2 EPO及其受体在低氧适应中的研究进展 | 第19-20页 |
| 3.3 血管内皮生长因子 | 第20-21页 |
| 3.3.1 血管内皮生长因子的概述 | 第20页 |
| 3.3.2 VEGF在低氧适应中的研究进展 | 第20-21页 |
| 4 裂腹鱼亚科鱼类及其生存环境的简介 | 第21-22页 |
| 5 研究的目的意义 | 第22-23页 |
| 第2章 花斑裸鲤低氧胁迫转录组研究 | 第23-53页 |
| 1 材料和方法 | 第23-29页 |
| 1.1 实验材料 | 第23页 |
| 1.2 实验方法 | 第23-29页 |
| 1.2.1 花斑裸鲤低氧胁迫 | 第23页 |
| 1.2.2 组织总RNA提取 | 第23-24页 |
| 1.2.3 转录组文库制备与测序 | 第24页 |
| 1.2.4 数据处理与分析 | 第24-25页 |
| 1.2.5 半定量real-timePCR验证 | 第25-29页 |
| 2 结果 | 第29-47页 |
| 2.1 总RNA的质量检测 | 第29页 |
| 2.2 花斑裸鲤转录组测序质量评估 | 第29-31页 |
| 2.3 混合转录本的组装 | 第31页 |
| 2.4 基因注释 | 第31-35页 |
| 2.4.1 GO功能注释 | 第33页 |
| 2.4.2 KOG注释及分类 | 第33-34页 |
| 2.4.3 KEGG代谢通路分析 | 第34-35页 |
| 2.5 组织特异性低氧适应差异表达基因及其通路分析 | 第35-47页 |
| 2.5.1 参考序列比对 | 第35-36页 |
| 2.5.2 基因差异表达分析 | 第36-38页 |
| 2.5.3 差异基因GO富集分析 | 第38-43页 |
| 2.5.4 差异基因的KEGG富集分析 | 第43-46页 |
| 2.5.5 qRT-PCR验证 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-53页 |
| 3.1 转录组文库测序分析 | 第47-48页 |
| 3.2 转录组功能分析 | 第48-53页 |
| 第3章 花斑裸鲤主要低氧相关基因表达调控的研究 | 第53-72页 |
| 1 材料与方法 | 第53-56页 |
| 1.1 实验材料 | 第53页 |
| 1.2 实验方法 | 第53-56页 |
| 1.2.1 分组和低氧处理 | 第53页 |
| 1.2.2 组织总RNA提取 | 第53-54页 |
| 1.2.3 cDNA第一链的合成 | 第54页 |
| 1.2.4 qRT-PCR检测主要低氧相关基因mRNA表达水平 | 第54-56页 |
| 2 结果 | 第56-68页 |
| 2.1 低氧条件下HIF-aA和HIF-aBmRNA的表达 | 第56-61页 |
| 2.1.1 低氧条件下HIF-1aA和HIF-1aBmRNA的表达 | 第56-58页 |
| 2.1.2 低氧条件下HIF-2aA和HIF-2aBmRNA的表达 | 第58-61页 |
| 2.2 低氧条件下EPO和EPORmRNA的表达 | 第61-64页 |
| 2.3 低氧条件下VEGF-A和VEGF-CmRNA的表达 | 第64-68页 |
| 3 讨论 | 第68-72页 |
| 3.1 低氧诱导因子HIF的低氧表达 | 第68-69页 |
| 3.2 促红细胞生成素EPO及受体EPOR的低氧表达 | 第69-70页 |
| 3.3 内皮细胞生长因子VEGF的低氧表达 | 第70-72页 |
| 全文主要结论 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 作者简介 | 第83-84页 |
| 附录 | 第84页 |
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