| 摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-15页 |
| 第一部分 攀西地区药用植物内生放线菌的分离,鉴定,抗菌活性及多样性研究 | 第15-88页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-40页 |
| ·植物内生菌 | 第15-22页 |
| ·植物内生菌的定义 | 第15-16页 |
| ·植物内生菌的分布及起源 | 第16-18页 |
| ·植物内生菌生物多样性 | 第18-19页 |
| ·植物内生菌与宿主的关系及作用 | 第19-22页 |
| ·生防作用 | 第19页 |
| ·促生作用 | 第19-20页 |
| ·抗逆作用 | 第20-22页 |
| ·植物内生放线菌的研究进展 | 第22-32页 |
| ·放线菌简介 | 第22-23页 |
| ·放线菌分类的研究概况 | 第23-25页 |
| ·经典分类 | 第24页 |
| ·化学分类 | 第24页 |
| ·分子分类 | 第24页 |
| ·多相分类 | 第24-25页 |
| ·植物内生放线菌的分离方法 | 第25-30页 |
| ·样品的采集 | 第26-27页 |
| ·表面消毒 | 第27-29页 |
| ·样品的处理 | 第29页 |
| ·表面消毒有效性检测 | 第29-30页 |
| ·植物内生放线菌分离培养基 | 第30页 |
| ·药用植物内生放线菌及其天然产物的多样性 | 第30-32页 |
| ·放线菌功能基因简介 | 第32-35页 |
| ·PKSⅠ | 第33-34页 |
| ·PKSⅡ | 第34-35页 |
| ·NRPS | 第35页 |
| ·药用植物内生放线菌功能基因研究现状 | 第35页 |
| ·攀西地区概况 | 第35-38页 |
| ·地形地貌 | 第36页 |
| ·水系 | 第36-37页 |
| ·气候 | 第37页 |
| ·植被 | 第37-38页 |
| ·土壤 | 第38页 |
| ·攀西地区药用植物内生放线菌资源研究的目的与意义 | 第38-40页 |
| 第二章 药用植物内生放线菌的分离 | 第40-50页 |
| ·实验材料 | 第40-42页 |
| ·样品采集 | 第40-42页 |
| ·实验方法 | 第42-44页 |
| ·样品保存 | 第42页 |
| ·样品的预处理 | 第42页 |
| ·表面消毒 | 第42-43页 |
| ·表面消毒有效检测 | 第43页 |
| ·内生放线菌的分离 | 第43页 |
| ·分离培养基 | 第43-44页 |
| ·结果与分析 | 第44-48页 |
| ·表面消毒有效性检测 | 第44页 |
| ·药用植物内生菌的分离 | 第44-48页 |
| ·讨论 | 第48-50页 |
| 第三章 药用植物内生菌多样性分析 | 第50-66页 |
| ·实验材料 | 第50页 |
| ·菌株 | 第50页 |
| ·试剂 | 第50页 |
| ·实验方法 | 第50-54页 |
| ·形态及培养特征观察 | 第51页 |
| ·药用植物内生放线菌基因组DNA提取 | 第51页 |
| ·内生放线菌16S rDNA的PCR扩增 | 第51-52页 |
| ·放线菌16S rDNA限制性酶切多态的分析(ARDRA) | 第52页 |
| ·16S rDNA产物纯化与测序分析 | 第52-53页 |
| ·药用植物内生放线菌的分子鉴定及系统发育树的构建 | 第53页 |
| ·GenBank序列号 | 第53-54页 |
| ·结果与分析 | 第54-63页 |
| ·内生放线菌形态观察 | 第54-56页 |
| ·内生放线菌基因组DNA的提取 | 第56-57页 |
| ·PCR扩增植物内生放线菌16S rDNA | 第57页 |
| ·16S rDNA PCR-RFLP分析 | 第57-63页 |
| ·讨论 | 第63-66页 |
| 第四章 药用植物内生放线菌抗菌活性及功能基因的研究 | 第66-88页 |
| ·药用植物内生放线菌抗菌活性的筛选 | 第66-68页 |
| ·实验材料 | 第66-68页 |
| ·抗菌活性筛选待测菌株 | 第66页 |
| ·培养基 | 第66-67页 |
| ·拮抗筛选指示菌 | 第67-68页 |
| ·抑菌活性检测 | 第68页 |
| ·药用植物内生菌PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS基因的筛选 | 第68-74页 |
| ·实验材料 | 第68-69页 |
| ·菌株 | 第68页 |
| ·引物 | 第68-69页 |
| ·试剂 | 第69页 |
| ·实验方法 | 第69-74页 |
| ·药用植物内生放线菌总DNA提取 | 第69-70页 |
| ·PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS基因的扩增 | 第70页 |
| ·克隆子检测 | 第70-71页 |
| ·PCR产物凝胶电泳检测 | 第71页 |
| ·PCR产物的回收与纯化 | 第71页 |
| ·回收片段酶连和转化 | 第71页 |
| ·制备感受态细胞 | 第71-72页 |
| ·转化 | 第72-73页 |
| ·阳性克隆子检测 | 第73页 |
| ·序列的比对与分析 | 第73页 |
| ·GenBank序列号 | 第73-74页 |
| ·结果与分析 | 第74-86页 |
| ·药用植物内生放线菌抗菌活性筛选 | 第74页 |
| ·药用植物内生放线菌PKSⅠ、PKSⅡ及NRPS基因的分子筛选 | 第74-81页 |
| ·药用植物内生放线菌PKSⅠ、PKSⅡ及NRPS基因多样性分析 | 第81-86页 |
| ·结论 | 第86-88页 |
| 第二部分 攀西地区药用植物根际放线菌的分离,鉴定,抗菌活性及多样性研究 | 第88-139页 |
| 第一章 文献综述 | 第88-102页 |
| ·根际微生物 | 第88-94页 |
| ·根际微生物的分布 | 第88-89页 |
| ·根际微生物种类的多样性 | 第89-91页 |
| ·根际微生物功能的多样性 | 第91-94页 |
| ·固氮作用 | 第91-92页 |
| ·促生作用 | 第92-94页 |
| ·抑菌作用 | 第94页 |
| ·根际微生物多样性的研究方法 | 第94-98页 |
| ·纯培养方法对微生物多样性的研究 | 第95页 |
| ·免培养方法对微生物多样性的研究 | 第95-98页 |
| ·环境样品总DNA的提取 | 第95-96页 |
| ·PCR扩增 | 第96页 |
| ·变性梯度凝胶电脉 | 第96页 |
| ·16S rRNA克隆文库分析 | 第96-97页 |
| ·单链构象多态 | 第97页 |
| ·末端限制性片段长度多态 | 第97-98页 |
| ·荧光原位杂交 | 第98页 |
| ·磷脂脂肪酸谱图分析 | 第98页 |
| ·影响根际微生物分布的因素 | 第98-99页 |
| ·植物 | 第98-99页 |
| ·土壤动物群 | 第99页 |
| ·非生物因素 | 第99页 |
| ·药用植物根际放线菌研究的现状 | 第99-100页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第100-102页 |
| 第二章 药用植物根际可培养放线菌的分离、抗菌活性及多样性研究 | 第102-123页 |
| ·实验材料 | 第102-103页 |
| ·样品采集 | 第102-103页 |
| ·实验方法 | 第103-105页 |
| ·土壤理化性质分析 | 第103页 |
| ·样品预处理 | 第103-104页 |
| ·根际放线菌分离培养基 | 第104页 |
| ·药用植物根际放线菌鉴定和多样性研究 | 第104-105页 |
| ·药用植物根际放线菌抗菌活性筛选 | 第105页 |
| ·实验结果与分析 | 第105-120页 |
| ·土壤理化性质的测定结果 | 第105-106页 |
| ·药用植物根际放线菌的分离 | 第106-111页 |
| ·不同培养基分离结果 | 第106-109页 |
| ·不同预处理对分离结果的影响 | 第109-110页 |
| ·不同培养基分离放线菌种类情况 | 第110-111页 |
| ·放线菌形态观察 | 第111-112页 |
| ·药用植物根际放线菌多样性分析 | 第112-116页 |
| ·药用植物根际放线菌抗菌活性 | 第116-120页 |
| ·讨论 | 第120-123页 |
| 第三章 药用植物根际不可培养放线菌的多性样研究 | 第123-139页 |
| ·实验材料 | 第123-124页 |
| ·土样样品 | 第123页 |
| ·试剂 | 第123-124页 |
| ·实验方法 | 第124-129页 |
| ·土壤样品总DNA提取 | 第124页 |
| ·PCR-DGGE分析 | 第124-127页 |
| ·PCR扩增 | 第124-126页 |
| ·PCR产物凝胶电泳检测 | 第126页 |
| ·DGGE分析 | 第126-127页 |
| ·图像和多样性分析 | 第127页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA基因克隆文库的构建 | 第127-129页 |
| ·PCR扩增 | 第127页 |
| ·PCR产物凝胶电泳检测 | 第127-128页 |
| ·文库克隆子的ARDRA分析 | 第128页 |
| ·克隆序列测序与分析 | 第128页 |
| ·文库系统发育分析 | 第128页 |
| ·文库多样性指数分析 | 第128-129页 |
| ·GenBank序列号 | 第129页 |
| ·结果与分析 | 第129-137页 |
| ·药用植物根际土壤总DNA的提取 | 第129页 |
| ·PCR-DGGE检测 | 第129-132页 |
| ·PCR扩增 | 第129-130页 |
| ·DGGE条带及多样性分析 | 第130-132页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第132-137页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA基因扩增 | 第132-133页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA克隆文库的构建 | 第133-134页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA多样性指数分析 | 第134-135页 |
| ·药用植物根际放线菌16S rDNA系统发育分析 | 第135-137页 |
| ·讨论 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-157页 |
| 附录 | 第157-162页 |
| 致谢 | 第162-164页 |
| 攻读博士学位期间发表文章情况 | 第164页 |
| 获奖情况 | 第164页 |
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