| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| 1.1 布鲁氏菌简介 | 第12-19页 |
| 1.1.1 布鲁氏菌的分类和命名 | 第12-13页 |
| 1.1.2 布鲁氏菌的形态与染色特性 | 第13页 |
| 1.1.3 布鲁氏菌的培养特性 | 第13页 |
| 1.1.4 布鲁氏菌的抗原特性 | 第13-16页 |
| 1.1.5 布鲁氏菌的致病性与毒力 | 第16-17页 |
| 1.1.6 布鲁氏菌光滑表型与粗糙表型的特点 | 第17页 |
| 1.1.7 布鲁氏菌粗糙型突变株用作疫苗株的研究 | 第17-18页 |
| 1.1.8 布鲁氏菌LPS合成相关基因 | 第18-19页 |
| 1.2 布鲁氏菌基因组概述 | 第19-22页 |
| 1.2.1 布鲁氏菌基因组结构 | 第19-20页 |
| 1.2.2 布鲁氏菌不同菌株基因组的差异 | 第20页 |
| 1.2.3 布鲁氏菌基因组学的未来 | 第20-22页 |
| 1.3 DNA测序技术概述 | 第22-28页 |
| 1.3.1 一代测序技术 | 第22-23页 |
| 1.3.2 二代测序技术 | 第23-26页 |
| 1.3.3 三代测序技术 | 第26-28页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
| 第二章 粗糙型RM57株与其亲本光滑型M1981株的生物学特性 | 第29-43页 |
| 2.1 引言 | 第29页 |
| 2.2 材料与方法 | 第29-39页 |
| 2.2.1 菌株 | 第29页 |
| 2.2.2 主要试剂、耗材 | 第29-30页 |
| 2.2.3 主要仪器 | 第30页 |
| 2.2.4 布鲁氏菌吖啶黄实验 | 第30页 |
| 2.2.5 布鲁氏菌脂多糖银染实验 | 第30-31页 |
| 2.2.6 PCR检测布鲁氏菌脂多糖合成相关基因 | 第31-35页 |
| 2.2.7 荧光定量PCR检测脂多糖合成相关基因转录水平 | 第35-39页 |
| 2.3 结果 | 第39-42页 |
| 2.3.1 RM57株粗糙表型的鉴定结果 | 第39页 |
| 2.3.2 RM57株脂多糖完整性测定结果 | 第39-40页 |
| 2.3.3 RM57株脂多糖合成相关基因完整性检测结果 | 第40页 |
| 2.3.4 荧光定量PCR引物质量检测 | 第40-41页 |
| 2.3.5 荧光定量PCR方法目的产物测序 | 第41页 |
| 2.3.6 荧光定量PCR方法扩增曲线 | 第41-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-43页 |
| 第三章 粗糙型RM57株与亲本光滑型M1981株基因组数据挖掘 | 第43-59页 |
| 3.1 引言 | 第43页 |
| 3.2 材料与方法 | 第43-44页 |
| 3.2.1 菌株 | 第43页 |
| 3.2.2 主要试剂、耗材 | 第43页 |
| 3.2.3 主要仪器 | 第43-44页 |
| 3.2.4 布鲁氏菌的培养和基因组DNA的提取 | 第44页 |
| 3.2.5 上机测序 | 第44页 |
| 3.2.6 基因组的组装 | 第44页 |
| 3.2.7 PCR方法补缺口 | 第44页 |
| 3.2.8 生物信息学分析 | 第44页 |
| 3.3 结果 | 第44-57页 |
| 3.3.1 布鲁氏菌RM57株与M1981株全基因组测序与组装结果 | 第44页 |
| 3.3.2 布鲁氏菌RM57株与M1981株全基因组组分基本信息 | 第44-45页 |
| 3.3.3 布鲁氏菌RM57株与M1981株全基因组基因分析 | 第45-46页 |
| 3.3.4 布鲁氏菌RM57株与M1981株全基因组重复序列分析 | 第46页 |
| 3.3.5 布鲁氏菌RM57株与M1981株全基因组序列COG数据库注释 | 第46-48页 |
| 3.3.6 布鲁氏菌RM57株与M1981株病原宿主互作数据库(PHI)注释 | 第48-49页 |
| 3.3.7 布鲁氏菌RM57株与M1981株毒力因子数据库（VFDB）注释 | 第49-55页 |
| 3.3.8 布鲁氏菌RM57株与M1981株基因组共线性结构分析 | 第55-56页 |
| 3.3.9 布鲁氏菌RM57株与M1981株序列变异分析 | 第56-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-59页 |
| 第四章 结论与创新点 | 第59-60页 |
| 4.1 结论 | 第59页 |
| 4.2 创新点 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 作者简历 | 第66页 |
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