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芜菁花青素合成相关差异表达基因RNA-seq分析及EMS突变体鉴定
 
     论文目录
 
摘要第4-6页
Abstract第6-7页
1 绪论第12-25页
    1.1 引言第12页
    1.2 芜菁介绍第12-14页
    1.3 花青素合成与调控的研究进展第14-21页
        1.3.1 花青素的生物合成途径简介第14-17页
        1.3.2 表观遗传和环境因素影响花青素合成研究进展第17-19页
        1.3.3 UV-A诱导芜菁花青素合成特性第19-21页
    1.4 突变体库构建及花青素合成相关突变体研究进展第21-22页
    1.5 高通量测序技术研究进展第22-24页
    1.6 研究的目的及意义第24-25页
2 不同短波光诱导下津田芜菁差异表达基因的RNA-seq数据分析第25-42页
    2.1 引言第25页
    2.2 材料与方法第25-29页
        2.2.1 数据库第25页
        2.2.2 数据软件第25页
        2.2.3 实验光源第25-26页
        2.2.4 试验试剂及仪器第26页
        2.2.5 试验方法第26-29页
    2.3 结果与分析第29-39页
        2.3.1 不同短波光诱导下芜菁基因群表达模式分析第29-30页
        2.3.2 不同短波光诱导下芜菁差异表达基因挖掘第30-31页
        2.3.3 不同短波光诱导下芜菁差异表达基因的Gene Ontology (GO)富集分析第31-32页
        2.3.4 芜菁花青素合成途径、光信号途径和ROS途径相关基因的聚类分析第32-36页
        2.3.5 芜菁花青素合成途径及其共表达途径基因的表达分析第36-39页
    2.4 讨论第39-41页
    2.5 本章小结第41-42页
3 EMS诱变全紫色突变体R15的鉴定、遗传分析与基因定位第42-68页
    3.1 引言第42页
    3.2 材料与方法第42-45页
        3.2.1 试验材料第42页
        3.2.2 试验光源第42-43页
        3.2.3 试验试剂及仪器第43页
        3.2.4 试验方法第43-45页
    3.3 结果与分析第45-65页
        3.3.1 野生型津田芜菁与EMS诱变全紫色突变体R15的表型分析第45-46页
        3.3.2 HPLC比较分析野生型津田芜菁与EMS诱变全紫色突变体R15中花青素类化合物组成成分第46-48页
        3.3.3 EMS诱变全紫色突变体R15根表皮花青素合成途径相关基因的表达分析第48-49页
        3.3.4 EMS诱变全紫色突变体R15回交群体的构建及遗传分析第49-51页
        3.3.5 EMS诱变全紫色突变体R15的BC3F2群体中突变型后代和野生型亲本的DNA提取及高通量测序第51-52页
        3.3.6 高通量测序数据质量控制及数据分析第52-56页
        3.3.7 MutMap分析第56-61页
        3.3.8 突变候选基因注释第61-62页
        3.3.9 筛选鉴定的SNP突变位点的测序验证第62-64页
        3.3.10 比较分析突变基因PIP5K6在光照条件与黑暗条件下的表达变化第64页
        3.3.11 EMS全紫色突变体R15与不同来源的全白色突变体中PIP5K6基因表达比较分析第64-65页
    3.4 讨论第65-67页
    3.5 本章小结第67-68页
4 EMS诱变全白色突变体W68的鉴定、遗传分析与基因定位第68-89页
    4.1 引言第68页
    4.2 材料与方法第68-72页
        4.2.1 试验材料第68页
        4.2.2 试验光源第68页
        4.2.3 试验试剂及仪器第68-69页
        4.2.4 试验方法第69-72页
    4.3 结果与分析第72-87页
        4.3.1 野生型津田芜菁与EMS诱变全白色突变体W68的表型分析第72页
        4.3.2 TILLING方法筛选鉴定花青素合成途径相关基因的突变第72-74页
        4.3.3 EMS诱变全白色突变体W68回交群体的构建及遗传分析第74-75页
        4.3.4 EMS诱变全白色突变体W68根表皮花青素合成途径相关基因表达分析第75-77页
        4.3.5 EMS诱变全白色突变体W68的BC3F2群体中突变型后代和野生型亲本DNA提取和高通量测序第77-78页
        4.3.6 高通量测序数据质量控制及数据分析第78-81页
        4.3.7 MutMap分析第81-83页
        4.3.8 突变候选基因注释第83-84页
        4.3.9 候选SNP突变位点的测序验证第84-85页
        4.3.10 比较分析突变基因AAR2同源蛋白基因在野生型与突变体中的表达变化第85-86页
        4.3.11 W68与不同来源的突变体中AAR2同源蛋白基因的基因表达比较分析第86-87页
    4.4 讨论第87-88页
    4.5 本章小结第88-89页
结论第89-90页
参考文献第90-98页
附录第98-107页
攻读学位期间发表的学术论文第107-108页
致谢第108-110页
附件第110-111页

 
 
论文编号BS4011263,这篇论文共111
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