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基于De Bruijn图的宏基因组序列组装算法研究
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基于De Bruijn图的宏基因组序列组装算法研究
论文目录
摘要
第3-4页
ABSTRACT
第4-5页
第1章 绪论
第8-21页
1.1 研究背景及意义
第8-9页
1.2 宏基因组组装相关概念
第9-15页
1.2.1 DNA和RNA
第9页
1.2.2 基因、基因组和宏基因组
第9-10页
1.2.3 DNA测序
第10-12页
1.2.4 微生物群落
第12-13页
1.2.5 宏基因组学研究过程
第13页
1.2.6 宏基因组组装
第13-15页
1.3 宏基因组序列组装问题
第15-19页
1.3.1 归类
第15-17页
1.3.2 拼接
第17-19页
1.3.3 研究现状
第19页
1.4 论文主要研究内容
第19-20页
1.5 论文结构安排
第20-21页
第2章 CLUSTERH:基于DE BRUIJN图的宏基因组组装算法
第21-35页
2.1 问题及符号定义
第21-25页
2.2 组装方法
第25-30页
2.2.1 构建De Bruijn图
第27-29页
2.2.2 划分De Bruijn图
第29-30页
2.2.3 多序列比对
第30页
2.3 实验结果与分析
第30-34页
2.3.1 实验数据
第30-31页
2.3.2 性能分析指标
第31页
2.3.3 实验结果与分析
第31-34页
2.4 本章小结
第34-35页
第3章 CLUSTERH软件的设计与实现
第35-40页
3.1 CLUSTERH测试软件包的介绍
第35-39页
3.2 本章小结
第39-40页
第4章 结束语
第40-41页
4.1 总结
第40页
4.2 展望
第40-41页
参考文献
第41-44页
附录1
第44-45页
攻读硕士期间发表论文
第45-46页
致谢
第46-47页
论文编号
BS2854314
,这篇论文共
47
页
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