| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 序言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.紫菜的生物学特性 | 第12-15页 |
| 1.1 紫菜属分类地位与形态特征 | 第12页 |
| 1.2 紫菜的生活史 | 第12-15页 |
| 1.3 紫菜细胞发育生物学研究 | 第15页 |
| 2. 紫菜分子遗传学研究 | 第15-20页 |
| 2.1 DNA分子标记技术概述 | 第15-16页 |
| 2.2 核核糖体RNA基因（nrDNA） | 第16-20页 |
| 3. 本研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 3.1 研究内容 | 第20页 |
| 3.2 研究特色 | 第20页 |
| 3.3 研究意义 | 第20-21页 |
| 参考文献 | 第21-26页 |
| 第二章 条斑紫菜核糖体SSU和LSU RDNA全长序列及系统发育分析 | 第26-54页 |
| 1. 实验材料及仪器试剂 | 第26-28页 |
| 1.1 实验材料 | 第26页 |
| 1.2 实验仪器 | 第26-27页 |
| 1.3 实验试剂 | 第27-28页 |
| 2. 实验方法 | 第28-37页 |
| 2.1 条斑紫菜基因组DNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2 条斑紫菜单个叶片RNA的提取及基因组DNA的去除 | 第29-30页 |
| 2.3 cDNA的合成 | 第30-31页 |
| 2.4 cDNA的检测 | 第31-32页 |
| 2.5 引物和PCR | 第32-34页 |
| 2.6 目的片段的回收 | 第34-35页 |
| 2.7 PCR产物的克隆 | 第35-36页 |
| 2.8 质粒的抽提 | 第36页 |
| 2.9 阳性克隆的检测 | 第36-37页 |
| 2.10 序列生物信息学分析 | 第37页 |
| 3. 结果与分析 | 第37-49页 |
| 3.1 条斑紫菜叶状体基因组DNA和总RNA的提取 | 第37-39页 |
| 3.2 以混合叶状体及单个叶状体基因组DNA为模板的PCR扩增 | 第39-41页 |
| 3.3 cDNA的检测 | 第41页 |
| 3.4 以单个叶状体cDNA为模板的PCR扩增 | 第41-43页 |
| 3.5 序列生物信息学分析 | 第43-49页 |
| 4. 讨论 | 第49-51页 |
| 4.1 核糖体基因簇的同质性 | 第49页 |
| 4.2 条斑紫菜核糖体的多样性和同一性 | 第49-50页 |
| 4.3 SSU rDNA和LSU rDNA内含子分析 | 第50-51页 |
| 4.4 SSU rDNA和LSU rDNA序列分析 | 第51页 |
| 4.5 系统进化的研究 | 第51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 第三章 条斑紫菜核糖体DNA间隔区ITS和IGS序列及系统进化分析 | 第54-68页 |
| 1. 实验材料及试剂 | 第54页 |
| 2. 实验方法 | 第54-57页 |
| 2.1 条斑紫菜基因组DNA的提取 | 第54页 |
| 2.2 引物和PCR | 第54-56页 |
| 2.3 PCR产物的克隆及测序 | 第56-57页 |
| 2.4 序列生物信息学分析 | 第57页 |
| 3. 结果与分析 | 第57-64页 |
| 3.1 PCR扩增的ITS | 第57-58页 |
| 3.2 PCR扩增的IGS | 第58-59页 |
| 3.3 序列生物信息学分析 | 第59-64页 |
| 4. 讨论 | 第64-65页 |
| 4.1 ITS与IGS序列分析 | 第64-65页 |
| 4.2 系统进化研究 | 第65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 第四章 条斑紫菜不同地理群核糖体RNA基因及间隔区序列的分析研究 | 第68-79页 |
| 1. 实验材料及试剂 | 第68页 |
| 2. 实验方法 | 第68-70页 |
| 2.1 条斑紫菜基因组DNA的提取 | 第68页 |
| 2.2 引物和PCR | 第68-69页 |
| 2.3 PCR产物的克隆及测序 | 第69页 |
| 2.4 序列生物信息学分析 | 第69-70页 |
| 3. 结果与分析 | 第70-76页 |
| 3.1 PCR扩增的SSU rDNA | 第70-71页 |
| 3.2 PCR扩增的LSU rDNA | 第71-72页 |
| 3.3 PCR扩增的ITS | 第72-73页 |
| 3.4 PCR扩增的IGS上游重复序列区 | 第73页 |
| 3.5 序列生物信息学分析 | 第73-76页 |
| 4. 讨论 | 第76-78页 |
| 4.1 核糖体rDNA各部分结构及应用 | 第76-77页 |
| 4.2 条斑紫菜不同地理群 18S rDNA和 28S rDNA序列分析 | 第77页 |
| 4.3 条斑紫菜不同地理群ITS、IGS以及内含子序列分析 | 第77页 |
| 4.4 系统进化研究分析 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-79页 |
| 结论和创新点 | 第79-80页 |
| 攻读学位期间公开发表的论文 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
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