| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第10-14页 |
| 1.1.1 剪切和可变剪切 | 第10-12页 |
| 1.1.2 组蛋白修饰 | 第12-13页 |
| 1.1.3 组蛋白修饰与可变剪切 | 第13-14页 |
| 1.2 生物信息学数据库 | 第14-16页 |
| 1.2.1 NCBI数据库 | 第15页 |
| 1.2.2 ENCODE数据库 | 第15-16页 |
| 1.3 论文结构 | 第16页 |
| 1.4 本章总结 | 第16-17页 |
| 第二章 剪切位点和可变剪切事件的识别 | 第17-27页 |
| 2.1 数据来源及TopHat软件 | 第17页 |
| 2.1.1 数据来源 | 第17页 |
| 2.1.2 TopHat软件 | 第17页 |
| 2.2 剪切位点的识别 | 第17-20页 |
| 2.2.1 数据库构建流程 | 第17-18页 |
| 2.2.2 参数设置 | 第18页 |
| 2.2.3 结果 | 第18-19页 |
| 2.2.4 剪切位点精确度检验 | 第19-20页 |
| 2.2.5 识别已注释和未注释的剪切位点 | 第20页 |
| 2.3 可变剪切事件的识别 | 第20-25页 |
| 2.3.1 外显子跳跃事件的识别 | 第21-23页 |
| 2.3.2 可变供体剪切位点和可变受体剪切位点的识别 | 第23-25页 |
| 2.3.3 结果 | 第25页 |
| 2.4 讨论和小结 | 第25-27页 |
| 第三章 与可变剪切相关的组蛋白修饰分布 | 第27-51页 |
| 3.1 数据来源 | 第27页 |
| 3.2 可变剪切事件中特异剪切模式的识别 | 第27页 |
| 3.3 外显子跳跃事件特异剪切模式的识别 | 第27-35页 |
| 3.3.1 特定细胞系中外显子跳跃事件特异剪切模式的识别 | 第27-28页 |
| 3.3.2 不同细胞系共有外显子跳跃事件剪切模式的特异性 | 第28-29页 |
| 3.3.3 组蛋白修饰在外显子跳跃事件中的分布 | 第29-35页 |
| 3.4 可变供体剪切位点特异剪切模式的识别 | 第35-42页 |
| 3.4.1 特定细胞系中可变供体剪切位点特异剪切模式的识别 | 第35-37页 |
| 3.4.2 不同细胞系共有可变供体剪切位点事件剪切模式的特异性 | 第37页 |
| 3.4.3 组蛋白修饰在可变供体剪切位点事件中的分布 | 第37-42页 |
| 3.5 可变受体剪切位点特异剪切模式的识别 | 第42-49页 |
| 3.5.1 特定细胞系中可变受体剪切位点特异剪切模式的识别 | 第42-44页 |
| 3.5.2 不同细胞系共有可变受体剪切位点事件剪切模式的特异性 | 第44页 |
| 3.5.3 组蛋白修饰在可变受体剪切位点事件中的分布 | 第44-49页 |
| 3.6 讨论与小结 | 第49-51页 |
| 第四章 细胞系特异剪切模式分析 | 第51-55页 |
| 4.1 细胞系特异剪切模式基因GO分析 | 第51-53页 |
| 4.2 讨论与小结 | 第53-55页 |
| 第五章 总结与展望 | 第55-58页 |
| 5.1 全文总结 | 第55-56页 |
| 5.2 工作展望 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 作者攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录 | 第64页 |
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