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基于复杂上位性及其与环境互作效应QTLs的标记辅助选择方法研究
 
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英文摘要第8页
Chapter 1 INTRODUCTION: CONCEPT OF MARKER-ASSISTED SELECTION;IMPORTANCE OF EPISTASIS AND GENOTYPE×ENVIRONMENT INTERACTION; PURPOSE OF THIS RESEARCH第13-16页
Chapter 2 LITERATURE REVIEW: ADVANCES ON MARKER-ASSISTED SELECTION IN THE IMPROVEMENT OF QUANTITATIVE TRAITS第16-37页
    2.1 GENETIC MARKERS第16-19页
    2.2 FUNDAMENTALS OF MARKER-ASSISTED SELECTION第19-20页
    2.3 MARKER-ASSISTED BACKCROSSING第20-23页
    2.4 MARKER-ASSISTED INDEX SELECTION第23-26页
    2.5 MARKER-ASSISTED BEST LINEAR UNBIASED PREDICTION第26-29页
    2.6 GENOMIC SELECTION第29-31页
    2.7 PRACTICAL APPLICATIONS OF MARKER-ASSISTED SELECTION IN PLANT BREEDING第31-34页
    2.8 SYNERGY OF EMPIRICAL BREEDING, MARKER-ASSISTED SELECTION, AND GENOMICS IN THE IMPROVEMENT OF QUANTITATIVE TRAITS第34-37页
Chapter 3 A METHOD FOR MARKER-ASSISTED SELECTION BASED ON QTLS WITH EPISTATIC EFFECTS第37-56页
    3.1 INTRODUCTION第37-39页
    3.2 METHODS第39-41页
        3.2.1 Genetic model第39-40页
        3.2.2 Estimation of breeding value第40-41页
    3.3 SIMULATION第41-45页
        3.3.1 Genetic map第41-42页
        3.3.2 Generating phenotypic data第42-43页
        3.3.3 Effects of inaccurate parameter estimates on the genetic response to MAS第43-44页
        3.3.4 Selection第44-45页
    3.4 RESULTS第45-53页
        3.4.1 Genetic response to MAS with epistasis第45-50页
            3.4.1.1 Genetic response第45-46页
            3.4.1.2 Breeding value as a measure for selection第46-49页
            3.4.1.3 Genetic variance configurations第49-50页
        3.4.2 Effects of inaccurate estimates on the genetic response to MAS第50-53页
            3.4.2.1 QTL position第51页
            3.4.2.2 QTL effect第51页
            3.4.2.3 False positive QTL第51-53页
    3.5 DISCUSSION第53-56页
Chapter 4 IMPACTS OF QTL×ENVIRONMENT INTERACTIONS ON GENETIC RESPONSE TO MARKER-ASSISTED SELECTION第56-70页
    4.1 INTRODUCTION第56-58页
    4.2 METHODS第58-60页
        4.2.1 Genetic model第58-59页
        4.2.2 Estimation of breeding value第59-60页
    4.3 SIMULATION第60-63页
        4.3.1 Genetic map第60页
        4.3.2 Generating phenotypic data第60-62页
        4.3.3 Selection第62-63页
    4.4 RESULTS第63-67页
        4.4.1 Breeding experiments conducted in one location throughout第63-65页
        4.4.2 Breeding experiments conducted in two locations alternately第65-67页
    4.5 DISCUSSION第67-70页
Chapter 5 MARKER-ASSISTED SELECTION IN SEGREGATING GENERATIONS OF SELF-FERTILIZING CROPS第70-87页
    5.1 INTRODUCTION第70-72页
    5.2 METHODS第72-74页
        5.2.1 QTL genorype conditioned on its marker type and phenotype第72页
        5.2.2 Potential index第72-73页
        5.2.3 Marker index第73-74页
    5.3 SIMULATION第74-76页
        5.3.1 Selection methods第74-75页
        5.3.2 Outcomes of selection第75-76页
    5.4 RESULTS第76-83页
        5.4.1 Selection in early generations第76-78页
        5.4.2 Selection in later generations第78-80页
        5.4.3 Selection ir full generations第80-81页
        5.4.4 Efficiency or a modified method combining MAS in early generations with Phenotypic selection in later generations第81-83页
    5.5 DISCUSSION第83-87页
SUMMARY第87-90页
Appendix A DERIVATION OF AN APPROXIMATION FOR p(z_i|h_i)第90-95页
    A.1 ESTIMATING THE PROBABILITY OF QTL GENOTYPE CONDITIONED ON ITS FRANKING MARKER GENOTYPES p(z_i|h_(i_1),h_(i_2))第90-91页
    A.2 DEALING WITH DOUBLE HETEROZYGOTE第91-92页
    A.3 ESTIMATING OF THE FREQUENCIES OF QTL ALLELE第92-95页
Appendix B AN ALGORITHM TO CALCULATE MULTI-LOCUS GAMETE FREQUENCIES FOR SELF-FERTILIZATION第95-100页
REFERENCES第100-115页

 
 
论文编号BS2925552,这篇论文共115
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