摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
缩略词表(Abbreviation) | 第12-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-21页 |
1 葡萄孢属真菌 | 第13-14页 |
2 灰葡萄孢群体多样性 | 第14页 |
3 植物灰霉病的危害与流行 | 第14-15页 |
4 植物灰霉病的防治 | 第15-18页 |
4.1 综合防治 | 第16页 |
4.2 生物防治 | 第16-17页 |
4.3 化学防治 | 第17-18页 |
5 真菌病毒的研究进展 | 第18-19页 |
5.1 真菌病毒的分类 | 第18页 |
5.2 真菌病毒的传播 | 第18页 |
5.3 植物病原真菌的弱毒现象 | 第18-19页 |
5.4 葡萄孢属中真菌病毒研究 | 第19页 |
6 本课题的由来 | 第19-20页 |
7 本研究的目的和意义 | 第20-21页 |
第二章 灰葡萄孢HBstr-470生物学特性研究 | 第21-29页 |
1 试验材料 | 第21页 |
1.1 供试菌株和培养基 | 第21页 |
1.1.1 供试菌株 | 第21页 |
1.1.2 供试培养基 | 第21页 |
1.2 供试植物 | 第21页 |
1.3 其他试剂药品 | 第21页 |
2 试验方法 | 第21-23页 |
2.1 菌落形态的观察和菌丝生长速率的测定 | 第21-22页 |
2.2 分生孢子产量与大小的测定 | 第22页 |
2.3 分生孢子萌发率和芽管长度的测定 | 第22页 |
2.4 单菌落产孢动态观察 | 第22页 |
2.5 分生孢子致病力的测定 | 第22-23页 |
2.6 分生孢子竞争性致病力的测定 | 第23页 |
2.7 数据的统计方法 | 第23页 |
3 结果与分析 | 第23-28页 |
3.1 灰葡萄孢菌株HBstr-470的培养特性和弱致病性 | 第23-24页 |
3.2 灰葡萄孢菌株HBstr-470的分生孢子产量和大小 | 第24-25页 |
3.3 灰葡萄孢菌株HBstr-470的分生孢子萌发能力 | 第25页 |
3.4 灰葡萄孢菌HBstr-470单孢菌落的产孢动态 | 第25-26页 |
3.5 灰葡萄孢菌株HBstr-470分生孢子的致病力及竞争力 | 第26-28页 |
4 讨论 | 第28-29页 |
第三章 灰葡萄孢HBstr-470中真菌病毒的鉴定及生物学特性研究 | 第29-53页 |
1 实验材料 | 第29-31页 |
1.1 供试菌株和培养基 | 第29页 |
1.1.1 供试菌株 | 第29页 |
1.1.2 培养基 | 第29页 |
1.2 酶和试剂材料 | 第29-30页 |
1.3 供试植物 | 第30-31页 |
1.4 载体和引物 | 第31页 |
2 试验方法 | 第31-39页 |
2.1 灰葡萄孢菌丝培养及收集 | 第31页 |
2.2 灰葡萄孢HBstr-470中dsRNA的提取与纯化 | 第31-32页 |
2.3 大于3.0kb片段cDNA的克隆 | 第32-34页 |
2.3.1 病毒cDNA片段库的构建 | 第32-33页 |
2.3.2 大片段dsRNA中间部分序列的cDNA克隆 | 第33页 |
2.3.3 dsRNA末端cDNA序列的获取 | 第33-34页 |
2.4 小于3.0kb片段cDNA的克隆 | 第34-35页 |
2.5 目标cDNA片段的T载体连接转化 | 第35-36页 |
2.5.1 cDNA的A-Tailing及与T载体的连接 | 第35页 |
2.5.2 目标载体转化大肠杆菌感受态细胞 | 第35页 |
2.5.3 重组质粒的检测 | 第35-36页 |
2.6 Nortnern杂交 | 第36-37页 |
2.6.1 电泳、转膜及固定 | 第36页 |
2.6.2 GE探针的标记 | 第36-37页 |
2.6.3 预杂交与杂交 | 第37页 |
2.6.4 GE洗膜及CDP-star显色 | 第37页 |
2.7 灰葡萄孢HBstr-470中真菌病毒的垂直传播 | 第37-38页 |
2.8 平板对峙培养介导的病毒的水平传播 | 第38页 |
2.9 原生质体融合介导的病毒的水平传播 | 第38-39页 |
2.10 不同灰葡萄孢菌株遗传背景的RAPD分析 | 第39页 |
3 结果与分析 | 第39-51页 |
3.1 灰葡萄孢HBstr-470中dsRNA的检测及序列分析 | 第39-46页 |
3.1.1 SsHV2/HBstr-470的全长cDNA序列分析 | 第41-42页 |
3.1.2 BcHV1/HBstr-470的全长cDNA序列分析 | 第42页 |
3.1.3 BcVV1/HBstr-470的全长cDNA序列分析 | 第42-43页 |
3.1.4 BcRV2/HBstr-470的全长cDNA序列分析 | 第43-44页 |
3.1.5 BcPV2/HBstr-470的全长cDNA序列分析 | 第44-46页 |
3.2 灰葡萄孢HBstr-470中dsRNA的垂直传播 | 第46页 |
3.3 灰葡萄孢HBstr-470中dsRNA的水平传播 | 第46-51页 |
4 讨论 | 第51-53页 |
第四章 灰葡萄孢HBstr-470分生孢子形成阶段相关基因分析 | 第53-65页 |
1 试验材料 | 第53页 |
1.1 供试菌株和培养基 | 第53页 |
1.1.1 供试菌株 | 第53页 |
1.1.2 供试培养基 | 第53页 |
1.2 试剂材料 | 第53页 |
2 试验方法 | 第53-55页 |
2.1 样品收集 | 第53页 |
2.2 总RNA的提取 | 第53页 |
2.3 文库构建和Illumina测序 | 第53-54页 |
2.4 原始数据分析与参考序列比对 | 第54页 |
2.5 基因与转录本定量分析 | 第54页 |
2.6 差异表达基因筛选 | 第54-55页 |
3 结果与分析 | 第55-63页 |
3.1 RNA质量检测 | 第55页 |
3.2 测序质量评估 | 第55-57页 |
3.3 菌株HBstr-470产孢阶段转录组分析 | 第57-60页 |
3.3.1 菌株HBstr-470产孢阶段差异表达基因分析 | 第57-58页 |
3.3.2 菌株HBstr-470产孢阶段差异表达基因GO功能分析 | 第58-59页 |
3.3.3 菌株HBstr-470产孢阶段差异表达基因KEGG pathway富集分析 | 第59-60页 |
3.4 菌株HBstr-470和B05.10的比较转录组分析 | 第60-63页 |
3.4.1 差异表达基因的筛选 | 第60页 |
3.4.2 差异表达基因的GO功能注释 | 第60页 |
3.4.4 差异表达基因的聚类分析 | 第60-63页 |
4 讨论 | 第63-65页 |
第五章 总结与展望 | 第65-67页 |
参考文献 | 第67-78页 |
附录 1 PCR引物序列 | 第78-81页 |
附录 2 病毒名称和序列号 | 第81-83页 |
附录 3 病毒全长cDNA序列克隆模式图 | 第83-85页 |
致谢 | 第85页 |