摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-12页 |
1 前言 | 第12-39页 |
·DNA序列外的遗传和调控信息 | 第12-13页 |
·表观基因组 | 第12-13页 |
·表观调控与表观遗传 | 第13页 |
·基于染色质的表观调控和表观遗传 | 第13-32页 |
·染色质承载着遗传和调控信息 | 第13-14页 |
·DNA甲基化 | 第14-17页 |
·组蛋白、组蛋白变体和组蛋白修饰 | 第17-23页 |
·组蛋白的复制和遗传 | 第17-18页 |
·组蛋白变体与表观遗传调控 | 第18-19页 |
·组蛋白修饰 | 第19-23页 |
·非组蛋白染色质结合蛋白 | 第23-25页 |
·非编码RNA | 第25-26页 |
·染色质的空间构象 | 第26-30页 |
·表观基因组的重编程(Reprogramming) | 第30-31页 |
·表观基因组的变异与进化 | 第31-32页 |
·组蛋白甲基化与组蛋白去甲基化酶 | 第32-38页 |
·组蛋白甲基化 | 第32页 |
·组蛋白去甲基化酶 | 第32-36页 |
·组蛋白甲基化与DNA甲基化的相互作用 | 第36-38页 |
·本研究的目的与意义 | 第38-39页 |
2 材料与方法 | 第39-49页 |
·实验材料 | 第39-40页 |
·水稻材料和烟草材料 | 第39页 |
·菌株 | 第39页 |
·质粒 | 第39-40页 |
·抗体 | 第40页 |
·基因序列信息获取 | 第40页 |
·实验方法 | 第40-49页 |
·载体构建 | 第40页 |
·农杆菌介导的水稻遗传转化和烟草瞬时转化 | 第40-41页 |
·转基因材料中目的基因的表达水平分析 | 第41-42页 |
·蛋白质互作分析方法 | 第42-43页 |
·染色质特异位点的组蛋白修饰的分析方法 | 第43-44页 |
·DNA甲基化分析方法 | 第44-45页 |
·荧光免疫染色(Immuno-staining) | 第45-46页 |
·本研究的引物信息 | 第46-49页 |
3 结果与分析 | 第49-84页 |
·组蛋白去甲基化酶基因JMJ703的功能研究 | 第49-63页 |
·JMJ703是一个组蛋白H3K4去甲基化酶 | 第49-53页 |
·JMJ703参与调控细胞分裂 | 第53-57页 |
·JMJ703转基因材料的构建 | 第53页 |
·JMJ703的缺失影响水稻茎杆伸长 | 第53-57页 |
·JMJ703在基因诱导表达中的作用 | 第57-58页 |
·JMJ703与DNA甲基化 | 第58-60页 |
·JMJ703互作蛋白的研究 | 第60-61页 |
·JM J703抗体的制备及其染色质定位分析 | 第61-63页 |
·染色质修饰的相互作用及表观遗传记忆的研究 | 第63-84页 |
·一个愈伤组织特异表达的基因CXS | 第63页 |
·CXS的转录模式 | 第63页 |
·CXS的表达受顺式调控(cis-regulated) | 第63-67页 |
·CXS的表观修饰情况 | 第67-74页 |
·CXS受DNA甲基化调控 | 第67-70页 |
·small RNA不参与CXS的调控 | 第70页 |
·CXS转录起始位点H3K4三甲基化(H3K4me3)的富集 | 第70-72页 |
·组蛋白变体H2A.Z在调控CXS中的作用 | 第72页 |
·活跃表达的CXS位点染色质更松散 | 第72-74页 |
·CXS的表观遗传记忆 | 第74-77页 |
·CXS的DNA去甲基化状态可遗传给后代 | 第75-77页 |
·组蛋白H3K4me3的稳定遗传 | 第77页 |
·CXS调控因子的鉴定 | 第77-83页 |
·寻找CXS表达受抑制的材料 | 第77页 |
·组蛋白H3K27甲基转移酶CLF对CXS表达的调控 | 第77-79页 |
·染色质变构因子CHR729对CXS表达的调控 | 第79-80页 |
·组蛋白H3K4去甲基化酶基因JMJ703对CXS表达的调控 | 第80-82页 |
·JMJ703、CLF和CHR729对CXS的调控发生在细胞脱分化过程 | 第82-83页 |
·CXS的表观调控记忆模型 | 第83-84页 |
4 讨论 | 第84-94页 |
·JMJ703的组蛋白去甲基化活性 | 第84-86页 |
·JMJ蛋白功能的多样性 | 第86页 |
·JMJ703与DNA甲基化 | 第86-87页 |
·表观修饰和基因表达的重编程 | 第87-88页 |
·CXS离重编程 | 第87-88页 |
·重编程过程中染色质修饰因子的作用 | 第88页 |
·DNA甲基化与组蛋白H3K4me3的相互关系 | 第88-91页 |
·DNA去甲基化引起组蛋白H3K4me3上升 | 第90页 |
·H3K4me3去甲基化促进DNA甲基化 | 第90页 |
·DNA甲基化与H3K4me3的表观遗传 | 第90-91页 |
·DNA甲基化和组蛋白甲基化,基因表达的原因还是结果 | 第91页 |
·组蛋白变体在表观遗传中的作用 | 第91-92页 |
·进化中的表观遗传 | 第92页 |
·表观遗传研究展望 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-109页 |
附录 | 第109-117页 |
作者简介 | 第117-118页 |
致谢 | 第118页 |