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基因组上下文网络的构建及其在进化分析中的应用 |
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| 论文目录 |
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| 摘要 | 第1-7页 | | Abstract | 第7-13页 | | 绪论 | 第13-15页 | | 第一章 基因组上下文分析方法（Genome context methods） | 第15-23页 | | ·概述 | 第15页 | | ·同源基因（homologous gene） | 第15-17页 | | ·基因组上下文分析方法的理论基础 | 第17-20页 | | ·系统发生谱方法 | 第18页 | | ·基因邻居方法 | 第18-19页 | | ·基因融合方法 | 第19-20页 | | ·统计学的检验 | 第20-23页 | | ·系统发生谱方法 | 第20-21页 | | ·基因邻居方法 | 第21-22页 | | ·基因融合方法 | 第22-23页 | | 第二章 构建基因组上下文网络的工具 | 第23-29页 | | ·概述 | 第23页 | | ·程序概览 | 第23-24页 | | ·输入 | 第24页 | | ·输出 | 第24页 | | ·网络的计算 | 第24-27页 | | ·基因组上下文网络的展示和处理 | 第27页 | | ·实现 | 第27页 | | ·使用 | 第27-28页 | | ·本章小结 | 第28-29页 | | 第三章 基于基因关系网络的生命 | 第29-48页 | | ·概述 | 第29-31页 | | ·材料与方法 | 第31-35页 | | ·数据集的选取 | 第31页 | | ·确定直系同源基因 | 第31-32页 | | ·构建基因组上下文网络 | 第32页 | | ·一对网络间的距离度量 | 第32页 | | ·系统发育树推断和稳健性检验 | 第32-35页 | | ·模拟分析 | 第35页 | | ·比较Actinobacteria 和Firmicutes 中RNA 结构中双链茎部的GC 含量 | 第35页 | | ·结果与讨论 | 第35-42页 | | ·整个树的拓扑结构 | 第36-38页 | | ·细菌分枝 | 第38-41页 | | ·古细菌和真核分枝 | 第41-42页 | | ·针对我们策略的一些讨论 | 第42-47页 | | ·直系同源选取的标准 | 第42-43页 | | ·基因关系筛选用的p 值选取对结果影响不大 | 第43页 | | ·不同的网络预测方法对构建最终的系统发育树的贡献 | 第43-44页 | | ·Deuterostomia 基因组的大网络吸引效应 | 第44页 | | ·和其它系统发育组学方法的相比 | 第44-45页 | | ·网络的准确性和广度对系统发育树的影响 | 第45-47页 | | ·本章小结 | 第47-48页 | | 第四章总结与展望 | 第48-50页 | | ·总结 | 第48页 | | ·展望 | 第48-50页 | | ·强调群体生物学在进化研究中的重要性 | 第48-49页 | | ·生物体是个复杂系统，而不是基因的简单合集 | 第49-50页 | | 参考文献 | 第50-55页 | | 附录 | 第55-85页 | | 致谢 | 第85-86页 | | 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第86页 |
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论文编号BS534422，这篇论文共86页
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