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甘蓝型油菜种皮木质素合成相关基因的差异表达分析 |
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论文目录 |
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摘要 | 第7-9页 | Abstract | 第9-11页 | 第1章 文献综述 | 第12-22页 | 1.1 油菜的概述 | 第12-13页 | 1.1.1 油菜的起源与营养价值 | 第12页 | 1.1.2 油菜饼粕的利用价值 | 第12-13页 | 1.2 油菜种皮的结构与成分 | 第13-14页 | 1.3 植物木质素相关研究现状 | 第14-20页 | 1.3.1 木质素概况 | 第14页 | 1.3.2 木质素的结构 | 第14页 | 1.3.3 木质素合成途径中关键酶的研究进展 | 第14-18页 | 1.3.4 转录因子在木质素合成中的作用 | 第18-19页 | 1.3.5 植物激素在木质素合成中的作用 | 第19-20页 | 1.3.6 其他影响木质素合成的因素 | 第20页 | 1.4 转录组测序流程及在植物中的应用 | 第20-22页 | 第2章 绪论 | 第22-24页 | 2.1 本研究的目的与意义 | 第22页 | 2.2 研究内容 | 第22-23页 | 2.3 技术路线 | 第23-24页 | 第3章 材料与方法 | 第24-34页 | 3.1 试验材料 | 第24-26页 | 3.1.1 田间种植 | 第24页 | 3.1.2 油菜籽粒品质性状测定 | 第24页 | 3.1.3 油菜籽粒千粒重测定 | 第24页 | 3.1.4 油菜籽粒皮壳率测定 | 第24-25页 | 3.1.5 试验取材 | 第25页 | 3.1.6 油菜种皮厚度及染色显微观察 | 第25-26页 | 3.2 主要试剂与仪器 | 第26-27页 | 3.3 数据分析网站及软件 | 第27页 | 3.4 RNA提取与检测 | 第27-28页 | 3.4.1 RNA提取 | 第27-28页 | 3.4.2 RNA检测 | 第28页 | 3.5 转录组测序主要流程方法 | 第28-30页 | 3.5.1 测序流程 | 第29页 | 3.5.2 测序数据分析 | 第29-30页 | 3.6 差异表达基因(DEGs)的qRT-PCR验证 | 第30-34页 | 3.6.1 qRT-PCR引物设计 | 第30-31页 | 3.6.2 RNA反转录 | 第31-32页 | 3.6.3 qRT-PCR验证 | 第32-34页 | 第4章 结果与分析 | 第34-64页 | 4.1 种皮高/低木质素材料的筛选 | 第34-35页 | 4.2 高/低木质素材料种子性状分析 | 第35-36页 | 4.3 高/低木质素材料种子皮壳率分析 | 第36-37页 | 4.4 高/低木质素材料种皮厚度的显微观察 | 第37-38页 | 4.5 高/低木质素材料种皮中木质素染色观察 | 第38页 | 4.6 高/低木质素材料种皮和种胚不同发育时期的转录组分析 | 第38-64页 | 4.6.1 转录组测序概况 | 第38-40页 | 4.6.2 差异表达基因的筛选及统计 | 第40-41页 | 4.6.3 差异表达基因的功能注释 | 第41-42页 | 4.6.4 GO富集分析 | 第42-44页 | 4.6.5 TopGO富集分析 | 第44-45页 | 4.6.6 COG富集分析 | 第45-47页 | 4.6.7 KEGG代谢通路富集分析 | 第47-53页 | 4.6.8 编码植物激素合成相关基因表达分析 | 第53-56页 | 4.6.9 编码转录因子的差异表达基因分析 | 第56-60页 | 4.6.10 BnPAL、BnC4H和 Bn4CL表达分析 | 第60-63页 | 4.6.11 qRT-PCR验证 | 第63-64页 | 第5章 讨论及结论 | 第64-68页 | 5.1 讨论 | 第64-66页 | 5.1.1 木质素含量与种皮厚度的关系 | 第64页 | 5.1.2 转录因子对种皮木质素的影响 | 第64-65页 | 5.1.3 激素调节对种皮木质素的影响 | 第65页 | 5.1.4 种皮木质素与类黄酮生物合成过程之间的关系 | 第65-66页 | 5.2 结论 | 第66-68页 | 5.2.1 高/低木质素极端材料筛选及性状分析 | 第67页 | 5.2.2 高/低木质素极端材料的RNA-Seq分析 | 第67-68页 | 参考文献 | 第68-76页 | 附录 | 第76-80页 | 致谢 | 第80-82页 | 在校期间发表论文情况 | 第82页 |
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