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基于高通量测序的红花玉兰花青素苷合成途径研究
 
     论文目录
 
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
1. 引言第12-25页
    1.1. 红花玉兰研究基础第12-14页
    1.2. 植物花色的遗传生化基础第14-19页
        1.2.1. 植物花色的种类第14页
        1.2.2.花青素苷的生物合成第14-17页
        1.2.3. 花青素苷的遗传调控第17页
        1.2.4. RNA-seq在植物研究中的应用第17-19页
    1.3. 植物分子标记研究第19-22页
        1.3.1. SSR研究进展与应用第19-20页
        1.3.2. 基于高通量测序数据的EST-SSR开发第20-22页
    1.4. 研究思路第22-25页
        1.4.1. 研究目标第22-23页
        1.4.2. 研究内容第23页
        1.4.3. 技术路线第23-25页
2. 红花玉兰不同发育时期花青素苷成分及含量分析第25-38页
    2.1. 材料与方法第25-27页
        2.1.1. 材料处理第25页
        2.1.2. 总花青素和总黄酮提取第25页
        2.1.3. 总花青素及总黄酮含量测定第25-26页
        2.1.4. 花青素苷成分的定性分析第26页
        2.1.5. 红花玉兰花被片表皮细胞的显微观察第26-27页
    2.2. 结果与分析第27-37页
        2.2.1. 红花玉兰不同花发育阶段的花器官特征第27页
        2.2.2. 红花玉兰不同发育时期的花被片表皮细胞特征第27-28页
        2.2.3. 红花玉兰不同花发育阶段花被片花青素苷积累第28-30页
        2.2.4. 红花玉兰花青素苷定性分析第30-37页
    2.3. 小结第37-38页
3. 不同花发育时期红花玉兰转录组测序及关键基因筛选第38-63页
    3.1. 材料与方法第38-40页
        3.1.1. 材料采集及处理第38页
        3.1.2. cDNA文库构建及测序第38页
        3.1.3. 原始数据筛选第38页
        3.1.4. De novo序列组装第38页
        3.1.5. 功能注释第38-39页
        3.1.6. 差异表达基因分析第39-40页
        3.1.7. 差异表达基因趋势表达分析第40页
        3.1.8. 主成成分分析第40页
        3.1.9. 实时荧光定量第40页
    3.2. 结果与分析第40-61页
        3.2.1. 转录组序列组装结果分析第40-43页
        3.2.2. Unigene功能注释第43-46页
        3.2.3. Unigene高级注释结果第46-49页
        3.2.4. 转录组基因差异表达分析及关键基因的筛选第49-58页
        3.2.5. 花青素苷合成相关基因qRT-PCR验证第58-61页
    3.3. 小结第61-63页
4. 红花玉兰MwMYB1转录因子的克隆及功能分析第63-87页
    4.1. 材料与方法第63-66页
        4.1.1. 植物材料第63页
        4.1.2. RNA提取及cDNA合成第63页
        4.1.3. 基因克隆第63页
        4.1.4. 染色体步移启动子克隆第63-64页
        4.1.5. 生物信息学分析第64页
        4.1.6. 载体构建第64-65页
        4.1.7. 植物转基因第65页
        4.1.8. 亚细胞定位第65页
        4.1.9. 总花青素含量测定第65页
        4.1.10. 实时荧光定量PCR第65-66页
        4.1.11. 烟草光照处理第66页
        4.1.12. ABA处理第66页
    4.2. 结果与分析第66-85页
        4.2.1. MwMYB1 ORF的克隆及生物信息分析第66-69页
        4.2.2. MwMYB1启动子区域的生物信息学分析第69-70页
        4.2.3. MwMYB1的红花玉兰的表达模式分析第70-71页
        4.2.4. MwMYB1过表达转基因功能分析第71-82页
        4.2.5. MwMYB1启动子功能分析第82-83页
        4.2.6. DR5人工启动子调控MwMYB1功能研究第83-84页
        4.2.7. MwMYB1亚细胞定位结果第84-85页
        4.2.8. MwMYB1花青素调控通路预测第85页
    4.3. 小结第85-87页
5. 基于红花玉兰转录组数据的分子标记系统建立第87-104页
    5.1. 材料与方法第87-90页
        5.1.1. 红花玉兰品种材料第87页
        5.1.2. 红花玉兰品种花青素总量和总黄酮的提取和测定第87-88页
        5.1.3. DNA提取第88页
        5.1.4. EST-SSR发掘第88页
        5.1.5. EST-SSR引物设计第88页
        5.1.6. EST-SSR的PCR及毛细管电泳第88-89页
        5.1.7. SSR及SRAP引物筛选第89页
        5.1.8. SSR及SRAP的PCR程序及聚丙烯凝胶电泳第89页
        5.1.9. PCR结果的统计分析第89-90页
    5.2. 结果与分析第90-103页
        5.2.1. 红花玉兰EST-SSR的发掘及特性分析第90-94页
        5.2.2. 红花玉兰花青素合成相关EST-SSR的筛选和验证第94-100页
        5.2.3. 基于公共数据库的SSR和SRAP分子标记体系建立第100-103页
    5.3. 小结第103-104页
6. 结论与讨论第104-113页
    6.1. 主要结论第104-105页
    6.2. 讨论第105-111页
        6.2.1. 红花玉兰花青素苷合成积累规律第105-106页
        6.2.2. 红花玉兰花转录组数据库及功能注释的评价第106-107页
        6.2.3. 红花玉兰花青素苷合成关键基因发掘第107-108页
        6.2.4. 红花玉兰MwMYB1的基因功能第108-109页
        6.2.5. 红花玉兰分子标记体系第109-111页
    6.3. 创新点第111页
    6.4. 展望第111-113页
7. 附录第113-121页
参考文献第121-131页
个人简介第131-132页
导师简介第132-134页
获得成果目录第134-135页
致谢第135-136页

 
 
论文编号BS4398625,这篇论文共136
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