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谷氨酸棒状杆菌集成细胞网络的构建与分析 |
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| 论文目录 |
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| 摘要 | 第1-6页 | | ABSTRACT | 第6-9页 | | 1 前言 | 第9-23页 | | ·研究背景 | 第9-20页 | | ·系统生物学的诞生与发展 | 第9-10页 | | ·生物网络的研究动态 | 第10-14页 | | ·生物网络的数学模型 | 第14-19页 | | ·模型的比较 | 第19-20页 | | ·选题背景 | 第20-21页 | | ·研究目的和意义 | 第21-22页 | | ·研究内容和创新点 | 第22-23页 | | 2 材料与方法 | 第23-30页 | | ·图论基本概念及参数 | 第23-25页 | | ·连接度 | 第23页 | | ·连接度的分布 | 第23-24页 | | ·路径长度 | 第24页 | | ·连通体 | 第24页 | | ·聚类系数 | 第24-25页 | | ·紧密度中心性 | 第25页 | | ·介数中心性 | 第25页 | | ·基因转录调控网络的构建 | 第25-26页 | | ·TRN数据的采集与处理 | 第25-26页 | | ·TRN的分层分解 | 第26页 | | ·GSMN分析 | 第26-29页 | | ·数据采集 | 第26-27页 | | ·反应方向的重新定义 | 第27页 | | ·反应对的拆分 | 第27-28页 | | ·特殊反应对的删除 | 第28-29页 | | ·GSMN的bow-tie结构 | 第29页 | | ·细胞网络的集成 | 第29页 | | ·赖氨酸代谢调控子网络的提出 | 第29-30页 | | 3 结果与讨论 | 第30-52页 | | ·谷氨酸棒状杆菌TRN数据库的构建 | 第30-34页 | | ·谷氨酸棒状杆菌TRN的分析 | 第34-40页 | | ·TRN连接度分布 | 第34-35页 | | ·TRN的功能模块分析 | 第35-37页 | | ·全局调节子的重新定义 | 第37-39页 | | ·TRN的分层分解 | 第39-40页 | | ·谷氨酸棒状杆菌GSMN数据库的构建 | 第40-45页 | | ·GSMN分析 | 第45-48页 | | ·GSMN模型 | 第45-46页 | | ·Bow-tie结构 | 第46页 | | ·GSC的分解 | 第46-47页 | | ·GSC的中心性分析 | 第47-48页 | | ·集成细胞网络的构建与分析 | 第48-50页 | | ·L-赖氨酸代谢调控子网络的提取 | 第50-52页 | | 4 结论 | 第52-54页 | | 5 展望 | 第54-55页 | | 6 参考文献 | 第55-62页 | | 7 论文发表情况 | 第62-63页 | | 8 致谢 | 第63-64页 | | 附录1 VBA生成Pajek文件 | 第64-66页 | | 附录2 提取代谢反应的perl程序 | 第66-69页 | | 附录3 Pajek转化成Excel文件 | 第69页 |
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论文编号BS2129376，这篇论文共69页
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