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药用植物金银花及药用真菌蝙蝠蛾拟青霉的转录组学研究 |
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论文目录 |
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致谢 | 第1-6页 | 摘要 | 第6-8页 | ABSTRACT | 第8-10页 | 专业词汇中英文对照表 | 第10-14页 | 图目录 | 第14-16页 | 表目录 | 第16-17页 | 1 引言 | 第17-38页 | ·新一代测序技术 | 第17-23页 | ·新一代测序技术发展 | 第17-18页 | ·基于新一代测序技术的测序仪 | 第18-23页 | ·基于新一代测序技术的转录组学研究 | 第23-38页 | ·有参考基因组序列的转录组学研究 | 第25-30页 | ·数据的质量控制 | 第26-27页 | ·测序数据的比对 | 第27-28页 | ·基因的表达量分析 | 第28-29页 | ·差异表达基因注释 | 第29-30页 | ·无参考基因组序列的转录组学研究手段 | 第30-38页 | ·转录组的从头组装 | 第31-38页 | 2 金银花转录组学研究 | 第38-81页 | ·概述 | 第38-41页 | ·金银花介绍 | 第38页 | ·金银花化学成分研究 | 第38-39页 | ·影响金银花化学成分变化的因素 | 第39-40页 | ·红白金银花的研究进展 | 第40-41页 | ·材料与方法 | 第41-50页 | ·实验材料 | 第41-42页 | ·试剂与仪器 | 第42-43页 | ·主要试剂 | 第42页 | ·主要试剂盒 | 第42页 | ·主要仪器 | 第42-43页 | ·金银花化学成分含量测定 | 第43页 | ·文库构建和测序 | 第43-47页 | ·RNA提取 | 第43-44页 | ·RNA分离 | 第44-45页 | ·mRNA纯化及片段化处理 | 第45页 | ·cDNA合成 | 第45-46页 | ·加入PolyA及测序接头 | 第46页 | ·PCR富集 | 第46-47页 | ·上机测序 | 第47页 | ·生物信息学分析方法 | 第47-50页 | ·测序数据质量评估 | 第48页 | ·测序数据过滤 | 第48-49页 | ·转录组De novo组装 | 第49页 | ·转录组功能注释 | 第49页 | ·转录组表达量分析 | 第49-50页 | ·结果与讨论 | 第50-79页 | ·化学含量测定 | 第50-52页 | ·金银花转录组测序数据处理 | 第52-53页 | ·转录组组装结果及统计 | 第53-56页 | ·转录组组装结果的功能注释 | 第56-66页 | ·金银花转录组表达量分析 | 第66-79页 | ·金银花转录组样本间基因表达量差异分析 | 第66-68页 | ·黄色金银花不同时期样本的基因表达量分析 | 第68-71页 | ·不同品种金银花花蕾期表达量分析 | 第71-72页 | ·差异表达基因与主要代谢通路之间的关系 | 第72-79页 | ·主要代谢通路关键酶的基因家族分析 | 第79页 | ·小结 | 第79-81页 | 3 蝙蝠蛾拟青霉转录组学研究 | 第81-97页 | ·概述 | 第81-83页 | ·冬虫夏草介绍 | 第81页 | ·蝙蝠蛾拟青霉与冬虫夏草与关系 | 第81页 | ·主要化学成分 | 第81-82页 | ·药用真菌组学研究现状 | 第82-83页 | ·材料与方法 | 第83页 | ·实验材料 | 第83页 | ·试剂与仪器 | 第83页 | ·化学含量测定 | 第83页 | ·文库构建和测序 | 第83页 | ·生物信息学分析方法 | 第83页 | ·结果与讨论 | 第83-95页 | ·化学含量测定 | 第83-84页 | ·蝙蝠蛾拟青霉转录组测序数据处理 | 第84-86页 | ·转录组组装结果及统计 | 第86-87页 | ·转录组组装结果的功能注释 | 第87-92页 | ·蝙蝠蛾拟青霉转录组表达量分析 | 第92-95页 | ·小结 | 第95-97页 | 4 总结与展望 | 第97-99页 | 参考文献 | 第99-112页 | 附录A | 第112-120页 | 附录B | 第120-124页 | 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第124页 |
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