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利用半随机抽样模型进行蛋白质概率计算方法的评估等质谱信息学研究 |
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| 摘要 | 第1-8页 | | Abstract | 第8-10页 | | 缩略词对照表 | 第10-11页 | | 前言 | 第11-17页 | | 第一章.利用半随机抽样模型进行蛋白质概率计算方法评估 | 第17-46页 | | 1 概述 | 第17-19页 | | ·鸟枪法蛋白质组学技术 | 第17页 | | ·数据库搜索 | 第17-18页 | | ·鉴定肽段的可靠性研究 | 第18页 | | ·鉴定蛋白质的可靠性研究 | 第18-19页 | | ·蛋白质概率计算方法及其影响因素评估 | 第19页 | | 2 材料与方法 | 第19-28页 | | ·材料 | 第19-20页 | | ·方法 | 第20-25页 | | ·数据库搜索 | 第20-21页 | | ·模型所用的各参数设置 | 第21-25页 | | ·半随机抽样模型 | 第25-28页 | | 3 结果 | 第28-41页 | | ·半随机抽样模型的检验 | 第28-30页 | | ·影响蛋白质鉴定可靠性概率估算结果的因素 | 第30-33页 | | ·数据集大小 | 第30-31页 | | ·数据库大小 | 第31-32页 | | ·高丰度蛋白质的去除 | 第32-33页 | | ·不同蛋白质鉴定概率估算方法的评估 | 第33-41页 | | ·ProteinProphet方法的评估 | 第33-35页 | | ·PROT_PROBE方法的评估 | 第35-38页 | | ·卡双肽段方法的评估 | 第38页 | | ·泊松模型的评估 | 第38-41页 | | 4 讨论 | 第41-46页 | | 第二章.无标记蛋白质定量研究 | 第46-59页 | | 1 概述 | 第46-50页 | | ·基于鉴定蛋白质的肽段数的定量方法 | 第46-49页 | | ·肽段序列覆盖率模型 | 第47页 | | ·肽段计数或肽段采样数模型 | 第47页 | | ·SpS模型和PMSS模型 | 第47-48页 | | ·PAI和emPAI模型 | 第48-49页 | | ·基于质谱峰强度的定量方法 | 第49页 | | ·两类无标记定量方法的比较 | 第49页 | | ·多个蛋白质共有肽段的问题及其对无标记定量方法的影响 | 第49-50页 | | 2 材料与方法 | 第50-52页 | | ·材料 | 第50页 | | ·方法 | 第50-52页 | | ·数据预处理 | 第50页 | | ·EM算法 | 第50-52页 | | 3 结果 | 第52-55页 | | ·SpS、PAI和emPAI模型的EM校正 | 第52-55页 | | ·SpS、PAI及emPAI模型之间的比较 | 第55页 | | 4 讨论 | 第55-59页 | | 第三章.自动批量提交数据进行Mascot搜索的软件实现 | 第59-66页 | | 1 概述 | 第59-61页 | | ·Mascot搜索软件 | 第59-60页 | | ·Mascot Daemon软件 | 第60页 | | ·Perl／Tk语言 | 第60-61页 | | ·AutoMascot | 第61页 | | 2 AutoMascot的主要功能 | 第61-64页 | | ·参数编辑器模块 | 第62页 | | ·任务提交模块 | 第62-63页 | | ·结果处理与保存模块 | 第63-64页 | | 3 AutoMascot软件的特色 | 第64-66页 | | 全文总结 | 第66-67页 | | 附录1.用标准蛋白数据验证模型稳定性的重复结果 | 第67-68页 | | 附录2.Perl／Tk常用窗口部件程序 | 第68-69页 | | 致谢 | 第69-70页 | | 在读期间发表的论文列表 | 第70-71页 | | 在读期间发表论文全文 | 第71-72页 | | 综述 | 第72-104页 |
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论文编号BS1279177，这篇论文共104页
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