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当前位置:教育论文中心首页--硕士论文--陆地棉矮秆突变体的转录组和小RNA测序分析
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陆地棉矮秆突变体的转录组和小RNA测序分析
 
     论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-10页
縮略语表第10-11页
1 前言第11-22页
   ·作物矮化研究的意义及现状第11-12页
   ·矮化与植物激素的关系第12-18页
     ·赤霉素与植物矮化的关系第12-14页
     ·油菜素内酯与植物矮化的关系第14页
     ·生长素与植物矮化的关系第14-15页
     ·其它激素与植物矮化的关系第15-16页
     ·各激素间的调控关系第16页
     ·MicroRNA与植物激素调控的研究进展第16-18页
   ·新一代高通量测序技术第18-21页
     ·转录组测序第18-20页
     ·小分子RNA测序第20-21页
   ·本研究的目的和意义第21-22页
2 实验材料和方法第22-33页
   ·实验仪器和试剂第22页
   ·棉花材料第22页
   ·总RNA的提取及检测第22-23页
   ·转录组测序第23-25页
     ·文库构建和Solexa测序第23页
     ·数据处理和De novo拼接第23-24页
     ·Unigene在公共数据库中的注释第24页
     ·表达丰度计算及差异表达分析第24-25页
     ·差异基因GO注释和KEGG富集分析第25页
   ·小RNA测序第25-27页
     ·小分子RNA文库构建和测序第25-26页
     ·测序原始数据预处理第26页
     ·保守的和新的miRNA识别及其靶基因预测第26-27页
     ·MiRNA差异表达分析及靶基因注释和功能富集第27页
   ·实时荧光定量PCR法验证测序结果第27-33页
     ·转录组测序获得的矮秆相关基因的qRT-PCR验证第27-30页
     ·MiRNA及靶基因qRT-PCR检测第30-33页
3 结果与分析第33-52页
   ·矮秆、高秆突变体及其野生型的株高表型第33-34页
   ·矮秆相关基因的筛选及QRT-PCR验证第34-41页
     ·转录组测序质量概况第34-35页
     ·Unigene的注释第35-36页
     ·差异表达基因分析及矮秆相关基因的筛选第36-37页
     ·矮秆相关基因的GO分类及KEGG富集分析第37-39页
     ·矮秆相关差异表达基因的qRT-PCR验证第39-41页
   ·矮秆突变体相关MIRNA分析及靶基因验证第41-52页
     ·小RNA测序质量分析第41-42页
     ·保守miRNA分析第42-43页
     ·保守miRNA靶基因预测第43-44页
     ·保守miRNA的差异表达分析第44-47页
     ·在2个突变体中特异表达的miRNA第47-48页
     ·两个突变体差异表达miRNA靶基因在棉花A、D基因组中的注释第48页
     ·新的miRNA预测及分析第48-50页
     ·MiRNA及靶基因的荧光定量验证第50-52页
4 讨论第52-57页
   ·棉花矮化突变体在赤霉素和生长素信号途径的变异第52-53页
   ·MIRNA对ARI1327矮化的调控作用第53-55页
   ·转录组和小RNA测序的联合分析第55-57页
参考文献第57-65页
附录第65-82页
在读期间发表的论文第82-83页
致谢第83页

 
 
论文编号BS2180678,这篇论文共83
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