| 摘要 | 第7-9页 |
| 英文摘要 | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| §1.1 生物信息学研究背景介绍 | 第11-12页 |
| §1.2 生物信息学研究对象 | 第12-15页 |
| §1.3 生物信息学研究内容 | 第15-16页 |
| §1.4 本文的主要工作 | 第16-19页 |
| 第二章 生物序列的相似性比较 | 第19-31页 |
| §2.1 引言 | 第19页 |
| §2.2 生物序列的比较 | 第19-31页 |
| §2.2.1 序列比对方法(Sequence Alignment) | 第19-21页 |
| §2.2.2 非序列比对方法(Free Sequence Alignment) | 第21-31页 |
| 第三章 DNA序列的CGR图形表示模型 | 第31-43页 |
| §3.1 引言 | 第31-32页 |
| §3.2 CGR简介 | 第32-36页 |
| §3.2.1 混沌游戏(The Chaos Game)介绍 | 第32-33页 |
| §3.2.2 DNA序列的混沌游走表达(Chaos Game Representation) | 第33-34页 |
| §3.2.3 改进的CGR空间 | 第34-35页 |
| §3.2.4 CGR游走数值序列 | 第35-36页 |
| §3.3 DNA序列的数值特征 | 第36-38页 |
| §3.4 九个不同物种的β-基因外显子序列的相似性分析 | 第38-41页 |
| §3.4.1 相似性分析 | 第38-39页 |
| §3.4.2 与其他结果对比 | 第39-41页 |
| §3.5 总结和讨论 | 第41-43页 |
| 第四章 基于DV-Curve表达的蛋白质序列分析和应用 | 第43-57页 |
| §4.1 引言 | 第43页 |
| §4.2 蛋白质序列的DV-Curve表达 | 第43-47页 |
| §4.2.1 蛋白质序列分类 | 第43-45页 |
| §4.2.2 蛋白质序列的图形表达 | 第45-47页 |
| §4.3 蛋白质序列的数值特征 | 第47-48页 |
| §4.4 应用 | 第48-57页 |
| §4.4.1 基于蛋白质DV-Curve直观图形的相似性分析 | 第48-52页 |
| §4.4.2 基于冠状病毒的系统发育树分析 | 第52-57页 |
| 第五章 基于k-tuple分布的DNA序列的概率模型 | 第57-77页 |
| §5.1 引言 | 第57-58页 |
| §5.2 模型建立 | 第58-62页 |
| §5.2.1 基本概念和背景介绍 | 第58-59页 |
| §5.2.2 构建特征向量 | 第59-60页 |
| §5.2.3 度量方法 | 第60-62页 |
| §5.3 结果讨论 | 第62-72页 |
| §5.3.1 进化树构建 | 第62-71页 |
| §5.3.2 背景分析 | 第71-72页 |
| §5.4 结束语 | 第72-77页 |
| 参考文献 | 第77-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 攻读博士学位期间完成论文情况 | 第87-88页 |
| 附件 | 第88页 |
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