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格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的筛选、基因组比较及安全性评价
 
     论文目录
 
摘要第3-4页
Abstract第4-5页
缩略符号对照表第8-9页
1 绪论第9-14页
    1.1 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌第9-10页
        1.1.1 格氏乳杆菌基本特征及应用第9页
        1.1.2 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的分离与鉴定第9-10页
    1.2 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的基因组比较第10-11页
    1.3 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌安全性评价第11-12页
    1.4 研究的主要内容及意义第12-14页
        1.4.1 立题意义第12页
        1.4.2 研究的主要内容第12-14页
2 材料与方法第14-19页
    2.1 实验材料第14-15页
        2.1.1 实验样品第14页
        2.1.2 实验试剂与培养基第14-15页
        2.1.3 主要仪器和设备第15页
    2.2 实验方法第15-19页
        2.2.1 菌株分离与鉴定第15-16页
        2.2.2 菌株测序第16页
        2.2.3 基因组序列组装及结构预测第16页
        2.2.4 ANI分析及系统发育树构建第16页
        2.2.5 基因组基本信息预测第16-17页
        2.2.6 核心基因组和泛基因组构建第17页
        2.2.7 碳水化合物活性酶分析第17页
        2.2.8 菌株细菌素操纵子分析第17页
        2.2.9 CRISPR-Cas系统分析第17页
        2.2.10 前噬菌体预测第17页
        2.2.11 毒力基因预测第17页
        2.2.12 耐药基因预测第17-18页
        2.2.13 菌株抗生素耐药性评估第18-19页
3 结果分析与讨论第19-46页
    3.1 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的分离鉴定第19-24页
        3.1.1 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的筛选及初步鉴定第19页
        3.1.2 根据ANI初步确认格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌第19-20页
        3.1.3 根据系统发育分析最终确认格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌第20-24页
    3.2 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌比较基因组第24-38页
        3.2.1 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌基因组一般特征第24-25页
        3.2.2 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌核心基因组与泛基因组第25-29页
        3.2.3 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌碳水化合物活性酶系统第29-31页
        3.2.4 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌细菌素操纵子第31-35页
        3.2.5 格氏乳杆菌和副格氏乳杆菌的CRISPR-Cas系统第35-38页
    3.3 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的安全性评估第38-46页
        3.3.1 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的前噬菌体第38-41页
        3.3.2 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的毒力基因第41-42页
        3.3.3 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌的耐药基因第42-43页
        3.3.4 格氏乳杆菌与副格氏乳杆菌菌株抗生素耐药性表型第43-46页
主要结论和展望第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-56页
附录Ⅰ:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第56-57页
附录Ⅱ:副格氏乳杆菌与格氏菌株基本信息第57-63页
附录Ⅲ:副格氏乳杆菌与格氏乳杆菌中CRISPR位点第63-67页
附录Ⅳ:副格氏乳杆菌与格氏乳杆菌对十三种抗生素的最低抑菌浓度检测结果第67-72页

 
 
论文编号BS4308679,这篇论文共72
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