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蛋白质与配体相互作用机理的分子模拟研究 |
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| 论文目录 |
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| 摘要 | 第1-9页 | | Abstract | 第9-17页 | | 第1章 绪 论 | 第17-33页 | | ·蛋白质与配体相互作用研究的意义及内容 | 第18-20页 | | ·研究意义 | 第18-19页 | | ·研究内容及方法 | 第19-20页 | | ·周质结合蛋白的研究意义及进展 | 第20-24页 | | ·周质结合蛋白的研究意义 | 第20-21页 | | ·周质结合蛋白的研究进展 | 第21-24页 | | ·HIV-1 整合酶的研究意义及进展 | 第24-33页 | | ·HIV-1 整合酶的研究意义 | 第24-28页 | | ·整合酶的结构与功能 | 第28-30页 | | ·整合酶的研究进展 | 第30-33页 | | 第2章 研究方法 | 第33-55页 | | ·分子动力学模拟 | 第33-44页 | | ·分子动力学模拟的基本原理 | 第33-40页 | | ·分子动力学模拟的基本步骤 | 第40-41页 | | ·拉伸分子动力学模拟简介 | 第41-43页 | | ·常用分子动力学模拟软件简介 | 第43-44页 | | ·分子对接 | 第44-55页 | | ·分子对接的基本原理 | 第44-45页 | | ·搜索算法 | 第45-50页 | | ·打分函数 | 第50-51页 | | ·常用分子对接软件简介 | 第51-55页 | | 第3章 维生素B_(12)周质结合蛋白BtuF 工作机理的分子模拟研究 | 第55-71页 | | ·研究背景及意义 | 第55-57页 | | ·材料与方法 | 第57-61页 | | ·分子动力学模拟 | 第57-59页 | | ·拉伸分子动力学模拟 | 第59-60页 | | ·主成分分析 | 第60-61页 | | ·结果与讨论 | 第61-69页 | | ·构建平均力势的合理性分析 | 第61-62页 | | ·B_(12) 解离过程的自由能分析 | 第62-64页 | | ·BtuF 在复合物状态下的运动模式 | 第64-66页 | | ·BtuF 的柔性分析 | 第66-69页 | | ·本章小结 | 第69-71页 | | 第4章 亚铁血红素周质结合蛋白ShuT 和PhuT 工作机理的分子模拟研究 | 第71-89页 | | ·研究背景及意义 | 第71-72页 | | ·材料与方法 | 第72-75页 | | ·分子动力学模拟 | 第72-74页 | | ·区域性运动分析 | 第74页 | | ·高斯网络模型 | 第74页 | | ·主成分分析 | 第74-75页 | | ·结果与讨论 | 第75-86页 | | ·ShuT 和PhuT 的整体构象变化 | 第75-77页 | | ·ShuT 和PhuT 的区域性运动 | 第77-79页 | | ·ShuT 和PhuT 的铰链区分析 | 第79-82页 | | ·ShuT 和PhuT 的运动模式 | 第82-84页 | | ·ShuT 和PhuT 的柔性分析 | 第84-86页 | | ·本章小结 | 第86-89页 | | 第5章 HIV-1 整合酶与香豆素类抑制剂NSC158393 的结合模式及其抑制机理的分子模拟研究 | 第89-103页 | | ·研究背景及意义 | 第89-91页 | | ·材料与方法 | 第91-93页 | | ·体系准备 | 第91-92页 | | ·分子动力学模拟 | 第92页 | | ·多构象分子对接 | 第92-93页 | | ·MM-GBSA 能量分解 | 第93页 | | ·结果与讨论 | 第93-101页 | | ·自由态IN 的MD 模拟 | 第93-95页 | | ·NSC158393 与IN 的结合模式预测 | 第95-98页 | | ·IN 与NSC158393 复合物的MD 模拟 | 第98-100页 | | ·能量分解 | 第100-101页 | | ·本章小结 | 第101-103页 | | 第6章 HIV-1 整合酶与DNA 复合物的构建及其与二酮酸类抑制剂结合模式的分子模拟研究 | 第103-113页 | | ·研究背景及意义 | 第103-104页 | | ·材料与方法 | 第104-108页 | | ·IN-DNA 复合物模型的构建 | 第104-105页 | | ·分子动力学模拟 | 第105-106页 | | ·拉伸分子动力学模拟 | 第106-107页 | | ·分子对接 | 第107-108页 | | ·结果与讨论 | 第108-112页 | | ·IN-DNA 复合物的MD 模拟 | 第108页 | | ·用SMD 模拟修正IN-DNA 复合物模型 | 第108-110页 | | ·结合模式分析 | 第110-112页 | | ·本章小结 | 第112-113页 | | 第7章 结论与展望 | 第113-117页 | | ·论文工作结论 | 第113-115页 | | ·论文创新点 | 第115页 | | ·展望 | 第115-117页 | | 参考文献 | 第117-131页 | | 附录 | 第131-137页 | | 攻读博士学位期间所发表的学术论文 | 第137-139页 | | 致谢 | 第139页 |
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论文编号BS825353，这篇论文共139页
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