| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第14-23页 |
| 1.1 红树林生态系统及其适应性 | 第14-15页 |
| 1.2 红树植物的胎生现象 | 第15-19页 |
| 1.2.1 胎生的定义及类群 | 第15页 |
| 1.2.2 胎生发育过程的生理生化水平研究 | 第15-18页 |
| 1.2.2.1 含水量 | 第15-16页 |
| 1.2.2.2 发育过程的盐度动态及推论 | 第16页 |
| 1.2.2.3 胎生发育过程中激素的动态特征 | 第16-17页 |
| 1.2.2.4 胚胎发育过程中繁殖体的能量热值变化 | 第17-18页 |
| 1.2.3 红树植物胎生发育的生态学意义 | 第18-19页 |
| 1.3 红树植物胎生发育的机理及不足之处 | 第19-20页 |
| 1.4 转录组测序技术在植物发育研究中的应用 | 第20-22页 |
| 1.4.1 基于高通量测序技术的转录组测序 | 第20页 |
| 1.4.2 转录组测序技术在植物生长发育方面的研究 | 第20-22页 |
| 1.5 本研究的内容和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 红树植物秋茄胎生发育过程的形态、解剖学观察 | 第23-38页 |
| 2.1 前言 | 第23-24页 |
| 2.2 材料与方法 | 第24-27页 |
| 2.2.1 采样地点介绍 | 第24页 |
| 2.2.2 样品采集 | 第24-25页 |
| 2.2.3 石蜡切片方法介绍 | 第25-26页 |
| 2.2.3.1 实验药品 | 第25页 |
| 2.2.3.2 实验步骤 | 第25-26页 |
| 2.2.4 立体式解剖镜观察 | 第26-27页 |
| 2.3 结果 | 第27-33页 |
| 2.3.1 秋茄发育过程关键阶段 | 第27-29页 |
| 2.3.2 秋茄胎生发育过程形态观察结果 | 第29-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-38页 |
| 2.4.1 秋茄与其他显胎生红树植物胚胎发育对比的异同点 | 第33-35页 |
| 2.4.2 秋茄与其他隐胎生、非胎生红树植物发育过程的对比 | 第35-36页 |
| 2.4.2.1 隐胎生植物及非胎生红树植物的胚胎发育及萌发过程 | 第35-36页 |
| 2.4.2.2 显、隐、非胎生之间的比较 | 第36页 |
| 2.4.3 红树植物胎生现象与正常性种子萌发的比较 | 第36-38页 |
| 第三章 秋茄胎生发育过程转录组研究 | 第38-85页 |
| 3.1 前言 | 第38-39页 |
| 3.2 材料与方法 | 第39-46页 |
| 3.2.1 样品采集 | 第39页 |
| 3.2.2 RNA提取 | 第39-41页 |
| 3.2.2.1 提取步骤 | 第39-40页 |
| 3.2.2.2 RNA质量检测方法 | 第40-41页 |
| 3.2.3 文库构建 | 第41-43页 |
| 3.2.3.1 溶液配制 | 第41页 |
| 3.2.3.2 文库构建步骤 | 第41-43页 |
| 3.2.4 文库回收及质量检测 | 第43-45页 |
| 3.2.4.1 文库检测及回收 | 第43-44页 |
| 3.2.4.2 Agilent检测DNA文库 | 第44-45页 |
| 3.2.5 高通量测序及数据分析方法 | 第45-46页 |
| 3.2.5.1 高通量测序 | 第45页 |
| 3.2.5.2 数据处理流程及功能分析 | 第45-46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-85页 |
| 3.3.1 测序数据质量分析 | 第46-49页 |
| 3.3.2 转录组测序数据拼接结果 | 第49-51页 |
| 3.3.3 样本重复性及样本间聚类分析 | 第51-53页 |
| 3.3.4 差异基因分析 | 第53-54页 |
| 3.3.5 Unigenes功能预测 | 第54-67页 |
| 3.3.5.1 Gene Ontology (GO)注释 | 第54-55页 |
| 3.3.5.2 生物学通路注释 | 第55-65页 |
| 3.3.5.3 转录因子预测 | 第65-67页 |
| 3.3.6 差异基因功能富集分析 | 第67-85页 |
| 3.3.6.1 Gene Ontology富集分析 | 第67-73页 |
| 3.3.6.2 生物学通路富集 | 第73-81页 |
| 3.3.6.3 转录因子的富集分析 | 第81-85页 |
| 第四章 结论 | 第85-97页 |
| 4.1 胎生机制模型 | 第85-87页 |
| 4.2 胎生相关基因 | 第87-95页 |
| 4.3 总结 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及参与的科研项目 | 第105页 |
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