| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 名称缩写 | 第14-16页 |
| 第1章 引言 | 第16-35页 |
| 1.1 赭曲霉毒素A的特性及食品中的限量标准 | 第16-17页 |
| 1.2 传统肉制品中赭曲霉毒素A的存在与分布 | 第17-24页 |
| 1.2.1 传统肉制品中赭曲霉毒素A的发现 | 第17-22页 |
| 1.2.2 传统肉制品中赭曲霉毒素A产生菌的种类 | 第22-24页 |
| 1.3 赭曲霉毒素A的假定生物合成途径及其类似物 | 第24-28页 |
| 1.4 赭曲霉毒素A生物合成相关基因簇 | 第28-30页 |
| 1.4.1 聚合酮酶和非核糖体多肽合成酶 | 第28-29页 |
| 1.4.2 氯代过氧化物酶和细胞色素P450氧化酶 | 第29-30页 |
| 1.5 环境信号对赭曲霉素A生物合成的调控机制 | 第30-33页 |
| 1.6 本课题的研究意义与主要内容 | 第33-35页 |
| 1.6.1 研究背景与意义 | 第33页 |
| 1.6.2 主要内容 | 第33-34页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第34-35页 |
| 第2章 干腌火腿成熟过程中真菌毒素的动态变化规律 | 第35-52页 |
| 2.1 前言 | 第35-36页 |
| 2.2 材料与设备 | 第36页 |
| 2.2.1 实验原材料 | 第36页 |
| 2.2.2 试剂与固相萃取柱 | 第36页 |
| 2.2.3 仪器与设备 | 第36页 |
| 2.3 实验方法 | 第36-38页 |
| 2.3.1 样品采集 | 第36-37页 |
| 2.3.2 理化指标检验 | 第37页 |
| 2.3.3 丝状真菌菌落数计数 | 第37页 |
| 2.3.4 真菌毒素检测 | 第37-38页 |
| 2.4 结果与分析 | 第38-50页 |
| 2.4.1 干腌火腿成熟过程中的理化性质及霉菌菌落总数 | 第38-41页 |
| 2.4.2 基于QuEChERS的LC-MS/MS方法学评价 | 第41-46页 |
| 2.4.3 基于LC-MS/MS分析干腌火腿的真菌毒素 | 第46-47页 |
| 2.4.4 干腌火腿理化性质与毒素的相关性分析 | 第47-50页 |
| 2.5 小结 | 第50-52页 |
| 第3章 宏基因组学解析干腌火腿真菌群落演替规律及产毒基因功能 | 第52-69页 |
| 3.1 前言 | 第52-53页 |
| 3.2 材料与设备 | 第53页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第53页 |
| 3.2.2 试剂盒 | 第53页 |
| 3.2.3 仪器与设备 | 第53页 |
| 3.3 实验方法 | 第53-54页 |
| 3.3.1 干腌火腿真菌基因组提取 | 第53页 |
| 3.3.2 PCR扩增及质量评价 | 第53-54页 |
| 3.3.3 ITS高通量测序 | 第54页 |
| 3.3.4 宏基因组测序 | 第54页 |
| 3.4 结果与分析 | 第54-67页 |
| 3.4.1 基于ITS和宏基因组测序的DNA扩增电泳图 | 第54-56页 |
| 3.4.2 基于时间尺度的真菌群落分布多样性解析 | 第56-57页 |
| 3.4.3 基于时间尺度的真菌群落分布差异性解析 | 第57-58页 |
| 3.4.4 基于时间尺度的优势物种注释 | 第58-60页 |
| 3.4.5 环境因子与真菌群落相关性分析 | 第60-62页 |
| 3.4.6 真菌次级代谢产物合成相关的通路与基因功能注释 | 第62-67页 |
| 3.5 小结 | 第67-69页 |
| 第4章 环境因子对干腌火腿产毒真菌生理及代谢的影响 | 第69-95页 |
| 4.1 前言 | 第69-70页 |
| 4.2 材料与设备 | 第70-71页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第70页 |
| 4.2.2 化学试剂与培养基 | 第70页 |
| 4.2.3 主要设备 | 第70-71页 |
| 4.3 实验方法 | 第71-73页 |
| 4.3.1 菌株分离与培养 | 第71页 |
| 4.3.2 ELISA产毒定性分析 | 第71页 |
| 4.3.3 HPLC-FLD产毒定量分析 | 第71页 |
| 4.3.4 形态学和分子生物学鉴定菌株 | 第71-72页 |
| 4.3.5 菌株产孢量测定 | 第72页 |
| 4.3.6 环境因子影响菌株产孢与产毒的实验设计 | 第72-73页 |
| 4.4 结果与分析 | 第73-93页 |
| 4.4.1 丝状真菌的分离与培养 | 第73-74页 |
| 4.4.2 产毒丝状真菌的筛选 | 第74-79页 |
| 4.4.3 目标菌株的菌落形态与显微特征 | 第79页 |
| 4.4.4 目标菌株的分子生物学鉴定 | 第79-83页 |
| 4.4.5 环境因子对目标菌株产孢量的影响 | 第83-86页 |
| 4.4.6 环境因子对目标菌株产OTA的影响 | 第86-93页 |
| 4.5 小结 | 第93-95页 |
| 第5章 转录组学解析产毒菌株对NaCl胁迫应答的调控因子 | 第95-107页 |
| 5.1 前言 | 第95-96页 |
| 5.2 材料与设备 | 第96页 |
| 5.2.1 菌株 | 第96页 |
| 5.2.2 培养基与主要试剂 | 第96页 |
| 5.2.3 仪器与设备 | 第96页 |
| 5.3 实验方法 | 第96-97页 |
| 5.3.1 菌株培养 | 第96-97页 |
| 5.3.2 RNA-seq测序 | 第97页 |
| 5.3.3 转录表达水平统计及定量分析 | 第97页 |
| 5.4 结果与分析 | 第97-106页 |
| 5.4.1 RNA提取及质量检测 | 第97-98页 |
| 5.4.2 基因转录水平的总体变化 | 第98-99页 |
| 5.4.3 差异表达基因的GO富集分析 | 第99-101页 |
| 5.4.4 差异表达基因的代谢网络功能分析 | 第101-102页 |
| 5.4.5 参与OTA生物合成的差异表达基因 | 第102-104页 |
| 5.4.6 NaCl渗透胁迫下调控因子的转录水平变化 | 第104-106页 |
| 5.5 小结 | 第106-107页 |
| 第6章 结论与展望 | 第107-110页 |
| 6.1 主要结论 | 第107-108页 |
| 6.2 主要创新点 | 第108-109页 |
| 6.3 研究展望 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-124页 |
| 博士期间发表的论文 | 第124-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
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