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耶尔森氏菌91001株基因组测序、比较基因组学及Ⅲ型分泌系统研究
 
     论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-12页
缩略词表第12-13页
第一章 引言第13-26页
 一、毒力岛的概念及特征第13页
 二、耶尔森氏菌的毒力岛及毒力相关因子第13-21页
  1.HPI及其编码的毒力相关因子第15-16页
  2.YOP区及其编码的毒力相关因子第16-17页
  3.其他毒力相关因子第17-21页
 三、Ⅲ型分泌系统第21-26页
  1.Ⅲ型分泌系统的主要特征第22页
  2.TTSS的组成成分第22-23页
  3.三型分泌系统分泌机制假说第23-26页
第二章 91001株全基因组测序、注释及比较基因组学分析第26-54页
   ·材料与方法第26-31页
     ·测序第26页
     ·拼接第26-27页
     ·基因组注释第27-29页
     ·提交NCBI第29-30页
     ·比较基因组学分析第30页
     ·C092及K蝴株特有基因的分析第30-31页
   ·结果与讨论第31-54页
     ·91001全基因组测序及注释第31页
     ·91001株全基因组比较基因组学研究第31-47页
       ·一般特征的比较第31页
       ·染色体的比较基因组学第31-42页
       ·质粒的比较基因组学分析第42-47页
     ·91001株新毒力基因的预测与分析:第47-54页
第三章 Ⅲ型分泌系统分子伴侣保守性研究第54-97页
   ·材料与方法:第54-55页
     ·建立完备的TTSC数据库第54页
     ·鉴定TTSC蛋白的同源和直系同源第54页
     ·寻找TTSC的已知模体第54页
     ·分析TTSC的保守模体及其分布图第54-55页
     ·模体profile的比对第55页
     ·保守位点的识别第55页
     ·保守位点对功能或结构的贡献的分析第55页
     ·已知晶体结构的比较第55页
     ·TTSC结构折叠类型的预测及分析第55页
   ·结果与讨论第55-97页
     ·35个TTSC的同源分析第55-58页
     ·35个TTSC的模体分析第58-63页
     ·搜索TTSC的已知模体及已知模体与TTSC模体的比较第63页
     ·全局变异局部保守位点的分析第63-66页
     ·基于模体的TTSC分类方法第66页
     ·新的TTSC的预测第66-74页
     ·TTSC空间结构比较与预测第74-96页
     ·基于结构保守的Ⅲ型分泌系统TTSC分泌机制的探索第96-97页
第四章 总结第97-104页
 参考文献第99-104页
第五章 综述第104-117页

 
 
论文编号BS1127184,这篇论文共117
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