| 第一章 绪论 | 第1-37页 |
| ·植物促生细菌的生态学研究 | 第13-19页 |
| ·植物促生细菌的生物多样性 | 第13-15页 |
| ·植物促生细菌的功能多样性 | 第15-19页 |
| ·植物促生细菌的生态学研究方法 | 第19-28页 |
| ·培养(Culture-dependent)方法 | 第19-20页 |
| ·非培养(Culture-independent)方法 | 第20-26页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第26-28页 |
| ·基于PCR的非培养方法在植物内生及根际细菌研究中的应用 | 第28-35页 |
| ·非培养方法在植物内生细菌研究中的应用 | 第28-31页 |
| ·非培养方法在植物根际细菌研究中的应用 | 第31-34页 |
| ·研究中存在的问题 | 第34-35页 |
| ·结语 | 第35-36页 |
| 立论依据及研究思路 | 第36-37页 |
| 第二章 16S rRNA基因克隆文库的构建对水稻根内生细菌多样性的研究 | 第37-59页 |
| ·材料与方法 | 第37-42页 |
| ·植物材料及生长条件 | 第37-38页 |
| ·水稻基因组DNA的提取 | 第38页 |
| ·水稻根内生细菌16S rRNA基因克隆文库的构建和分析 | 第38-42页 |
| ·结果 | 第42-53页 |
| ·水稻根总DNA的提取 | 第42-43页 |
| ·内生细菌16S rDNA片段的PCR扩增 | 第43-44页 |
| ·水稻根内生细菌群落16S rDNA克隆文库的构建及检测 | 第44-45页 |
| ·水稻根内生细菌群落16S rDNA克隆文库的ARDRA分型 | 第45-46页 |
| ·克隆文库的评价 | 第46页 |
| ·水稻根内生细菌群落16S rRNA基因多样性及系统发育学分析 | 第46-53页 |
| ·讨论 | 第53-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第三章 16S rRNA基因克隆文库的构建和培养方法对水稻根结合细菌群落结构的比较研究 | 第59-77页 |
| ·材料与方法 | 第59-62页 |
| ·植物材料及生长条件 | 第59-60页 |
| ·水稻基因组DNA的提取 | 第60页 |
| ·水稻根结合细菌16S rRNA基因克隆文库的构建和分析 | 第60页 |
| ·根结合细菌的分离培养 | 第60-61页 |
| ·分离细菌的ARDRA分型 | 第61-62页 |
| ·序列测定及同源性比较 | 第62页 |
| ·结果 | 第62-74页 |
| ·水稻根的总DNA提取及根结合细菌16S rDNA片段的PCR扩增 | 第62-63页 |
| ·水稻根结合细菌群落16S rDNA克隆文库的构建及检测 | 第63-64页 |
| ·16S rRNA基因克隆文库的ARDRA分型结果及文库评估 | 第64-65页 |
| ·水稻根结合细菌群落16S rRNA基因多样性及系统发育学分析 | 第65-71页 |
| ·可培养细菌16S rDNA部分序列的ARDRA分型 | 第71-72页 |
| ·可培养细菌多样性分析 | 第72-74页 |
| ·讨论 | 第74-77页 |
| 第四章 PCR-DGGE技术对水稻根内生细菌群落及根结合细菌群落动态变化的研究 | 第77-104页 |
| 第一节 PCR-DGGE技术和培养方法对水稻根内生细菌群落多样性的比较研究 | 第78-94页 |
| ·材料和方法 | 第78-82页 |
| ·植物材料 | 第78页 |
| ·主要试剂 | 第78-79页 |
| ·水稻根基因组DNA的提取 | 第79页 |
| ·细菌16S rDNA的PCR扩增 | 第79-80页 |
| ·PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析 | 第80页 |
| ·DGGE图谱遗传多样性分析 | 第80-81页 |
| ·DGGE条带的回收和重新扩增 | 第81页 |
| ·DGGE回收条带的克隆和转化 | 第81页 |
| ·DGGE条带的序列测定和同源性比较 | 第81页 |
| ·根内生细菌的分离培养 | 第81-82页 |
| ·结果 | 第82-91页 |
| ·不同植物样品基因组DNA的提取 | 第82-83页 |
| ·细菌16S rDNA的PCR扩增 | 第83-84页 |
| ·水稻根内生细菌PCR产物的DGGE垂直胶分离 | 第84-85页 |
| ·水稻根内生细菌多样性的分析 | 第85-89页 |
| ·可培养细菌多样性分析 | 第89-91页 |
| ·讨论 | 第91-94页 |
| 第二节 变性梯度凝胶电泳(DGGE)对水稻根结合细菌群落时空动态变化的研究 | 第94-104页 |
| ·材料和方法 | 第94-95页 |
| ·植物材料 | 第94页 |
| ·主要试剂 | 第94页 |
| ·水稻基因组DNA的提取 | 第94页 |
| ·细菌16S rDNA的PCR扩增 | 第94页 |
| ·PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析 | 第94-95页 |
| ·DGGE图谱遗传多样性分析 | 第95页 |
| ·DGGE条带的回收和重新扩增 | 第95页 |
| ·DGGE回收条带的克隆和转化 | 第95页 |
| ·DGGE条带的序列测定和同源性比较 | 第95页 |
| ·结果和讨论 | 第95-104页 |
| ·不同植物样品基因组DNA的提取 | 第95页 |
| ·细菌16S rDNA的PCR扩增 | 第95-97页 |
| ·水平DGGE对水稻根结合细菌群落多样性的分析 | 第97-98页 |
| ·水稻根结合细菌群落遗传多样性分析 | 第98-100页 |
| ·水稻不同品种不同生长时期根结合细菌群落相似性分析 | 第100页 |
| ·主要电泳条带的序列测定及细菌多样性分析 | 第100-104页 |
| 结论 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-119页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第119-120页 |
| 致谢 | 第120页 |
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