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鼠隐孢子虫感染后小鼠肠道菌群变化及代谢组学研究
 
     论文目录
 
致谢第5-10页
摘要第10-12页
第一部分 文献综述第12-24页
    1 隐孢子虫和鼠隐孢子虫第12-15页
        1.1 隐孢子虫第12-14页
            1.1.1 种属第12页
            1.1.2 形态大小和寄生部位第12页
            1.1.3 生活史第12-14页
            1.1.4 隐孢子虫的致病性第14页
        1.2 鼠隐孢子虫简介第14-15页
            1.2.1 鼠隐孢子虫第14页
            1.2.2 鼠隐孢子虫流行病学第14-15页
            1.2.3 鼠孢隐孢子虫分子鉴定第15页
            1.2.4 鼠隐孢子虫的生物学分析第15页
    2 小鼠肠道菌群研究进展第15-19页
        2.1 小鼠肠道菌群的影响因素第16-17页
            2.1.1 饮食方面第16页
            2.1.2 药物方面第16页
            2.1.3 微生物及其分泌因子方面第16-17页
            2.1.4 疾病方面第17页
            2.1.5 寄生虫方面第17页
        2.2 肠道菌群研究方法第17-18页
            2.2.1. 传统的纯培养法第17页
            2.2.2 ERIC-PCR分子杂交技术第17-18页
            2.2.3. 基于16S rDNA的分子测序技术第18页
            2.2.4. 荧光原位杂交技术第18页
            2.2.5. 宏基因组学研究方法第18页
        2.3 16S rRNA测序技术在肠道菌群研究中的应用第18-19页
        2.4 肠道菌群对机体的益处第19页
            2.4.1 益生菌对机体免疫的作用第19页
            2.4.2 肠道菌群对机体健康的作用第19页
    3 代谢组学研究进展第19-21页
        3.1 代谢组学的主要分析方法第20页
            3.1.1 核磁共振第20页
            3.1.2 液相色谱-质谱联用第20页
            3.1.3 气相色谱-质谱联用第20页
        3.2 代谢组学试验的主要分析策略第20-21页
            3.2.1 非靶向代谢组学第20-21页
            3.2.2 靶向代谢组学第21页
        3.3 小鼠代谢组学研究现状第21页
            3.3.1 发病机制方面第21页
            3.3.2 药物治疗方面第21页
    4 展望第21-24页
第二部分 鼠隐孢子虫感染小鼠的部分生物学特征研究第24-32页
    1 引言第24页
    2 材料与方法第24-26页
        2.1 卵囊来源第24页
        2.2 试验仪器和试剂第24-25页
            2.2.1 仪器第24页
            2.2.2 主要试剂和耗材第24-25页
        2.3 方法第25-26页
            2.3.1 纯化鼠隐孢子虫卵囊并感染小鼠第25页
            2.3.2 OPG(Oocyst pergram)计数第25-26页
            2.3.3 制作组织病理切片第26页
            2.3.4 制作组织扫描电镜切片第26页
    3 结果与分析第26-30页
        3.1 鼠隐孢子纯化结果第26-27页
        3.2 鼠隐孢子感染小鼠后OPG变化第27-28页
        3.3 病理切片观察第28-29页
        3.4 组织样品的扫描电镜观察第29-30页
    4 结论与讨论第30-32页
第三部分 鼠隐孢子虫感染小鼠的肠道菌群变化研究第32-50页
    1 引言第32页
    2 材料与方法第32-34页
        2.1 卵囊来源第32页
        2.2 试验仪器和试剂第32页
            2.2.1 仪器第32页
            2.2.2 主要试剂耗材第32页
        2.3 方法第32-34页
            2.3.1 鼠隐孢子虫感染小鼠和粪便样品收集第32-33页
            2.3.2 粪便DNA提取第33页
            2.3.3 生物信息分析第33-34页
            2.3.4 生物信息学分析软件第34页
    3 结果与分析第34-46页
        3.1 OTU累计曲线第34-35页
        3.2 OTU Venn图第35-36页
        3.3 OTU PLS-DA分析第36-37页
        3.4 物种组成分析第37-40页
            3.4.1 门水平物种相对丰度分析第37-38页
            3.4.2 科水平物种相对丰度分析第38-39页
            3.4.3 属水平物种相对丰度分析第39-40页
        3.5 物种PCA分析第40页
        3.6 多样性分析第40-45页
        3.7 样品间物种组成聚类分析第45-46页
    4 结论与讨论第46-50页
第四部分 鼠隐孢子虫感染小鼠的代谢组学研究第50-78页
    1 引言第50页
    2 材料与方法第50-52页
        2.1 卵囊来源第50页
        2.2 试验仪器和试剂第50-51页
            2.2.1 仪器第50页
            2.2.2 主要试剂耗材第50-51页
        2.3 方法第51-52页
            2.3.1 鼠隐孢子虫感染小鼠和粪便样品收集第51页
            2.3.2 样品处理和代谢物提取第51页
            2.3.3 样品检测和数据处理第51-52页
    3 结果与分析第52-73页
        3.1 数据质控第52-55页
            3.1.1 QC样本的色谱图重叠第52-53页
            3.1.2 所有样本的主成分分析(PCA)第53-54页
            3.1.3 化合物数量和峰面积差异第54-55页
        3.2 化合物检测结果和注释第55-59页
            3.2.1 化合物的检测和鉴定情况第56页
            3.2.2 代谢物的分类和功能注释第56-59页
        3.3 统计分析及差异代谢物的筛选第59-62页
            3.3.1 主成分分析(PCA)第59-61页
            3.3.2 差异代谢物的筛选结果第61页
            3.3.3 代谢差异物分析第61-62页
        3.4 差异代谢物分析第62-73页
            3.4.1 差异代谢物的聚类分析第62-67页
            3.4.2 差异代谢物的代谢通路富集分析第67-73页
    4 结论与讨论第73-78页
第五部分 结论和创新点第78-80页
    结论第78-79页
    创新点第79-80页
参考文献第80-88页
ABSTRACT第88-90页

 
 
论文编号BS4734434,这篇论文共90
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