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当前位置:教育论文中心首页--博士论文--通过裂腹鱼类的转录组比较分析揭示青藏高原鱼类的适应性进化
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通过裂腹鱼类的转录组比较分析揭示青藏高原鱼类的适应性进化
 
     论文目录
 
摘要第4-8页
ABSTRACT第8-10页
引言第13-15页
第一章 综述第15-30页
    1.1 青藏高原的演变第15-17页
    1.2 高海拔适应机制的研究进展第17-22页
        1.2.1 鱼类的适应性进化第18-19页
        1.2.2 其他物种的适应性进化第19-22页
        1.2.3 小结第22页
    1.3 裂腹鱼类研究进展第22-23页
        1.3.1 裂腹鱼类的分布和类群特征第22-23页
        1.3.2 裂腹鱼类的起源和演化第23页
    1.4 转录组学概述第23-26页
        1.4.1 测序技术的发展第24-26页
        1.4.2 RNA-seq技术的运用第26页
    1.5 适应性进化分析第26-30页
        1.5.1 分子进化的动力第26-27页
        1.5.2 分子进化的中性学说第27页
        1.5.3 中性突变的类型第27-28页
        1.5.4 适应性进化分析方法第28-30页
第二章 怒江裂腹鱼和软刺裸鲤的转录组比较研究第30-51页
    2.1 材料和方法第30-38页
        2.1.1 动物伦理学说明第30-31页
        2.1.2 样本采集第31页
        2.1.3 总RNA的提取第31-32页
        2.1.4 cDNA文库构建和Illumina测序第32-33页
        2.1.5 生物信息分析第33-38页
    2.2 研究结果第38-49页
        2.2.1 转录组过滤及拼接结果第38-39页
        2.2.2 转录组注释结果第39-42页
        2.2.3 单拷贝直系同源基因家族及进化速率第42-44页
        2.2.4 正选择基因及其功能富集第44-46页
        2.2.5 低氧相关基因的鉴定第46-49页
    2.3 小结和讨论第49-51页
第三章 四种裂腹鱼的转录组比较研究第51-80页
    3.1 材料和方法第51-57页
        3.1.1 动物伦理学说明第51页
        3.1.2 样本采集第51-52页
        3.1.3 总RNA的提取第52页
        3.1.4 cDNA文库构建和Illumina测序第52页
        3.1.5 生物信息分析第52-57页
    3.2 研究结果第57-77页
        3.2.1 Illumina测序和de novo组装第57-58页
        3.2.2 转录组注释第58-60页
        3.2.3 单拷贝直系同源基因家族第60页
        3.2.4 系统发育树和分歧年代第60-61页
        3.2.5 裂腹鱼类的快速进化第61-65页
        3.2.6 正选择基因及富集分析第65-69页
        3.2.7 基因表达差异结果及富集分析第69-77页
    3.3 小结和讨论第77-80页
结论第80-81页
参考文献第81-91页
在学期间的研究成果第91-92页
致谢第92页

 
 
论文编号BS2697085,这篇论文共92
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