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当前位置:教育论文中心首页--硕士论文--对结直肠癌基因表达与基因组修饰异常的综合分析
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对结直肠癌基因表达与基因组修饰异常的综合分析
 
     论文目录
 
摘要第3-5页
ABSTRACT第5-7页
第一章 绪论第11-23页
    1.1 结直肠癌的概述及其研究的重要性第11-12页
        1.1.1 结直肠癌概述第11-12页
        1.1.2 结直肠癌研究的重要性第12页
    1.2 DNA甲基化介绍第12-15页
        1.2.1 DNA甲基化概述第12-13页
        1.2.2 DNA甲基化的分布第13-14页
        1.2.3 DNA甲基化的功能第14-15页
    1.3 长链非编码RNA介绍第15-19页
        1.3.1 长链非编码RNA概述第15-16页
        1.3.2 长链非编码RNA的功能和作用机制第16-17页
        1.3.3 长链非编码RNA与癌症第17-19页
    1.4 转录组测序技术简介第19-20页
    1.5 DNA甲基化测序技术简介第20-21页
    1.6 本课题的研究目的及意义第21-23页
第二章 结直肠癌的表达谱研究第23-60页
    2.1 引言第23页
    2.2 材料第23页
    2.3 RNA-seq测序及数据处理与分析第23-36页
        2.3.1 原始测序数据去接头、过滤及质控第26-27页
        2.3.2 比对到参考基因组第27-28页
        2.3.3 数据组装第28-29页
        2.3.4 识别lncRNA和蛋白编码基因第29-30页
        2.3.5 筛选差异表达转录本第30-32页
        2.3.6 差异表达转录本的功能富集分析第32-34页
        2.3.7 共表达网络分析第34-36页
        2.3.8 共表达网络基因功能分析第36页
    2.4 结果第36-58页
        2.4.1 原始测序数据去接头、过滤及质控第36-38页
        2.4.2 比对到参考基因组第38-40页
        2.4.3 数据组装第40页
        2.4.4 识别lncRNA和蛋白编码基因第40-41页
        2.4.5 筛选差异表达转录本第41-44页
        2.4.6 差异表达转录本的功能富集分析第44-50页
        2.4.7 加权基因共表达网络分析第50-54页
        2.4.8 共表达网络基因功能分析第54-58页
    2.5 讨论第58-60页
第三章 结直肠癌的DNA甲基化谱研究第60-71页
    3.1 引言第60页
    3.2 材料第60页
    3.3 方法第60-64页
        3.3.1 测序原始数据的质控第61-62页
        3.3.2 clean data比对到人类参考基因组第62页
        3.3.3 筛选差异甲基化位点第62-64页
        3.3.4 差异甲基化位点功能富集第64页
        3.3.5 共甲基化网络分析第64页
    3.4 结果第64-70页
        3.4.1 测序原始数据的质控第65页
        3.4.2 Clean data比对到人类参考基因组第65-66页
        3.4.3 筛选差异甲基化位点第66-68页
        3.4.4 共甲基化网络分析第68-70页
    3.5 讨论第70-71页
第四章 整合分析结直肠癌的表达谱和甲基化谱第71-74页
    4.1 引言第71页
    4.2 方法第71页
    4.3 结果第71-73页
    4.4 讨论第73-74页
结语第74-76页
参考文献第76-81页
读研期间发表论文第81-82页
致谢第82-83页

 
 
论文编号BS2554636,这篇论文共83
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