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应用焦磷酸测序技术对新疆地区传统发酵乳制品中微生物多样性的研究 |
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论文目录 |
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摘要 | 第3-4页 | Abstract | 第4页 | 1 引言 | 第10-15页 | 1.1 新疆地区的传统发酵乳制品及种类 | 第10页 | 1.2 传统发酵乳制品主要菌群构成 | 第10-11页 | 1.2.1 乳酸菌 | 第10-11页 | 1.2.2 酵母菌 | 第11页 | 1.3 发酵乳制品微生物多样性研究方法 | 第11-13页 | 1.3.1 传统纯培养方法 | 第11-12页 | 1.3.2 非培养的研究方法 | 第12-13页 | 1.4 立题意义及研究内容 | 第13-15页 | 1.4.1 立题意义 | 第13页 | 1.4.2 研究内容 | 第13-15页 | 2 材料与方法 | 第15-21页 | 2.1 试验材料 | 第15-16页 | 2.1.1 样品来源 | 第15-16页 | 2.1.2 主要试验试剂及药品 | 第16页 | 2.1.3 仪器与设备 | 第16页 | 2.2 试验方法 | 第16-21页 | 2.2.1 样品采集 | 第16-17页 | 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第17页 | 2.2.3 基因组DNA纯度检测 | 第17页 | 2.2.4 细菌16S rRNA基因V3区及真菌18S rRNA基因ITS区的PCR扩增 | 第17-19页 | 2.2.5 PCR扩增产物定量及焦磷酸测序 | 第19页 | 2.2.6 高质量序列的提取 | 第19页 | 2.2.7 高质量序列的生物信息学处理 | 第19页 | 2.2.8 数据统计分析及图表绘制 | 第19-20页 | 2.2.9 核酸登录号 | 第20-21页 | 3 结果与分析 | 第21-34页 | 3.1 样品基因组DNA提取结果 | 第21页 | 3.2 样品PCR扩增结果 | 第21-22页 | 3.3 酸牛奶样品中细菌菌群群落结构分析 | 第22-29页 | 3.3.1 细菌序列丰度和多样性分析 | 第22-25页 | 3.3.2 基于多元统计方法的酸牛奶样品细菌群落结构比较分析 | 第25-27页 | 3.3.3 样品中细菌相对含量和构成分析 | 第27-29页 | 3.4 酸牛奶样品中真菌菌群群落结构分析 | 第29-34页 | 3.4.1 真菌序列丰度和多样性分析 | 第29-31页 | 3.4.2 基于多元统计方法的酸牛奶样品真菌群落结构比较分析 | 第31-32页 | 3.4.3 样品中真菌相对含量和构成分析 | 第32-34页 | 4 讨论 | 第34-37页 | 4.1 传统纯培养、PCR-DGGE、焦磷酸测序方法的比较 | 第34-35页 | 4.2 微生物多样性及丰度比较 | 第35页 | 4.3 微生物群落结构比较 | 第35-37页 | 5 结论 | 第37-38页 | 致谢 | 第38-39页 | 参考文献 | 第39-43页 | 附表 | 第43-45页 | 作者简介 | 第45页 |
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