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芥菜型油菜叶绿体基因组DNA多态性研究 |
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| 摘要 | 第6-7页 | | Abstract | 第7-8页 | | 缩略语表 | 第9-10页 | | 1 文献综述 | 第10-18页 | | 1.1 油菜简介 | 第10页 | | 1.1.1 油菜的分类 | 第10页 | | 1.1.2 芥菜型油菜简介: | 第10页 | | 1.2 叶绿体基因组概述 | 第10-16页 | | 1.2.1 叶绿体基因组的结构 | 第10-11页 | | 1.2.2 叶绿体基因组编码的基因 | 第11-12页 | | 1.2.3 叶绿体基因组提取方法的优化 | 第12-13页 | | 1.2.4 叶绿体基因组测序技术的发展 | 第13-15页 | | 1.2.5 叶绿体基因组在实践生产中的应用 | 第15-16页 | | 1.3 检测变异的方法 | 第16-17页 | | 1.4 本研究的目的意义 | 第17-18页 | | 2 材料与方法 | 第18-25页 | | 2.1 实验材料 | 第18页 | | 2.2 实验方法 | 第18-25页 | | 2.2.1 叶绿体的分离方法 | 第18-19页 | | 2.2.2 叶绿体DNA提取与纯化 | 第19页 | | 2.2.3 叶绿体DNA文库构建及库检 | 第19-20页 | | 2.2.4 上机测序 | 第20页 | | 2.2.5 数据整理 | 第20-21页 | | 2.2.6 引物设计 | 第21-22页 | | 2.2.7 PCR扩增 | 第22-23页 | | 2.2.8 基因克隆和测序 | 第23-25页 | | 3 结果与分析 | 第25-47页 | | 3.1 叶绿体镜检 | 第25页 | | 3.2 叶绿体DNA质量检测 | 第25-26页 | | 3.3 测序结果展示 | 第26-30页 | | 3.3.1 测序数据质量评估 | 第26-27页 | | 3.3.2 测序数据质量情况汇总 | 第27-30页 | | 3.4 叶绿体DNA变异分析 | 第30-32页 | | 3.5 研究Illumina测序所得变异频率的阈值 | 第32-43页 | | 3.5.1 对 2%-3% 变异频率的验证 | 第32-33页 | | 3.5.2 对 6%-7% 变异频率的验证 | 第33-35页 | | 3.5.3 对 20% 变异频率的验证 | 第35-37页 | | 3.5.4 对 4%-23%变异频率的验证 | 第37-40页 | | 3.5.5 对 8% 变异频率的验证 | 第40页 | | 3.5.6 对 10% 变异频率的验证 | 第40-41页 | | 3.5.7 对 12%-15% 变异频率的验证 | 第41-43页 | | 3.6 基于叶绿体DNA序列的多态性研究 | 第43-47页 | | 3.6.1 对rps19基因序列进行分析 | 第43-45页 | | 3.6.2 对位于区段(64108,65260)之间的基因间隔区进行分析 | 第45-47页 | | 4 讨论 | 第47-50页 | | 4.1 叶绿体基因组提取方法的优化 | 第47页 | | 4.2 Illumina测序技术发掘叶绿体基因组DNA多态性 | 第47-48页 | | 4.3 Illumina测序所得变异频率的阈值 | 第48页 | | 4.4 基于叶绿体DNA序列的芥菜型油菜多态性研究 | 第48-50页 | | 参考文献 | 第50-56页 | | 附录 | 第56-74页 | | 致谢 | 第74页 |
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论文编号BS2986336，这篇论文共74页
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