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来自Natrinema属极端嗜盐古生菌的溶原噬菌体SNJ1及其宿主的相关研究
 
     论文目录
 
摘要第1-8页
Abstract第8-17页
第一章 前言第17-33页
   ·古生菌(Archaea)第17-21页
     ·古生菌的概念第17-19页
     ·古生菌的分类第19-20页
     ·古生菌的特征第20-21页
   ·嗜盐古生菌(Halophilic Archaea)第21-23页
     ·嗜盐古生菌概述第21-22页
     ·嗜盐古生菌研究及其发展第22-23页
   ·古生菌噬菌体(Archaeal Virus)第23-31页
     ·古生菌噬菌体概述第23-24页
     ·嗜盐古生菌噬菌体相关研究第24-29页
     ·嗜盐古生菌溶源性噬菌体第29-31页
   ·本研究的目的和意义第31-33页
第二章 嗜盐古生菌溶原噬菌体基本性质研究第33-79页
   ·实验材料第33-36页
     ·菌株和DNA第33-34页
       ·菌株第33-34页
       ·DNA第34页
     ·试剂、仪器及溶液第34-36页
       ·试剂第34-35页
       ·仪器耗材第35页
       ·溶液及培养基第35-36页
   ·实验方法第36-42页
     ·菌株的接种及培养第36-37页
       ·嗜盐古生菌的接种及培养第36页
       ·大肠杆菌DH5α及BL21的接种培养第36-37页
     ·噬菌体效价的测定第37页
     ·噬菌体SNJ1丝裂霉素C(MMC)诱导方法第37页
     ·噬菌体一步生长曲线测定第37-38页
     ·噬菌体SNJ1的纯化第38页
     ·噬菌体SNJ1的形态观察第38页
     ·噬菌体SNJ1基因组的提取第38-39页
     ·噬菌体蛋白质谱分析第39页
     ·噬菌体预测衣壳蛋白基因的克隆第39-41页
       ·引物设计第39-40页
       ·噬菌体衣壳蛋白基因序列的扩增第40页
       ·琼脂糖凝胶电泳第40页
       ·PCR产物的回收、酶切及纯化第40-41页
       ·转化子的检测第41页
     ·噬菌体预测衣壳蛋白基因的异源表达第41-42页
   ·实验结果第42-78页
     ·嗜盐古生菌噬菌体SNJ1的诱导第42-45页
       ·宿主Natrinema sp.J7-1自释放噬菌体SNJ1第42-43页
       ·噬菌体SNJ1诱导条件的优化第43-44页
       ·宿主诱导释放噬菌体SNJ1第44-45页
     ·噬菌体一步生长曲线第45-49页
       ·破细胞条件第45-46页
       ·敏感菌CFU和其浊度OD_(600)之间关系的确定第46-47页
       ·一步生长曲线感染比例系数(MOI)的确定第47-48页
       ·噬菌体SNJ1一步生长曲线测定第48-49页
     ·噬菌体SNJ1稳定性研究第49-53页
       ·氯仿对噬菌体SNJ1的影响第49-50页
       ·温度对噬菌体SNJ1的影响第50-51页
       ·pH对噬菌体SNJ1的影响第51-52页
       ·不同盐离子浓度对噬菌体SNJ1的影响第52-53页
     ·噬菌体SNJ1脂肪酸分析第53-55页
     ·噬菌体SNJ1的形态观察第55-57页
     ·噬菌体SNJ1遗传物质性质的鉴定第57-60页
       ·噬菌体SNJ1基因组核酸酶鉴定第57-59页
       ·噬菌体SNJ1基因组限制性内切酶酶切鉴定第59页
       ·噬菌体SNJ1全基因组高通量测序第59-60页
     ·噬菌体SNJ1蛋白质的鉴定和分析第60-68页
       ·噬菌体蛋白质SDS-PAGE鉴定第60-61页
       ·噬菌体蛋白质MALDI-TOF质谱检测第61-62页
       ·噬菌体蛋白质LC-MS/MS质谱检测第62-64页
       ·噬菌体SNJ1蛋白质的信息学分析第64-68页
     ·噬菌体预测的ATPase相关分析第68-69页
     ·噬菌体SNJ1预测衣壳蛋白的免疫学检测第69-78页
       ·重组表达质粒的获得第70-71页
       ·重组质粒转化大肠杆菌DH5α并鉴定转化子第71-72页
       ·重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)及鉴定第72页
       ·大、小衣壳蛋白基因的诱导表达及可溶性的分析第72-75页
       ·异源表达产物的纯化及其多克隆抗体的制备第75页
       ·Western Blot检测第75-77页
       ·胶体金免疫电子显微镜检测第77-78页
   ·讨论第78页
   ·小结第78-79页
第三章 嗜盐古生菌溶原体系的研究分析第79-103页
   ·实验材料第79-82页
     ·菌株和DNA第79-80页
       ·菌株第79-80页
       ·DNA第80页
     ·试剂、仪器及溶液第80-82页
       ·试剂第80页
       ·仪器耗材第80-81页
       ·溶液及培养基第81-82页
   ·实验方法第82-88页
     ·嗜盐古生菌基因组提取第82页
     ·嗜盐古生菌质粒提取第82页
       ·碱裂解法提质粒第82页
       ·手提大质粒第82页
     ·质粒pHH205和pJ7-Ⅰ的PCR鉴定第82-83页
     ·脉冲场凝胶电泳第83-84页
     ·环境样品的预处理第84页
       ·盐矿岩芯样品的预处理第84页
       ·盐矿卤水样品的处理第84页
     ·环境样品的接种及培养第84-85页
       ·盐矿岩芯样品的接种及培养第84-85页
       ·盐矿卤水样品的接种及培养第85页
     ·平板单菌落的分离第85页
     ·嗜盐古生菌基因组的提取第85-86页
       ·低渗破壁法提取基因组第85页
       ·试剂盒提取基因组第85-86页
     ·菌株16S rRNA基因序列PCR鉴定第86-87页
       ·引物设计第86页
       ·16S rRNA基因序列的扩增第86页
       ·序列测定及序列比对第86-87页
     ·系统发育分析和进化树的构建第87-88页
   ·实验结果与分析第88-101页
     ·宿主菌与敏感菌全基因组测序第88页
     ·溶原菌株及质粒消除菌株的相关研究第88-94页
       ·溶原菌株LJ7的获得第89页
       ·溶原菌株的鉴定第89-91页
       ·溶原菌株相关基本性质研究第91-93页
       ·质粒消除菌株相关基本性质研究第93-94页
     ·噬菌体SNJ1敏感菌的相关研究第94-101页
       ·敏感菌16S rRNA的分析第94-95页
       ·Natrinema属相关菌株感染检测第95页
       ·再从应城盐矿进行嗜盐古生菌分离鉴定第95-101页
   ·讨论第101-102页
   ·小结第102-103页
第四章 嗜盐古生菌遗传转化的初步尝试第103-119页
   ·实验材料第103-104页
     ·菌株和DNA第103页
       ·菌株第103页
       ·DNA第103页
     ·试剂、仪器及溶液第103-104页
       ·试剂第103-104页
       ·仪器耗材第104页
       ·溶液及培养基第104页
   ·实验方法第104-109页
     ·制备原生质体第104-105页
     ·原生质体恢复第105页
     ·抗生素对Natrinema sp.J7-2的处理第105页
       ·美维诺林(Mevinolin)对J7-2的处理第105页
       ·新生霉素(Novobiocin)对J7-2的处理第105页
     ·对质粒pHH205的改造第105-108页
       ·查找和定位新生霉素抗性基因第105-107页
       ·特异性扩增新生霉素抗性基因第107-108页
       ·酶切质粒pHH205后去磷酸化第108页
     ·嗜盐古生菌的遗传转化第108-109页
       ·Natrinema sp.J7-2的PEG介导转化第108-109页
       ·H.volcanii DS52的PEG介导转化第109页
   ·实验结果第109-117页
     ·嗜盐古生菌Natrinema sp.J7-2原生质体制备及恢复第109-112页
       ·不同培养条件对原生质体制备及恢复的影响第110-111页
       ·不同浓度PEG处理后对原生质体恢复的影响第111-112页
     ·嗜盐古生菌Natrinema sp.J7-2的抗生素耐受试验第112-113页
     ·Natrinema sp.J7-2和H.volcanii DS52的遗传转化第113-117页
       ·Natrinema sp.J7-2的遗传转化第114-115页
       ·H.volcanii DS52的遗传转化第115-117页
   ·讨论第117-118页
   ·小结第118-119页
总结第119-121页
参考文献第121-133页
在读期间取得的科研成果第133-134页
致谢第134-135页

 
 
论文编号BS12537,这篇论文共135
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