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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)亲虾性腺转录组分析及雌雄性腺差异表达基因鉴定 |
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论文目录 |
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摘要 | 第4-6页 | ABSTRACT | 第6-7页 | 1 前言 | 第12-21页 | 1.1 凡纳滨对虾 | 第12-13页 | 1.2 转录组测序简介 | 第13-14页 | 1.3 转录组测序在对虾生物学研究中的应用 | 第14页 | 1.4 性别相关基因 | 第14-19页 | 1.4.1 性别决定基因 | 第14-16页 | 1.4.2 性腺分化和性腺发育相关基因 | 第16-19页 | 1.5 本研究的目的和意义 | 第19-20页 | 1.6 本研究的技术路线 | 第20-21页 | 2 材料与方法 | 第21-28页 | 2.1 实验材料 | 第21-22页 | 2.1.1 凡纳滨对虾亲虾 | 第21页 | 2.1.2 主要仪器设备 | 第21页 | 2.1.3 主要试剂盒和试剂 | 第21页 | 2.1.4 相关溶液的配制方法 | 第21页 | 2.1.5 器具及处理 | 第21-22页 | 2.2 实验方法 | 第22-28页 | 2.2.1 亲虾暂养、处理与转录组样品采集 | 第22页 | 2.2.2 总RNA抽提 | 第22-23页 | 2.2.3 总RNA完整性和纯度检验 | 第23页 | 2.2.4 mRNA的纯化和cDNA文库构建 | 第23-24页 | 2.2.5 Illumina Hiseq2000平台测序 | 第24页 | 2.2.6 De novo组装 | 第24-25页 | 2.2.7 注释 | 第25页 | 2.2.8 性别特异表达和差异表达基因的鉴定 | 第25-26页 | 2.2.9 半定量和实时荧光定量PCR验证 | 第26-27页 | 2.2.10 SSR | 第27-28页 | 3 结果与分析 | 第28-46页 | 3.1 RNA质检结果 | 第28-29页 | 3.2 测序产量 | 第29页 | 3.3 序列分析与组装 | 第29-30页 | 3.4 转录组的完整度 | 第30-31页 | 3.5 注释 | 第31-36页 | 3.5.1 NR注释 | 第32-33页 | 3.5.2 COG注释 | 第33-34页 | 3.5.3 GO功能注释 | 第34-36页 | 3.5.4 代谢通路分析 | 第36页 | 3.6 性别差异基因鉴定和富集分析 | 第36-40页 | 3.7 性别差异基因的实时荧光定量PCR验证 | 第40-45页 | 3.8 SSRS | 第45-46页 | 4 讨论 | 第46-51页 | 4.1 性别决定基因 | 第46-47页 | 4.2 性腺分化和性腺发育相关基因 | 第47-50页 | 4.2.1 性腺组织的体细胞和生殖细胞形成 | 第47-48页 | 4.2.2 生殖细胞的RNA翻译调控 | 第48页 | 4.2.3 性腺差异表达基因 | 第48-50页 | 4.3 性别偏向表达基因的验证 | 第50页 | 4.4 SSR标记的鉴定 | 第50-51页 | 5 结论 | 第51-52页 | 参考文献 | 第52-58页 | 附录 | 第58-101页 | 致谢 | 第101-102页 | 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第102页 |
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