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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)亲虾性腺转录组分析及雌雄性腺差异表达基因鉴定
 
     论文目录
 
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 前言第12-21页
    1.1 凡纳滨对虾第12-13页
    1.2 转录组测序简介第13-14页
    1.3 转录组测序在对虾生物学研究中的应用第14页
    1.4 性别相关基因第14-19页
        1.4.1 性别决定基因第14-16页
        1.4.2 性腺分化和性腺发育相关基因第16-19页
    1.5 本研究的目的和意义第19-20页
    1.6 本研究的技术路线第20-21页
2 材料与方法第21-28页
    2.1 实验材料第21-22页
        2.1.1 凡纳滨对虾亲虾第21页
        2.1.2 主要仪器设备第21页
        2.1.3 主要试剂盒和试剂第21页
        2.1.4 相关溶液的配制方法第21页
        2.1.5 器具及处理第21-22页
    2.2 实验方法第22-28页
        2.2.1 亲虾暂养、处理与转录组样品采集第22页
        2.2.2 总RNA抽提第22-23页
        2.2.3 总RNA完整性和纯度检验第23页
        2.2.4 mRNA的纯化和cDNA文库构建第23-24页
        2.2.5 Illumina Hiseq2000平台测序第24页
        2.2.6 De novo组装第24-25页
        2.2.7 注释第25页
        2.2.8 性别特异表达和差异表达基因的鉴定第25-26页
        2.2.9 半定量和实时荧光定量PCR验证第26-27页
        2.2.10 SSR第27-28页
3 结果与分析第28-46页
    3.1 RNA质检结果第28-29页
    3.2 测序产量第29页
    3.3 序列分析与组装第29-30页
    3.4 转录组的完整度第30-31页
    3.5 注释第31-36页
        3.5.1 NR注释第32-33页
        3.5.2 COG注释第33-34页
        3.5.3 GO功能注释第34-36页
        3.5.4 代谢通路分析第36页
    3.6 性别差异基因鉴定和富集分析第36-40页
    3.7 性别差异基因的实时荧光定量PCR验证第40-45页
    3.8 SSRS第45-46页
4 讨论第46-51页
    4.1 性别决定基因第46-47页
    4.2 性腺分化和性腺发育相关基因第47-50页
        4.2.1 性腺组织的体细胞和生殖细胞形成第47-48页
        4.2.2 生殖细胞的RNA翻译调控第48页
        4.2.3 性腺差异表达基因第48-50页
    4.3 性别偏向表达基因的验证第50页
    4.4 SSR标记的鉴定第50-51页
5 结论第51-52页
参考文献第52-58页
附录第58-101页
致谢第101-102页
攻读学位期间发表的学术论文目录第102页

 
 
论文编号BS3190087,这篇论文共102
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