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小麦全长cDNA文库构建、测序与分析 |
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| 论文目录 |
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| 第一章 绪论 | 第1-43页 | | 1.植物功能基因组学研究进展 | 第14-19页 | | ·基因组学的概念 | 第14-15页 | | ·植物功能基因组学概述 | 第15页 | | ·植物功能基因组学主要研究内容 | 第15-16页 | | ·植物功能基因组学研究现状与发展趋势 | 第16页 | | ·植物功能基因组学研究技术与方法 | 第16-18页 | | ·小麦基因组学研究现状 | 第18-19页 | | 2.EST技术研究进展 | 第19-21页 | | ·EST的概念 | 第19-20页 | | ·EST的应用 | 第20-21页 | | ·用于基因表达分析和新基因的发掘 | 第20页 | | ·基因组作图 | 第20页 | | ·基因表达差异的研究 | 第20-21页 | | ·用于制备DNA芯片 | 第21页 | | ·寻找其它序列特征 | 第21页 | | ·重要农作物EST研究进展 | 第21页 | | 3 全长cDNA与全长cDNA文库的构建 | 第21-34页 | | ·普通cDNA文库 | 第22页 | | ·差减文库 | 第22-24页 | | ·差减文库的原理 | 第22-23页 | | ·差减cDNA文库的构建方法 | 第23-24页 | | ·均一化cDNA文库 | 第24页 | | ·全长cDNA文库 | 第24-34页 | | ·全长cDNA文库的特点 | 第25页 | | ·构建全长cDNA文库的方法及原理 | 第25-32页 | | ·重要生物全长cDNA克隆与测序研究进展 | 第32-34页 | | 4 生物信息学研究进展 | 第34-36页 | | ·生物信息学产生背景 | 第34页 | | ·生物信息学概念 | 第34页 | | ·生物信息学研究内容 | 第34-35页 | | ·生物信息学的应用 | 第35-36页 | | ·序列对比 | 第35页 | | ·新基因的发现和鉴定 | 第35页 | | ·基因组序列信息的提取和分析 | 第35-36页 | | ·蛋白质结构和功能的预测 | 第36页 | | ·分子进化研究 | 第36页 | | ·利用生物信息学软件寻找候选分子标记 | 第36页 | | ·电子拼接 | 第36页 | | 5 密码子使用偏爱性研究进展 | 第36-37页 | | 6 普通小麦的分类、起源与多倍体特性 | 第37-41页 | | ·小麦的分类 | 第37-38页 | | ·普通小麦的基因组起源 | 第38-39页 | | ·小麦基因组起源研究方法 | 第39页 | | ·小麦基因组起源研究的对象 | 第39-40页 | | ·小麦的多倍体特性 | 第40-41页 | | 7 实验设计 | 第41-43页 | | ·立项背景 | 第41页 | | ·小麦的起源与演化 | 第41页 | | ·大批量全长cDNA克隆是功能基因组学研究的重要战略资源 | 第41页 | | ·研究目的与实验内容 | 第41-42页 | | ·技术路线 | 第42-43页 | | 第二章 小麦全长cDNA文库构建 | 第43-67页 | | 1 材料与方法 | 第43-59页 | | ·试验材料 | 第43-46页 | | ·文库构建所用的小麦材料 | 第43-45页 | | ·化学试剂、酶类以及试剂盒 | 第45页 | | ·引物 | 第45-46页 | | ·试验方法 | 第46-59页 | | ·总RNA提取 | 第46页 | | ·mRNA分离纯化 | 第46-47页 | | ·第一链cDNA合成 | 第47-49页 | | ·生物素标记 | 第49-50页 | | ·全长cDNA的捕获 | 第50-52页 | | ·末端转移酶加poly(G) | 第52页 | | ·第二链合成 | 第52-53页 | | ·BsaⅠ酶切 | 第53页 | | ·cDNA纯化与分级 | 第53-54页 | | ·连接 | 第54页 | | ·包装 | 第54-55页 | | ·原始文库滴度检测 | 第55页 | | ·原始文库的扩增 | 第55-56页 | | ·噬粒环化 | 第56页 | | ·cDNA文库的单克隆保存 | 第56页 | | ·质粒文库的复制 | 第56页 | | ·质粒提取(96孔培养板) | 第56-57页 | | ·测序 | 第57-58页 | | ·全长cDNA判别 | 第58-59页 | | 2 结果分析 | 第59-63页 | | ·全长cDNA文库构建结果 | 第59-63页 | | ·总RNA提取及mRNA的分离纯化 | 第59页 | | ·cDNA文库滴度检测及库容量计算 | 第59-61页 | | ·插入片段检测 | 第61-62页 | | ·扩增文库的滴度检测 | 第62页 | | ·ABI 3730 XL DNA Analyzer测序体系确定 | 第62-63页 | | 3 讨论 | 第63-66页 | | ·mRNA质量是构建高质量全长cDNA文库的基础 | 第63页 | | ·关于全长库构建方法的选择 | 第63-64页 | | ·对Cap-Trapper法的改良 | 第64-66页 | | 1) 关于反转录引物选择 | 第64页 | | 2) 关于全长cDNA定向克隆问题 | 第64-65页 | | 3) 关于克隆插入方向问题 | 第65页 | | 4) 关于文库构建流程简化问题 | 第65页 | | 5) 关于构建过程中同位素示踪问题 | 第65-66页 | | 6) 关于蓝白斑选择问题 | 第66页 | | 本章结论 | 第66-67页 | | 第三章 小麦全长cDNA克隆大规模测序和序列的初步分析 | 第67-86页 | | ·概述 | 第67-69页 | | ·本研究整体思路 | 第67页 | | ·研究目标 | 第67页 | | ·研究工作流程 | 第67页 | | ·本地化生物信息分析平台构建 | 第67-69页 | | ·结果与分析 | 第69-82页 | | ·全长cDNA文库大规模测序 | 第69-70页 | | ·cDNA文库全长比例分析 | 第70-72页 | | ·大批量测序数据预处理 | 第72页 | | ·基于大规模全长cDNA序列的小麦基因GC含量分析 | 第72页 | | ·小麦基因密码子使用偏性分析 | 第72-75页 | | ·克隆的小麦全长cDNA中新基因的确定 | 第75-76页 | | ·小麦EST数据的GO注释 | 第76-79页 | | ·粗山羊草叶和根中差异表达基因分析 | 第79-81页 | | ·中国春可育花药与败育花药基因表达差异分析 | 第81页 | | ·不同倍性小麦基因表达特性 | 第81-82页 | | 4.讨论 | 第82-86页 | | ·关于重要物种全长cDNA克隆测序项目研究进展 | 第82页 | | ·关于本研究中全长cDNA文库和全长cDNA序列的应用 | 第82-83页 | | ·关于大批量EST数据的预处理问题 | 第83页 | | ·关于大规模EST数据的聚类拼接问题 | 第83-84页 | | ·关于全长cDNA序列的批量注释与功能分类 | 第84页 | | ·关于从大批量全长cDNA文库中挖掘差异表达基因 | 第84-85页 | | ·关于物种GC含量与最优密码子使用特性的分析 | 第85页 | | ·关于作为多倍体典型的小麦中基因表达情况 | 第85-86页 | | 全文结论 | 第86-87页 | | 参考文献 | 第87-100页 | | 致谢 | 第100-101页 | | 作者简介 | 第101页 |
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论文编号BS1275188，这篇论文共101页
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