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基于支持向量机方法的植物miRNA预测及小麦miRNA的克隆 |
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论文目录 |
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摘要 | 第1-6页 | ABSTRACT | 第6-12页 | 第一章 文献综述 | 第12-32页 | ·关于MIRNA 基因 | 第12-23页 | ·miRNA 的发现 | 第12-13页 | ·siRNA 及其与miRNA 之间的关系 | 第13页 | ·miRNA 的加工调控 | 第13-18页 | ·miRNA 的特点 | 第18页 | ·miRNA 的作用机制 | 第18-20页 | ·miRNA 的功能 | 第20-23页 | ·数据挖掘与支持向量机 | 第23-29页 | ·生物信息与数据挖掘 | 第23-24页 | ·统计学习理论与支持向量机 | 第24-26页 | ·SVM 的基本原理及其应用 | 第26-28页 | ·SVM 与神经网络的对比 | 第28-29页 | ·MIRNA 的实验克隆及计算识别 | 第29-30页 | ·miRNA 的克隆 | 第29页 | ·生物信息学分析 | 第29-30页 | ·本研究的目的及意义 | 第30-32页 | 第二章 基于支持向量机识别MIRNA 基因 | 第32-44页 | ·基于支持向量机识别MIRNA 的前体 | 第32-38页 | ·材料和方法 | 第32-34页 | ·结果 | 第34-37页 | ·讨论 | 第37-38页 | ·资源共享 | 第38页 | ·基于支持向量机方法分类5’和3’PRE-MIRNA | 第38-43页 | ·材料和方法 | 第38-39页 | ·结果 | 第39-42页 | ·讨论 | 第42-43页 | ·资源共享 | 第43页 | ·本章小结 | 第43-44页 | 第三章 植物MIRNA 的预测及其靶标分析 | 第44-78页 | ·水稻MIRNA 及其靶标的预测 | 第44-60页 | ·材料与方法 | 第44-47页 | ·结果与分析 | 第47-59页 | ·讨论 | 第59-60页 | ·mature_SVM 资源 | 第60页 | ·拟南芥MIRNA 的预测 | 第60-66页 | ·材料与方法 | 第60-61页 | ·结果 | 第61-66页 | ·讨论 | 第66页 | ·资源共享 | 第66页 | ·小麦MIRNA 及其靶标的预测 | 第66-76页 | ·材料与方法 | 第67-68页 | ·结果与分析 | 第68-75页 | ·讨论 | 第75-76页 | ·本章小结 | 第76-78页 | 第四章 小麦 MIRNA 的克隆及分析 | 第78-92页 | ·材料与方法 | 第78-83页 | ·小麦 | 第78页 | ·引物 | 第78页 | ·克隆载体及菌株 | 第78页 | ·培养基及其他溶液的配制 | 第78页 | ·小麦总 RNA 的提取 | 第78-79页 | ·小麦小分子量 RNA 的粗提 | 第79页 | ·小分子 RNA 的分离纯化 | 第79-80页 | ·3’端多聚腺苷化反应 | 第80-81页 | ·逆转录反应 | 第81页 | ·cDNA 链3'端的多聚鸟苷酸化反应 | 第81页 | ·PCR 扩增 | 第81-82页 | ·序列分析 | 第82页 | ·Northen Blot 杂交 | 第82页 | ·小 RNA 文库构建策略 | 第82-83页 | ·结果与分析 | 第83-91页 | ·总 RNA 的提取 | 第83-84页 | ·小分子量 RNA 的分离 | 第84页 | ·小分子量 RNA 的扩增 | 第84-86页 | ·小分子量 RNA 的克隆及筛选 | 第86页 | ·序列分析 | 第86-90页 | ·MiRNA 在小麦中的表达分析 | 第90-91页 | ·讨论 | 第91-92页 | 第五章 结论与创新点 | 第92-95页 | ·结论 | 第92-93页 | ·创新点 | 第93-95页 | 参考文献 | 第95-103页 | 附录1:RP-SVM 及 FS-SVM 的应用 | 第103-107页 | 附录2:17 个单一小分子RNA 的测序结果 | 第107-110页 | 附录3:缩略词中英文对照 | 第110-113页 | 致谢 | 第113-114页 | 作者简介 | 第114页 |
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