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当前位置:教育论文中心首页--博士论文--黄化与去黄化过程中拟南芥幼苗环化RNA表达与功能研究
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黄化与去黄化过程中拟南芥幼苗环化RNA表达与功能研究
 
     论文目录
 
摘要第3-5页
ABSTRACT第5-7页
主要符号对照表第13-15页
1 引言第15-35页
    1.1 环状RNA第15页
    1.2 circRNAs的发现第15-16页
        1.2.1 下一代测序技术第15页
        1.2.2 Ribonuclease R第15-16页
        1.2.3 circRNAs的生物信息学检测第16页
    1.3 circRNAs的生物起源与形成机制第16-22页
        1.3.1 首尾拼接和Pol Ⅱ转录偶联调节circRNAs的生物起源第17-18页
        1.3.2 核心剪接复合体调节circRNAs的生物起源第18页
        1.3.3 顺式元件调节circRNAs的生物起源第18-20页
        1.3.4 RBPs调节circRNAs生物起源第20-21页
        1.3.5 circRNAs的周转第21-22页
    1.4 circRNAs的功能第22-28页
        1.4.1 circRNAs在生理和病理条件下的作用第22-23页
        1.4.2 circRNAs的加工影响其线性同源物的剪接第23-24页
        1.4.3 细胞核中circRNAs调节转录和剪接第24-25页
        1.4.4 Micro RNA的海绵效应第25-26页
        1.4.5 调节结合蛋白质的活性第26页
        1.4.6 指导蛋白质的合成第26-27页
        1.4.7 驱动假基因的生成第27页
        1.4.8 生物标志物第27-28页
    1.5 植物circRNAs第28-33页
        1.5.1 circRNAs的检测第28页
        1.5.2 植物circRNAs的生物起源第28-31页
        1.5.3 植物circRNAs的功能第31-33页
            1.5.3.1 Micro RNA的海绵效应第31-32页
            1.5.3.2 参与应激反应第32页
            1.5.3.3 调控亲本基因表达第32-33页
            1.5.3.4 生物标志物第33页
    1.6 本论文的研究意义与研究内容第33-35页
        1.6.1 研究目的与意义第33页
        1.6.2 研究内容第33-35页
2 拟南芥暗/光形态建成中环状RNA表达模式的研究第35-50页
    2.1 材料与方法第36-39页
        2.1.1 实验材料第36页
            2.1.1.1 植物材料第36页
            2.1.1.2 主要试剂第36页
            2.1.1.3 实验设备与仪器第36页
        2.1.2 实验方法第36-39页
            2.1.2.1 RNA提取第36-37页
            2.1.2.2 制备circRNA文库第37-38页
            2.1.2.3 聚类和排序第38页
            2.1.2.4 数据分析第38-39页
            2.1.2.5 差异表达分析第39页
    2.2 结果与分析第39-48页
        2.2.1 circRNAs测序基本数据分析第39-40页
        2.2.2 circRNAs的识别第40-41页
        2.2.3 circRNAs的差异表达分析第41-46页
            2.2.3.1 circRNAs的筛选第41-42页
            2.2.3.2 GO富集分析第42-44页
            2.2.3.3 KEGG代谢通路分析第44-46页
        2.2.4 miRNA结合位点分析第46-48页
    2.3 结论与讨论第48-49页
    2.4 小结第49-50页
3 拟南芥叶绿体环状RNA的检测第50-61页
    3.1 材料与方法第51-54页
        3.1.1 实验材料第51页
            3.1.1.1 植物材料第51页
            3.1.1.2 主要试剂第51页
            3.1.1.3 实验设备与仪器第51页
        3.1.2 实验方法第51-54页
            3.1.2.1 RNA提取第51页
            3.1.2.2 cDNA合成第51-52页
            3.1.2.3 探针和引物设计第52-54页
            3.1.2.4 数字PCR第54页
            3.1.2.5 数据统计第54页
    3.2 结果与分析第54-59页
        3.2.1 拟南芥中叶绿体circRNAs的测序第54-56页
        3.2.2 数字PCR验证cp-circRNAs第56-57页
        3.2.3 黄化和脱黄化幼苗中cp-circRNAs的定量第57-58页
        3.2.4 Ath_circ_476及其亲本基因ycf5的定量第58-59页
    3.3 结论与讨论第59-60页
    3.4 小结第60-61页
4 拟南芥circRBCS的表达分析与功能研究第61-82页
    4.1 材料与方法第62-70页
        4.1.1 实验材料第62-63页
            4.1.1.1 植物材料第62页
            4.1.1.2 工程菌株第62页
            4.1.1.3 质粒第62页
            4.1.1.4 实验设备与仪器第62页
            4.1.1.5 主要试剂及配置第62-63页
        4.1.2 实验方法第63-70页
            4.1.2.1 植物总DNA的提取第63-64页
            4.1.2.2 RNA提取第64页
            4.1.2.2 cDNA的合成第64页
            4.1.2.3 circRNAs的PCR检测第64-65页
            4.1.2.4 circRNAs的荧光定量PCR检测第65-66页
            4.1.2.5 目的基因的克隆与纯化第66-68页
            4.1.2.6 植物表达重组质粒的构建第68-69页
            4.1.2.7 农杆菌感受态的制备与转化第69页
            4.1.2.8 拟南芥稳定遗传转化及转基因植株的筛选第69-70页
            4.1.2.9 图像与数据分析第70页
    4.2 结果与分析第70-79页
        4.2.1 RBCS基因的反义circRNAs第70-76页
            4.2.1.1 RBCS基因的反义circRNAs的验证第71-73页
            4.2.1.2 反义circRBCS的形成过程第73-74页
            4.2.1.3 反义circRBCS的组织特异性表达第74页
            4.2.1.4 光照对RBCS和circRBCS表达的影响第74-75页
            4.2.1.5 不同光受体突变体RBCS和circRBCS的表达第75-76页
        4.2.2 拟南芥circRBCS过表达分析第76-79页
            4.2.2.1 circRBCS过表达植株的鉴定第76页
            4.2.2.2 过表达植株的circRBCS和RBCS表达第76-77页
            4.2.2.3 过表达植株的表型分析第77-79页
    4.3 结论与讨论第79-81页
    4.4 小结第81-82页
5 circRNAs的体外合成第82-89页
    5.1 材料与方法第82-85页
        5.1.1 实验材料第82页
            5.1.1.1 植物材料第82页
            5.1.1.2 实验设备与仪器第82页
            5.1.1.3 主要试剂及配置第82页
        5.1.2 实验方法第82-85页
            5.1.2.1 RNA提取第82页
            5.1.2.2 cDNA的合成第82-83页
            5.1.2.3 DNA模板制备第83页
            5.1.2.4 体外转录第83-84页
            5.1.2.5 纯化与鉴定第84页
            5.1.2.6 体外环状第84-85页
            5.1.2.7 环状RNA回收第85页
    5.2 结果与分析第85-88页
        5.2.1 转录模板DNA的制备第85页
        5.2.2 转录第85-86页
        5.2.3 RNA环状第86-87页
        5.2.4 环状的鉴定第87-88页
    5.3 结论与讨论第88页
    5.4 小结第88-89页
6 结论与展望第89-91页
    6.1 结论第89-90页
    6.2 展望第90-91页
参考文献第91-108页
个人简介第108-109页
导师简介第109-113页
获得成果目录清单第113-114页
致谢第114页

 
 
论文编号BS4398639,这篇论文共114
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