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仿刺参(Apostichopus japonicus)微卫星标记的开发与应用
 
     论文目录
 
摘要第1-8页
ABSTRACT第8-15页
第一章 文献综述第15-40页
 第一节 分子标记技术及其在水产养殖中的应用第15-28页
     ·DNA 分子标记技术的类型及代表性分子标记技术简介第16-21页
       ·以分子杂交为基础的 DNA 标记技术第16-17页
       ·以 PCR 技术为核心的 DNA 标记技术第17-18页
       ·基于PCR 与限制性酶切技术结合的DNA 标记第18-19页
       ·以测序为基础的新型分子标记第19-21页
     ·DNA 分子标记在水产养殖中的研究应用概述第21-28页
       ·种群遗传结构与多样性分析第22-24页
       ·个体识别与亲缘关系分析第24-25页
       ·杂交育种第25-26页
       ·标记辅助选择(Marker Assisted Selection, MAS) 育种第26-28页
 第二节 水产养殖动物遗传连锁图谱构建的研究进展第28-36页
     ·遗传连锁图谱的作图原理第28-29页
     ·遗传连锁图谱构建的基本步骤第29-32页
       ·作图标记的选择第29-30页
       ·作图群体的建立第30-31页
       ·作图群体大小的确定第31页
       ·连锁分析第31-32页
     ·水产养殖动物遗传连锁图谱构建进展第32-36页
 第三节 仿刺参的遗传学研究概况第36-39页
     ·遗传多样性研究第37-38页
     ·遗传连锁图谱的构建第38-39页
 第四节 本研究的意义和目的第39-40页
第二章 仿刺参微卫星标记的筛选与评价第40-70页
 第一节 从EST 文库中筛选仿刺参的微卫星标记第42-51页
     ·实验材料第42页
     ·实验方法第42-45页
       ·DNA 的提取第42-43页
       ·仿刺参微卫星序列的查找与分析第43页
       ·引物的设计、优化和多态性检测第43-45页
     ·实验结果第45-49页
       ·微卫星DNA 序列筛查及聚类分析第45-47页
       ·引物设计及优化结果第47-48页
       ·位点主要遗传学参数的计算第48-49页
     ·讨论第49-51页
       ·利用EST 文库筛选仿刺参微卫星标记的可行性第49-50页
       ·EST 文库中微卫星的重复类型第50页
       ·EST-SSR 在应用上的优点第50-51页
 第二节 利用富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参的微卫星标记第51-70页
     ·实验材料第51页
       ·仿刺参样品第51页
       ·主要试剂和耗材第51页
     ·实验方法第51-60页
       ·基因组DNA 的提取与检测第51-52页
       ·富集文库的构建第52-59页
       ·序列的测定及测序结果的处理第59-60页
       ·微卫星位点的筛查第60页
     ·实验结果第60-65页
       ·基因组DNA 的提取第60-61页
       ·基因组 DNA 的酶切和回收第61页
       ·回收片段的平端接头连接第61-62页
       ·阳性克隆的扫描第62页
       ·序列分析和引物设计第62-64页
       ·微卫星位点的多态性分析第64-65页
     ·讨论第65-70页
       ·微卫星筛选方法比较第65-67页
       ·影响富集文库构建效率的因素第67-68页
       ·EST -SSRs 与Genomic-SSRs 的多态性比较第68-70页
第三章 全基因组扩增技术在仿刺参微卫星位点基因型检测中的应用第70-85页
 第一节 实验材料与实验方法第71-75页
     ·实验材料第71页
     ·实验方法第71-75页
       ·使用全基因组扩增试剂盒扩增子代幼虫DNA第71-72页
       ·MDA 技术应用于SSR 分型的灵敏度检测第72-73页
       ·MDA 技术应用于SSR 分型的准确率检测第73-75页
 第二节 实验结果第75-80页
     ·使用MDA 试剂盒扩增仿刺参幼虫DNA第75-76页
     ·MDA 技术应用于SSR 分型的灵敏度检测第76-77页
     ·MDA 技术应用于SSR 分型的准确率检测第77-80页
 第三节 讨论第80-85页
     ·多重置换扩增技术第80-81页
     ·MDA 技术应用于仿刺参幼虫基因组SSR 分型的可行性分析第81-83页
     ·MDA 技术在应用于微卫星位点检测时产生错误扩增的可能原因第83-85页
第4章 微卫星标记在仿刺参家系鉴定中的应用第85-101页
 第一节 实验材料与实验方法第86-91页
     ·实验材料第86-87页
       ·仿刺参家系构建第86-87页
       ·基因组DNA 的获得第87页
     ·实验方法第87-91页
       ·PCR 扩增及扩增片段检测第87-88页
       ·家系鉴定分析第88-91页
 第二节 实验结果第91-98页
     ·微卫星位点在亲本中的扩增第91-92页
     ·模拟分析第92-95页
     ·微卫星鉴定准确率第95页
     ·混养家系的鉴定第95-98页
 第三节 讨论第98-101页
     ·仿刺参的亲子鉴定第98-99页
     ·模拟分析与实际检验第99页
     ·影响亲子鉴定准确率的因素第99-101页
第五章 仿刺参微卫星遗传连锁图谱的构建第101-116页
 第一节 实验材料与方法第102-106页
     ·作图家系构建第102页
     ·基因组DNA 的提取第102页
     ·微卫星标记分析第102-104页
     ·连锁分析与作图第104-106页
       ·图谱的构建第104-105页
       ·遗传图谱预期长度和覆盖率的计算第105-106页
 第二节 实验结果第106-112页
     ·微卫星标记分析第106页
     ·连锁图谱概况第106-112页
 第三节 讨论第112-116页
     ·用于连锁图谱构建的标记第112页
     ·以仿刺参幼虫为材料构建遗传连锁图谱第112-113页
     ·连锁群数目与单倍染色体数目第113页
     ·偏分离标记第113-114页
     ·无效等位基因第114-116页
第六章 总结第116-118页
参考文献第118-132页
附表 本文开发的仿刺参的微卫星标记第132-158页
攻读博士学位期间完成的论文、申请的专利和获得的奖励第158-159页
致谢第159页

 
 
论文编号BS2841,这篇论文共159
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