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干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)转录组分析
 
     论文目录
 
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 引言第11-21页
    1.1 研究目的和意义第11页
    1.2 植物抗旱生理生化研究进展第11-13页
        1.2.1 渗透调节物质、植物激素与植物的抗旱性第11-12页
        1.2.2 植物抗氧化系统应对干旱胁迫的研究第12-13页
    1.3 植物干旱胁分子机理研究第13-14页
        1.3.1 干旱胁迫信号的转导第13页
        1.3.2 植物通过干旱胁迫信号诱导基因进行表达第13页
        1.3.3 转录水平上干旱胁迫应答基因的调节和控制第13-14页
    1.4 甜高粱研究进展第14-15页
        1.4.1 甜高粱抗旱性研究进展第14-15页
        1.4.2 甜高粱作为能源作物的研究第15页
    1.5 转录组测序技术第15-17页
        1.5.1 转录组的定义第16页
        1.5.2 高通量测序第16-17页
    1.6 转录组测序研究进展第17-19页
        1.6.1 单细胞转录组分析第18页
        1.6.2 转录组测序确定RNA结构第18-19页
        1.6.3 高通量测序在植物抗逆方面的研究第19页
    1.7 高通量测序技术的前景第19-20页
    1.8 新一代测序技术第20-21页
2 实验设计与方法第21-25页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 植物材料第21-22页
        2.1.2 主要仪器设备和实验试剂第22页
        2.1.3 总RNA的提取第22-23页
        2.1.4 总RNA的检测第23页
    2.2 RNA文库构建和HiSeq2500测序第23-25页
        2.2.1 RNA文库构建第23页
        2.2.2 文库质控第23页
        2.2.3 上机测序第23-25页
3 结果分析第25-63页
    3.1 生物信息学分析第25-40页
        3.1.1 RNA样品及测序数据质量控制第25-30页
        3.1.2 甜高粱高通量转录组测序数据组装第30-33页
        3.1.3 评估甜高粱高通量转录组测序文库质量第33-35页
        3.1.4 Unigene功能注释第35-36页
        3.1.5 基因结构分析第36-40页
    3.2 干旱胁迫下甜高粱基因表达量分析第40-42页
        3.2.1 Unigene表达量计算第40页
        3.2.2 甜高粱基因表达量总体分布第40-42页
    3.3 干旱胁迫下甜高粱基因的差异表达分析第42-51页
        3.3.1 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因筛选第42-44页
        3.3.2 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因聚类分析第44-51页
    3.4 干旱胁迫下甜高粱DEG功能注释和富集分析第51-61页
        3.4.1 干旱胁迫下甜高粱差异表达基因GO功能富集第52-55页
        3.4.2 差异表达基因COG分类第55-57页
        3.4.3 差异表达基因KEGG注释第57-58页
        3.4.4 差异表达基因KEGG通路富集分析第58-61页
    3.5 qRT-PCR第61-63页
4 讨论第63-79页
    4.1 干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)的聚类结果分析第63-65页
    4.2 差异表达基因的GO富集分析第65-67页
    4.3 差异表达基因的COG富集分析第67-68页
    4.4 干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)干旱响应重要的Pathway第68-79页
5 结论第79-81页
参考文献第81-89页
附录第89-91页
    附录A 图3-15具体类目第89-90页
    附录B 软件列表第90-91页
致谢第91-92页

 
 
论文编号BS3978793,这篇论文共92
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