| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 前言 | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 植物花色素研究进展 | 第11-18页 |
| 1.1.1 主要的植物花色素 | 第11页 |
| 1.1.2 花色素合成分子机理研究进展 | 第11-12页 |
| 1.1.3 类胡萝卜素代谢途径研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.4 甜菜素生物合成途径研究进展 | 第13-14页 |
| 1.1.5 植物花色素间关系的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.1.6 植物花斑形成分子机理的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.1.7 三色堇色斑形成分子机理的研究进展 | 第17-18页 |
| 1.2 转录组测序技术(RNA-Seq)研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.1 转录组测序 | 第18页 |
| 1.2.2 测序技术的发展 | 第18-19页 |
| 1.2.3 转录组测序技术及其应用 | 第19-20页 |
| 1.3 研究目的及意义 | 第20-21页 |
| 1.4 技术路线 | 第21-22页 |
| 2 转录组测序 | 第22-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第22页 |
| 2.1.2 主要试剂及药品 | 第22页 |
| 2.1.3 三色堇总RNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.1.4 总RNA质量检测 | 第23-24页 |
| 2.1.5 三色堇转录组de novo测序 | 第24-25页 |
| 2.2 三色堇de novo转录组测序结果分析 | 第25-36页 |
| 2.2.1 RNA样品的提取与检测 | 第25-26页 |
| 2.2.2 原始序列数据评估及预处理 | 第26-29页 |
| 2.2.3 转录组测序的de novo拼接 | 第29-30页 |
| 2.2.4 转录组基因功能注释 | 第30-33页 |
| 2.2.5 SNP和SSR标记 | 第33-36页 |
| 2.3 转录组测序章节小结 | 第36-37页 |
| 3 三色堇花色相关基因的挖掘与分析 | 第37-50页 |
| 3.1 材料与方法 | 第37-40页 |
| 3.1.1 供试材料 | 第37页 |
| 3.1.2 主要试剂及药品 | 第37页 |
| 3.1.3 三色堇不同花色色斑区及非色斑区RNA的提取 | 第37-38页 |
| 3.1.4 花色相关基因的挖掘及分析 | 第38页 |
| 3.1.5 逆转录 | 第38-39页 |
| 3.1.6 花色素各结构基因的半定量引物设计 | 第39-40页 |
| 3.1.7 三色堇花色素结构基因半定量扩增体系及程序 | 第40页 |
| 3.2 结果与分析 | 第40-49页 |
| 3.2.1 三色堇不同花色色斑区及非色斑区RNA的提取 | 第40-41页 |
| 3.2.2 三色堇花色代谢基因的挖掘及分析 | 第41-46页 |
| 3.2.3 花色结构基因在三色堇不同花色的色斑区及非色斑区的表达 | 第46-49页 |
| 3.3 三色堇花色相关基因的挖掘与分析章节小结 | 第49-50页 |
| 3.3.1 花色相关基因的挖掘 | 第49页 |
| 3.3.2 各结构基因在不同花色中的差异性表达分析 | 第49-50页 |
| 4 三色堇ANS和DFR基因gDNA的克隆及FPNI-PCR反应体系优化 | 第50-60页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第50-56页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第50页 |
| 4.1.2 主要仪器设备及试剂 | 第50-51页 |
| 4.1.3 三色堇关键基因ANS和DFR gDNA全长克隆 | 第51页 |
| 4.1.4 PCR产物目的片段回收 | 第51页 |
| 4.1.5 PCR产物目的片段TA克隆 | 第51-52页 |
| 4.1.6 PCR产物目的片段测序 | 第52页 |
| 4.1.7 三色堇ANS和DFR基因生物信息学分析 | 第52-53页 |
| 4.1.8 FPNI-PCR反应体系的优化 | 第53-56页 |
| 4.2 结果与分析 | 第56-59页 |
| 4.2.1 三色堇总DNA的提取 | 第56-57页 |
| 4.2.2 三色堇Vw ANS和Vw DFR基因gDNA全长扩增 | 第57-58页 |
| 4.2.3 FPNI-PCR反应体系的优化 | 第58-59页 |
| 4.3 三色堇ANS和DFR基因gDNA的克隆及FPNI-PCR反应体系优化章节小结 | 第59-60页 |
| 5 讨论 | 第60-64页 |
| 5.1 三色堇de novo转录组测序结果讨论 | 第60页 |
| 5.2 转录组花色相关基因的挖掘分析 | 第60-61页 |
| 5.3 半定量试验结果讨论 | 第61-64页 |
| 5.3.1 DFR基因 | 第61-62页 |
| 5.3.2 F3'5'H基因 | 第62-63页 |
| 5.3.3 F3'H基因 | 第63-64页 |
| 6 展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-72页 |
| 在读期间与课题有关的研究成果 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 附表1 | 第74页 |
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