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当前位置:教育论文中心首页--硕士论文--北部湾石油降解菌的多样性分析与咸水球形菌(Salinisphaera)的系统进化及烷烃降解基因研究
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北部湾石油降解菌的多样性分析与咸水球形菌(Salinisphaera)的系统进化及烷烃降解基因研究
 
     论文目录
 
摘要第1-15页
Abstract第15-17页
1 前言第17-43页
   ·海洋石油污染的生物修复第17-20页
     ·海洋石油污染的现状和危害第17-18页
     ·石油进入海洋后的行为和归宿第18-19页
     ·生物修复在海洋石油污染治理中的应用第19-20页
   ·微生物分子生态学研究方法第20-26页
     ·微生物多样性研究的传统方法第20页
     ·微生物多样性研究的现代方法第20-21页
     ·分子生物学技术在海洋微生物多样性研究中的应用第21-26页
   ·海洋石油烃降解微生物及其多样性第26-30页
     ·海洋石油烃降解微生物的研究进展第26-28页
     ·咸水球形菌(salinisphaera)的研究概况第28-30页
   ·细菌的分类与鉴定第30-35页
     ·形态学和生理生化特征第31页
     ·16S rRNA 序列分析第31-32页
     ·促旋酶(gyrase)的 B 亚单位基因gyrB 在细菌分类中的应用第32-33页
     ·脂肪酸分析在细菌鉴定中的应用第33页
     ·DNA 碱基比例(G+C mol%)第33-34页
     ·DNA-DNA 杂交第34-35页
   ·烷烃羟化酶的研究进展第35-40页
     ·烷烃羟化酶催化底物降解途径的多样性第35-36页
     ·烷烃羟化酶系统的多样性及其催化机理第36-38页
     ·膜结合的烷烃羟化酶(AlkB)的研究进展第38页
     ·细胞色素P450 烷烃羟化酶的研究进展第38-40页
     ·长链烷烃单加氧酶(almA,LadA)的研究进展第40页
   ·微生物基因组学研究进展第40-41页
     ·微生物基因组测序进展第40-41页
     ·海洋环境及微生物基因组学研究进展第41页
   ·本文的研究目的及意义第41-43页
2 材料与方法第43-67页
   ·材料第43-47页
     ·样品来源第43页
     ·试剂和药品第43-44页
     ·分子生物学用酶第44页
     ·分子生物学试剂盒和试剂条第44页
     ·主要仪器第44-45页
     ·本研究中使用的培养基和溶液第45-46页
     ·本研究中使用的引物第46-47页
     ·分析软件第47页
   ·基本方法第47-51页
     ·细菌单菌DNA 的提取第47-48页
     ·感受态细胞的制备第48-49页
     ·PCR 反应体系第49页
     ·PCR 扩增程序第49页
     ·PCR 产物纯化第49-50页
     ·琼脂糖凝胶上的DNA 片段的回收第50页
     ·连接反应第50-51页
     ·质粒的化学转化第51页
     ·菌落PCR第51页
   ·海洋石油降解菌的富集、分离和鉴定第51-57页
     ·筛选培养基、石油降解菌的富集和筛选第51-52页
     ·16S rDNA 的鉴定与系统发育树的构建第52页
     ·一株烷烃降解菌F44-8 的系统分类与鉴定第52-57页
   ·咸水球形菌(Salinisphaera)烷烃羟化酶(alkB)基因的克隆及其系统进化关系的分析第57-61页
     ·菌株的选择和培养第57-58页
     ·生理生化特性的测定第58页
     ·16S rRNA 基因和看家基因gyrB 的PCR 扩增与测序第58页
     ·BOX-PCR 扩增与分析第58页
     ·烷烃羟化酶(alkB)基因的扩增与测序第58-59页
     ·烷烃降解能力的定性和定量分析第59-61页
   ·Salinisphaera sp. C84B14 基因组测序及功能基因的初步分析第61-67页
     ·基因组DNA 的制备与测序第61-63页
     ·菌株的诱导培养条件第63页
     ·总RNA 的抽提及纯化第63-64页
     ·RT-PCR(Reverse transcript PCR)第64-67页
3 结果与讨论第67-116页
   ·北部湾石油降解菌的富集、分离、鉴定及其多样性分析第67-79页
     ·北部湾沉积物石油降解菌的富集、分离和鉴定第67-77页
       ·降解菌群中可培养菌的分离及鉴定第67页
       ·17 个油降解菌群中可培养菌的组成第67-72页
       ·降解菌群中可培养菌株的系统进化分析第72-75页
       ·常见细菌在各个菌群中的分布第75-76页
       ·可能的细菌新种第76-77页
     ·讨论第77-79页
   ·一株烷烃降解菌F44-8 的系统分类与鉴定第79-88页
     ·结果与分析第79-87页
       ·菌株的分离第79页
       ·16S rDNA 的序列比较分析第79-80页
       ·新菌的表型分析第80-82页
       ·新菌的生理生化特性的分析第82-83页
       ·G+C mol%含量第83页
       ·脂肪酸组成分析第83-86页
       ·菌株 F44-8T 醌成分分析第86页
       ·烷烃利用范围的定性分析第86页
       ·F44-8T 新种的描述第86-87页
     ·讨论第87-88页
   ·咸水球形菌(Salinisphaera)烷烃羟化酶(alkB)基因的克隆及 其系统进化关系的分析第88-104页
     ·结果与讨论第88-102页
       ·菌株的选择及培养第88-89页
       ·12 株咸水球形菌(Salinisphaera)和三株模式种的生理生化特性的比较分 析第89-91页
       ·以16S rDNA 序列为基础的系统进化分析第91-93页
       ·以看家基因gyrB 为基础的系统进化分析第93-95页
       ·以BOX-PCR 为基础的比较分析第95-97页
       ·以烷烃羟化酶(alkB)基因为基础的多样性分析第97-100页
       ·烷烃降解能力的定性和定量分析第100-102页
     ·讨论第102-104页
   ·Salinisphaera sp. C84B14 功能基因的初步分析第104-116页
     ·结果与讨论第104-114页
       ·菌株的选择第104页
       ·Salinisphaera sp. C84B14 基因组概况第104-106页
       ·基因组中与烷烃降解相关的功能基因的初步分析第106-107页
       ·基因组中功能基因的RT-PCR 初步验证第107-111页
       ·基因组中烷烃单加氧酶(Alkane 1-monooxygenase)基因簇的分析第111-112页
       ·基因组中依赖 FMNH2 的单加氧酶(FMNH2-dependent monooxygenase) 基因簇的分析第112-114页
     ·讨论第114-116页
4 小结与展望第116-119页
参考文献第119-131页
致谢第131-132页
附录第132页

 
 
论文编号BS258494,这篇论文共132
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