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当前位置:教育论文中心首页--硕士论文--Ⅰ型细胞因子信号与变构效应的关系:IL-21受体动力学模似和IL-2变构区域预测
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Ⅰ型细胞因子信号与变构效应的关系:IL-21受体动力学模似和IL-2变构区域预测
 
     论文目录
 
摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第11-24页
    1.1 研究背景第11-14页
    1.2 Ⅰ型细胞因子受体激活的共同模型第14-16页
    1.3 分子动力学模拟第16-20页
    1.4 表面等离子共振技术表征生物分子作用第20-24页
第二章 IL-21受体跨膜区螺旋二聚化第24-35页
    2.1 引言第24页
    2.2 方法与体系第24-26页
        2.2.1 结构准备第24-25页
        2.2.2 粗粒化分子动力学模拟第25页
        2.2.3 粗粒化模型转化为全原子模型第25-26页
        2.2.4 全原子分子动力学模拟第26页
    2.3 结果与讨论第26-33页
        2.3.1 粗粒化动力学模拟细胞因子IL-21受体跨膜区的二聚化行为第26-29页
        2.3.2 全原子分子动力学模拟优化二聚体结构第29-33页
    2.4 本章小结第33-35页
第三章 细胞膜参与调节IL-21Rγ受体胞内域结构第35-48页
    3.1 引言第35-36页
    3.2 方法与体系第36-38页
        3.2.1 结构准备第36页
        3.2.2 体系的构建第36页
        3.2.3 基于全原子模型的分子动力学模拟第36-37页
        3.2.4 基于粗粒化模型的分子动力学模拟第37页
        3.2.5 表面等离子共振试验第37-38页
    3.3 结果与讨论第38-46页
        3.3.1 IL-21Rγ受体胞内域序列分析第38-39页
        3.3.2 IL-21Rγ受体胞内域结构预测第39-40页
        3.3.3 全原子分子动力学模拟IL-21Ry受体胞内域与POPG磷脂双分子层作用第40-42页
        3.3.4 粗粒化分子动力学模拟IL-21Rγ受体胞内域与POPG磷脂双分子层作用第42-43页
        3.3.5 促使IL-21Rγ受体胞内域与细胞膜作用的关键残基第43-45页
        3.3.6 表面等离子共振检测IL-21Rγ受体胞内域蛋白与磷脂的作用第45-46页
    3.4 本章小结第46-48页
第四章 鉴定残基突变引起的蛋白质远程结构变化第48-71页
    4.1 引言第48-50页
    4.2 方法与体系第50-53页
        4.2.1 COREX算法简述第50-51页
        4.2.2 动力学相关性分析第51页
        4.2.3 蛋白质中氨基酸作用网络分析第51-52页
        4.2.4 协作效应分析第52页
        4.2.5 残基动力学互相关分析第52-53页
    4.3 结果与讨论第53-68页
        4.3.1 通过分子动力学模拟检测的CypA中的互相关模式与核磁实验检测到的动态网络相符第53-54页
        4.3.2 CypA的协作网络也与实验检测到的动态网络一致第54-56页
        4.3.3 互相关分析法确定IL-2中的动态网络第56-61页
        4.3.4 COREX/BEST算法计算出蛋白质IL-2中的动态网络第61-62页
        4.3.5 在IL-2中计算的动态网络与由突变引起的结构改变的区域相一致第62-63页
        4.3.6 IL-2中变构路径的鉴定第63-64页
        4.3.7 超级细胞因子中的大多数突变残基是作用网络中的关键位点第64-65页
        4.3.8 通过纳秒级时间尺度的分子动力学模拟识别远程结构效应第65-68页
    4.4 本章小结第68-71页
结论与展望第71-72页
参考文献第72-78页
硕士期间的科研成果第78-79页
致谢第79页

 
 
论文编号BS4729344,这篇论文共79
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