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当前位置:教育论文中心首页--硕士论文--褐飞虱若虫均一化全长cDNA文库的构建及EST分析
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褐飞虱若虫均一化全长cDNA文库的构建及EST分析
 
     论文目录
 
摘要第1-10页
Abstract第10-12页
1 前言第12-37页
   ·褐飞虱的研究进展第12-16页
     ·褐飞虱对水稻的危害第12页
     ·褐飞虱研究进展第12-16页
       ·宏观生物学研究进展第13-15页
       ·微观生物学研究进展第15-16页
   ·cDNA文库构建的研究进展第16-27页
     ·构建cDNA文库的意义第16页
     ·cDNA文库的用途第16页
     ·全长cDNA文库构建方法研究进展第16-23页
       ·SMART法第17-19页
       ·Oligo-capping法第19页
       ·CAPture法第19-21页
       ·Cap-trapper法第21-23页
     ·均一化文库构建研究进展第23-27页
       ·cDNA样品与基因组 DNA饱和杂交法第23-25页
       ·复性式均一化法第25-27页
   ·EST技术研究概况第27-35页
     ·EST的概念及研究进展第27-30页
     ·EST的应用第30-32页
       ·构建基因组图谱第30页
       ·分离与鉴定新基因第30-31页
       ·用于基因表达谱的研究第31页
       ·制备 DNA芯片第31-32页
     ·生物信息学在 EST分析中的应用第32-35页
       ·生物信息学概述第32页
       ·生物信息学数据库第32-33页
       ·生物信息学在 EST数据分析中的作用第33-35页
         ·生物信息学分析软件第33-34页
         ·生物信息学技术在 EST数据分析中的应用第34-35页
   ·本研究的目的和意义第35-37页
2 材料与方法第37-57页
   ·试验材料第37-38页
     ·供试昆虫第37页
     ·EST分析材料第37页
     ·主要试剂第37页
     ·主要仪器第37-38页
     ·所用引物序列第38页
   ·试验方法第38-57页
     ·褐飞虱若虫总 RNA的提取第38-40页
       ·试验材料预处理第38页
       ·Trizol试剂提取总 RNA第38-40页
       ·总 RNA的浓度测定和质量鉴定第40页
     ·非均一化cDNA文库的构建第40-47页
       ·第一链cDNA的合成第40页
       ·LD-PCR进行cDNA第二条链的合成第40-41页
       ·蛋白酶 K消化第41-42页
       ·Sfil酶切消化第42页
       ·cDNA片段分级分离第42-43页
       ·cDNA与载体λTripl-Ex2连接并包装第43-44页
       ·未扩增文库滴度测定第44页
       ·重组克隆效率的确定第44页
       ·文库扩增及滴度测定第44-45页
       ·噬菌体文库环化成质粒文库第45页
       ·插入片段长度鉴定第45-47页
       ·测序鉴定文库质量第47页
     ·均一化cDNA文库的构建第47-55页
       ·第一链cDNA的合成第48页
       ·LD-PCR进行双链cDNA的合成第48-49页
       ·PCR产物纯化第49页
       ·均一化处理第49-53页
         ·DSN的稀释第49-50页
         ·杂交第50页
         ·DSN处理第50-51页
         ·均一化cDNA的第一次 PCR扩增第51-52页
         ·均一化cDNA的第二次 PCR扩增第52-53页
       ·Sfil酶切第53页
       ·目的片段回收第53-54页
       ·连接转化第54页
       ·均一化文库质量的检测第54-55页
         ·文库滴度测定第54页
         ·文库插入片段长度及重组率鉴定第54-55页
         ·文库均一化效果鉴定第55页
     ·EST的生物信息学分析方法第55-57页
       ·EST序列的处理及聚类拼接第55-56页
       ·同源性比对及功能分析第56-57页
3 结果与分析第57-70页
   ·褐飞虱若虫总 RNA的提取第57页
   ·非均一化cDNA文库构建的结果与分析第57-60页
     ·褐飞虱若虫cDNA的合成及扩增第57-58页
     ·cDNA分级分离第58页
     ·文库滴度与重组百分率第58-59页
     ·扩增后文库的滴度第59页
     ·质粒文库的酶切鉴定第59页
     ·测序结果第59-60页
   ·均一化cDNA文库构建的结果与分析第60-63页
     ·LD-PCR合成双链cDNA第60页
     ·均一化处理结果第60-62页
     ·文库质量鉴定第62-63页
   ·EST的生物信息学分析结果第63-70页
     ·测序结果拼接分析第63-64页
     ·EST序列同源性比较及基因功能分析第64-66页
       ·与NCBI的核苷酸数据库比对(BLASTn)结果第64页
       ·与NCBI的蛋白质数据库比对(BLASTx)结果第64-66页
     ·与褐飞虱生长发育可能有显著影响的基因第66-70页
4 讨论第70-76页
   ·褐飞虱总 RNA的提取第70页
   ·两种 SMART技术建库方法的比较第70-71页
   ·Creator SMART技术和 DSN均一化相结合方法的优点第71-72页
   ·全长cDNA文库的质量评价第72-74页
   ·EST测序起点的选择第74页
   ·BLASTn和 BLASTx比对分析结果差异第74-75页
   ·与褐飞虱 EST库的比对第75页
   ·褐飞虱重要基因的研究第75-76页
参考文献第76-92页
致谢第92页

 
 
论文编号BS588194,这篇论文共92
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