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基于通路的全基因组关联分析策略应用于西门塔尔牛的初步研究
 
     论文目录
 
摘要第5-6页
Abstract第6页
英文缩略表第9-12页
第一章 引言第12-17页
    1.1 全基因组关联分析及其局限性第12-13页
    1.2 后基因组时代全基因组关联研究的深度策略和方法第13-14页
        1.2.1 基因型填充(Imputation)第13-14页
        1.2.2 基因-基因的交互分析第14页
    1.3 基于生物学通路的全基因组关联分析第14-16页
        1.3.1 基于通路的全基因组关联分析的研究进展第14-15页
        1.3.2 基于通路的全基因组关联分析的算法第15-16页
    1.4 本研究的目的和意义第16-17页
第二章 材料与方法第17-22页
    2.1 试验材料第17页
        2.1.1 实验动物第17页
        2.1.2 血样采集及芯片测序第17页
    2.2 试验方法第17-22页
        2.2.1 性状表型记录第17-18页
        2.2.2 芯片数据质量控制第18页
        2.2.3 表型校正第18-19页
        2.2.4 信号通路的来源和选择标准第19页
        2.2.5 群体分层与协变量校正第19页
        2.2.6 基于通路的全基因组关联分析第19-22页
            2.2.6.1 主成分矩阵的构建第20页
            2.2.6.2 关联分析第20页
            2.2.6.3 通路富集分析第20-22页
第三章 结果与分析第22-32页
    3.1 SNP基因型信息和质量控制结果第22页
    3.3 表型性状的描述性统计量第22-23页
    3.4 群体遗传分布第23-24页
    3.5 基于通路的全基因组关联分析结果第24-30页
        3.5.1 宰前活重性状的基于通路的全基因组关联分析结果第24-27页
        3.5.2 眼肌面积性状的基于通路的全基因组关联分析结果第27-30页
    3.6 最显著P值法的比较结果第30-32页
第四章 讨论第32-34页
    4.1 基于通路的全基因组关联分析的算法第32页
    4.2 基于通路的全基因组关联分析的应用第32-34页
第五章 全文结论第34-35页
参考文献第35-41页
附 录第41-46页
致谢第46-47页
作者简历第47页

 
 
论文编号BS2787446,这篇论文共47
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