摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
英文缩写词 | 第10-17页 |
第1章 绪论 | 第17-41页 |
1.1 研究背景 | 第17页 |
1.2 蛋白激酶CK2 | 第17-22页 |
1.2.1 CK2激酶的生物学功能与相关疾病 | 第17-19页 |
1.2.2 CK2激酶的整体结构特征 | 第19-22页 |
1.3 蛋白激酶CK2抑制剂概述 | 第22-37页 |
1.3.1 ATP竞争性抑制剂 | 第22-36页 |
1.3.2 非ATP竞争性抑制剂 | 第36-37页 |
1.4 计算机辅助药物设计方法概述 | 第37-40页 |
1.4.1 三维定量构效关系(3D-QSAR) | 第37-38页 |
1.4.2 分子对接 | 第38-39页 |
1.4.3 分子动力学模拟 | 第39-40页 |
1.5 本文主要研究内容 | 第40-41页 |
第2章 三环喹啉类抑制剂三维定量构效关系及动力学稳定性研究 | 第41-57页 |
2.1 引言 | 第41-42页 |
2.2 三维定量构效关系及分子动力学模拟研究 | 第42-46页 |
2.2.1 数据集与生物活性 | 第42-44页 |
2.2.2 化合物药效构象及叠合策略 | 第44页 |
2.2.3 三维定量构效关系模型的建立 | 第44-45页 |
2.2.4 分子动力学模拟 | 第45-46页 |
2.3 结果与讨论 | 第46-55页 |
2.3.1 分子对接分析 | 第46-47页 |
2.3.2 CoFMA与CoMSIA模型的统计学结果 | 第47-50页 |
2.3.3 基于CoMFA模型的三维等值线图分析 | 第50-51页 |
2.3.4 基于CoMSIA模型的三维等值线图分析 | 第51-52页 |
2.3.5 分子动力学模拟研究 | 第52-55页 |
2.4 本章小结 | 第55-57页 |
第3章 羧酸及吡啶基团影响三环喹啉类化合物抑制活性的结构机制研究 | 第57-77页 |
3.1 引言 | 第57-58页 |
3.2 分子对接及分子动力学比较研究 | 第58-59页 |
3.2.1 体系的构建和分子对接 | 第58-59页 |
3.2.2 分子动力学模拟 | 第59页 |
3.2.3 MM-PB/GBSA计算 | 第59页 |
3.3 结果与讨论 | 第59-75页 |
3.3.1 分子对接分析 | 第59-62页 |
3.3.2 模拟体系的全局结构特征 | 第62-65页 |
3.3.3 结合模式比较分析 | 第65-69页 |
3.3.4 结合自由能分析 | 第69页 |
3.3.5 残基能量分解 | 第69-70页 |
3.3.6 抑制剂与CK2α 柔性变化区域间的变构调节机制 | 第70-75页 |
3.4 本章小结 | 第75-77页 |
第4章 蛋白激酶CK2抑制剂 7-羟基香豆素结构优化 | 第77-95页 |
4.1 引言 | 第77-78页 |
4.2 实验方法和材料 | 第78-82页 |
4.2.1 实验材料和仪器 | 第78-79页 |
4.2.2 氟代7羟基香豆素衍生物的合成 | 第79-80页 |
4.2.3 氟代7羟基香豆素衍生物的生物活性测试 | 第80-82页 |
4.2.4 分子对接 | 第82页 |
4.3 结果与讨论 | 第82-93页 |
4.3.1 7-羟基香豆素衍生物定向铰链区的优化 | 第82-86页 |
4.3.2 氟代7羟基香豆素衍生物抑制CK2激酶活性的能力研究 | 第86-89页 |
4.3.3 氟代7羟基香豆素衍生物抑制肿瘤细胞增殖能力的研究 | 第89-90页 |
4.3.4 氟代7羟基香豆素衍生物清除DPPH自由基能力的研究 | 第90-93页 |
4.4 本章小结 | 第93-95页 |
第5章 环肽抑制剂阻断CK2α/CK2β 相互作用的机理研究 | 第95-113页 |
5.1 引言 | 第95-96页 |
5.2 比较分子动力学模拟研究 | 第96-98页 |
5.2.1 分子动力学模拟 | 第96-97页 |
5.2.2 MM-GBSA计算 | 第97页 |
5.2.3 主成分分析和动态相关性矩阵 | 第97-98页 |
5.3 结果与讨论 | 第98-112页 |
5.3.1 整体结构特征 | 第98-102页 |
5.3.2 野生型和突变体系结合模式的比较分析 | 第102-110页 |
5.3.3 能量分析 | 第110-112页 |
5.4 本章小结 | 第112-113页 |
结论 | 第113-117页 |
参考文献 | 第117-133页 |
攻读博士学位期间所发表的学术论文 | 第133-135页 |
致谢 | 第135页 |