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谷子与锈菌互作的转录组和表达谱研究及相关基因表达分析

论文目录

摘要	第4-6页
ABSTRACT	第6-8页
引言	第12-13页
1 文献综述	第13-22页
1.1 谷子锈病研究概述	第13-16页
1.1.1 谷子锈病病原菌	第13-14页
1.1.2 谷子锈病的发生及其危害	第14页
1.1.3 谷子锈病发生的流行规律及其发病条件	第14-15页
1.1.4 谷子锈病的防治	第15-16页
1.2 病原菌与寄主间的相互作用	第16-18页
1.2.1 病程相关基因	第16页
1.2.2 蛋白激酶	第16-17页
1.2.3 转录因子	第17-18页
1.2.4 植物抗病基因	第18页
1.3 第二代测序技术	第18-20页
1.3.1 第二代测序技术概况	第18-19页
1.3.2 RNA-Seq技术	第19页
1.3.3 DGE技术	第19页
1.3.4 RNA-seq与DGE的关系	第19-20页
1.4 实时荧光定量PCR	第20-21页
1.4.1 q RT-PCR的标记方法	第20页
1.4.2 q RT-PCR内参基因的选择	第20-21页
1.4.3 q RT-PCR技术的应用	第21页
1.5 研究目的及意义	第21-22页
2 谷子转录组测序及生物信息学分析	第22-41页
2.1 实验材料	第22页
2.1.1 主要仪器设备	第22页
2.1.2 主要试剂	第22页
2.1.3 谷子品种及菌种	第22页
2.2 实验方法	第22-27页
2.2.1 材料处理和取样	第22-23页
2.2.2 RNA提取及质量检测	第23-25页
2.2.3 转录组文库构建及测序	第25-26页
2.2.4 测序数据的生物信息学分析	第26-27页
2.3 结果与分析	第27-39页
2.3.1 RNA样品的质量检测	第27-29页
2.3.2 测序产量和组装质量统计	第29-31页
2.3.3 Unigene的功能注释和功能分类	第31-39页
2.3.4 预测编码蛋白框CDS	第39页
2.4 小结	第39-41页
3 谷子响应锈菌侵染的数字基因表达谱构建及分析	第41-73页
3.1 实验材料	第41页
3.1.1 主要仪器设备	第41页
3.1.2 主要试剂耗材	第41页
3.1.3 谷子品种及菌种	第41页
3.2 实验方法	第41-47页
3.2.1 材料处理和取样	第41-42页
3.2.2 RNA提取及质量检测	第42页
3.2.3 表达谱文库构建及测序	第42-43页
3.2.4 数字化基因表达谱信息分析流程	第43-47页
3.3 结果与分析	第47-71页
3.3.1 RNA样品的质量检测	第47页
3.3.2 表达谱测序结果与分析	第47-64页
3.3.3 谷子抗锈相关基因的识别	第64-71页
3.4 小结	第71-73页
4 谷子抗锈相关基因的筛选和初步验证	第73-85页
4.1 试验材料	第73页
4.1.1 主要仪器设备	第73页
4.1.2 主要试剂	第73页
4.1.3 谷子品种及菌种	第73页
4.2 试验方法	第73-76页
4.2.1 材料处理和取样	第73页
4.2.2 RNA提取及质量检测	第73-74页
4.2.3 引物设计	第74-75页
4.2.4 内参基因的选择	第75页
4.2.5 第一链c DNA的制备	第75页
4.2.6 荧光定量PCR检测	第75-76页
4.3 结果与分析	第76-84页
4.3.1 RNA样品的质量检测	第76页
4.3.2 候选基因表达分析	第76-84页
4.4 小结	第84-85页
讨论	第85-87页
结论	第87-89页
参考文献	第89-99页
附录	第99-100页
后记（含致谢）	第100-101页
攻读学位期间取得的科研成果清单	第101页

论文编号BS2715256，这篇论文共101页会员购买按0.35元/页下载，共需支付35.35元。直接购买按0.5元/页下载，共需要支付50.5元。

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