| 目录 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-40页 |
| 1 多粘类芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)的生防机理 | 第14-16页 |
| ·拮抗作用 | 第14-15页 |
| ·竞争作用 | 第15-16页 |
| ·诱导植物抗性 | 第16页 |
| 2 生防菌株的根际定殖与检测方法 | 第16-19页 |
| ·生防菌株的根际定殖 | 第16-17页 |
| ·根际定殖生防菌株的检测方法 | 第17-19页 |
| 3 多粘类芽孢杆菌合成fusaricidin和polymyxin的途径 | 第19-25页 |
| ·杀镰孢菌素(fusaricidin)的合成途径 | 第19-23页 |
| ·多粘菌素(polymyxin)的合成途径 | 第23-25页 |
| 4 微生物基因组学 | 第25-30页 |
| ·微生物基因组学发展历史简介 | 第25-26页 |
| ·微生物基因组学的研究现状简介 | 第26-27页 |
| ·DNA测序技术的发展 | 第27-29页 |
| ·多粘类芽孢杆菌全基因组测序简介 | 第29-30页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第30-31页 |
| 参考文献 | 第31-40页 |
| 第二章 多粘类芽孢杆菌SQR-21拮抗及促生机理研究 | 第40-56页 |
| 第一节 多粘类芽孢杆菌SQR-21产拮抗及促生物质研究 | 第40-46页 |
| 1 材料方法 | 第40-42页 |
| ·菌株 | 第40页 |
| ·培养基 | 第40-41页 |
| ·多粘类芽孢杆菌SQR-21种子液的培养 | 第41页 |
| ·菌株SQR-21抗菌物质粗提液的制备 | 第41页 |
| ·平板对峙实验 | 第41页 |
| ·MALDI-TOF分析菌株SQR-21产fusaricidin种类 | 第41-42页 |
| ·菌株SQR-21发酵液中植物生长素IAA的定性测定 | 第42页 |
| ·菌株SQR-21产植酸酶检测 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-46页 |
| ·菌株SQR-21及其发酵液对尖孢镰刀菌黄瓜专化型的拮抗效果 | 第42-43页 |
| ·菌株SQR-21产fusaricidin种类的鉴定 | 第43-44页 |
| ·菌株SQR-21产吲哚乙酸的能力 | 第44-45页 |
| ·菌株SQR-21产植酸酶的能力 | 第45-46页 |
| 第二节 多粘类芽孢杆菌SQR-21在黄瓜根际的定殖 | 第46-52页 |
| 1 材料方法 | 第46-48页 |
| ·菌株 | 第46页 |
| ·培养基 | 第46页 |
| ·菌株SQR-21的gfp标记 | 第46-47页 |
| ·标记菌株在植物根际和根表的定殖 | 第47-48页 |
| 2 结果与分析 | 第48-50页 |
| ·菌株SQR-21的gfp标记 | 第48-49页 |
| ·菌株SQR-21-gfp在黄瓜根系的定殖 | 第49-50页 |
| 3 讨论 | 第50-51页 |
| 4 本章小结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 第三章 多粘类芽孢杆菌SQR-21基因组fosmid文库构建与fusaricidin基因簇的筛选 | 第56-74页 |
| 1 材料方法 | 第56-61页 |
| ·菌株 | 第56页 |
| ·培养基 | 第56-57页 |
| ·菌株SQR-21菌体培养与收集 | 第57页 |
| ·菌株SQR-21总DNA提取 | 第57页 |
| ·菌株SQR-21基因组文库构建 | 第57-58页 |
| ·fusaricidin合成基因簇的筛选 | 第58-61页 |
| ·基因簇序列的生物信息学分析及使用的数据库 | 第61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-66页 |
| ·菌株SQR-21基因组fosmid文库的构建 | 第61-62页 |
| ·fusaricidin基因簇的筛选 | 第62-63页 |
| ·阳性克隆的验证与插入片段的定位 | 第63-64页 |
| ·fusaricidin基因簇的ORF分析 | 第64-65页 |
| ·fusA序列分析及结构域预测 | 第65-66页 |
| 3 讨论 | 第66-71页 |
| 4 本章小结 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-74页 |
| 第四章 多粘类芽孢杆菌SQR-21 fusaricidin基因簇启动子及转录因子的筛选与分析 | 第74-90页 |
| 1 材料方法 | 第74-79页 |
| ·菌株 | 第74页 |
| ·培养基与引物 | 第74-75页 |
| ·菌株SQR-21基因组的提取 | 第75页 |
| ·菌株SQR-21 fusaricidin启动子的筛选 | 第75-77页 |
| ·菌株SQR-21中AbrB蛋白异源表达与纯化 | 第77-79页 |
| ·fusaricidin基因簇转录调控因子的筛选——pull-down实验 | 第79页 |
| 2 结果与分析 | 第79-85页 |
| ·菌株SQR-21 fusaricidin启动子的筛选 | 第79-82页 |
| ·abrB的表达与蛋白纯化 | 第82-83页 |
| ·fusaricidin基因簇转录调控因子的筛选——pull-down实验 | 第83-85页 |
| 3 讨论 | 第85-87页 |
| 4 本章小结 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-90页 |
| 第五章 多粘类芽孢杆菌SQR-21基因组测序及分析 | 第90-108页 |
| 1 材料方法 | 第90-91页 |
| ·菌株 | 第90页 |
| ·多粘类芽孢杆菌SQR-21全基因组测序 | 第90-91页 |
| 2 结果分析 | 第91-100页 |
| ·多粘类芽孢杆菌SQR-21全基因组测序及序列注释 | 第91-97页 |
| ·多粘类芽孢杆菌SQR-21基因组分析 | 第97-100页 |
| 3 讨论——多粘类芽孢杆菌SQR-21功能基因系统分析 | 第100-107页 |
| ·根际环境适应相关基因 | 第100-102页 |
| ·促生作用 | 第102-103页 |
| ·拮抗作用 | 第103-106页 |
| ·多粘类芽孢杆菌SQR-21代谢网络 | 第106-107页 |
| 4 本章小结 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-112页 |
| 全文总结及展望 | 第112-114页 |
| 创新点 | 第114-116页 |
| 附录 | 第116-132页 |
| 致谢 | 第132-134页 |
| 攻读博士期间发表及待发表的学术论文 | 第134-135页 |
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