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当前位置:教育论文中心首页--博士论文--两株鳗弧菌全基因组序列测定及转录组比较分析
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两株鳗弧菌全基因组序列测定及转录组比较分析
 
     论文目录
 
摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章 引言第11-32页
 1 基因组测序技术及生物信息学技术概况第11-16页
   ·基因组测序技术第11-15页
   ·生物信息学第15-16页
 2 微生物基因组研究概况第16-22页
   ·微生物基因组学研究内容第17-20页
   ·微生物基因组学的应用第20-22页
 3 微生物转录组学研究第22-23页
 4 弧菌基因组及毒力因子研究概况第23-28页
   ·粘附素第24-25页
   ·胞外毒素第25-26页
   ·铁的摄取第26页
   ·分泌系统第26-27页
   ·毒力因子调控系统第27-28页
 5 鳗弧菌生物学特性第28页
 6 课题选题依据及意义第28-30页
 7 论文技术路线第30-32页
   ·细菌基因组测序技术路线第30-31页
   ·细菌转录组测序技术路线第31-32页
第二章 鳗弧菌全基因组序列分析与基因组比较分析第32-64页
 1 材料与方法第33-37页
   ·鳗弧菌菌株与培养条件第33页
   ·M3 和ATCC43308 基因组DNA的提取及质控检测第33页
   ·基因组DNA精确定量第33页
   ·细菌全基因组测序第33-34页
   ·基因组序列的组装拼接第34页
   ·基因的预测及注释第34-35页
   ·基因功能分析第35-37页
   ·RNA预测第37页
   ·氨基酸及密码子使用频率计算第37页
   ·基因组比较第37页
     ·水平基因转移第37页
     ·M3 与ATCC43308 毒力相关基因分析第37页
 2 结果分析与讨论第37-64页
   ·基因组测序第37-51页
   ·基因组比较第51-64页
第三章 鳗弧菌转录组测序及生物信息学初步分析第64-74页
 1 材料与方法第65-66页
   ·菌株保存第65页
   ·试剂材料第65页
   ·总RNA提取第65页
   ·RNA质控检测及转录组测序第65页
   ·测序reads统计分析第65页
   ·reads 进行COG分类第65-66页
   ·基因表达水平标准化处理第66页
   ·M3 与ATCC43308 表达基因的比较第66页
 2 结果第66-69页
   ·总RNA的浓度测定及质控检测第66页
   ·转录组测序reads统计分析第66-67页
   ·COG功能分类第67-68页
   ·差异基因的聚类分析第68页
   ·两株菌中与毒力相关差异基因分析第68-69页
 3 讨论第69-74页
第四章 六种弧菌多重PCR快速检测技术的建立第74-92页
 1 材料与方法第75-81页
   ·菌株第75页
   ·细菌培养及基因组模板的提取第75-77页
   ·基因的确定及引物的设计第77-79页
   ·单对引物特异性检测及PCR条件的优化第79页
   ·mPCR方法的建立及优化第79-80页
   ·多重PCR灵敏度的检测第80-81页
   ·多重PCR应用第81页
 2 结果第81-89页
   ·基因组DNA提取及质控第81页
   ·PCR引物设计第81-82页
   ·单对引物PCR扩增条件优化及交叉反应检测第82-84页
   ·mPCR条件的优化第84-86页
   ·mPCR灵敏度的检测第86-87页
   ·mPCR临床应用第87-89页
 3 讨论第89-92页
结论与展望第92-93页
参考文献第93-108页
博士期间论文与专利第108-109页
致谢第109-110页
个人工作简介第110-111页
附表第111-117页

 
 
论文编号BS2707,这篇论文共117
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