| 摘要 | 第12-14页 |
| Abstract | 第14-15页 |
| 第1章 绪论 | 第16-27页 |
| 1.1 虫黄藻的生态学意义 | 第16-17页 |
| 1.2 DNA甲基化模式与研究方法 | 第17-21页 |
| 1.2.1 DNA甲基化模式 | 第17-18页 |
| 1.2.2 探索DNA甲基化的主要研究方法 | 第18-21页 |
| 1.2.2.1 DNA甲基化抑制剂5~'-AZA-deoxycytidine (5-AZA-CdR)和Zebularine | 第18-19页 |
| 1.2.2.2 重亚硫酸盐测序 | 第19-20页 |
| 1.2.2.3 甲基化特异性PCR (MS-PCR)与重亚硫酸盐测序PCR | 第20-21页 |
| 1.3 虫黄藻中捕光复合物与光胁迫条件下反应 | 第21-24页 |
| 1.3.1 虫黄藻中的捕光复合物 | 第21-24页 |
| 1.3.1.1 多甲藻素和叶绿素a结合蛋白(PCP) | 第23页 |
| 1.3.1.2 多甲藻素-叶绿素a/c结合蛋白(acpPC) | 第23-24页 |
| 1.3.2 虫黄藻在光照胁迫条件下的反应 | 第24页 |
| 1.4 本论文研究目的与意义 | 第24-27页 |
| 第2章 材料与方法 | 第27-40页 |
| 2.1 材料 | 第27-30页 |
| 2.1.1 藻种以及培养条件 | 第27页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第27-28页 |
| 2.1.3 实验试剂配置 | 第28-30页 |
| 2.2 实验仪器 | 第30-31页 |
| 2.3 生物学信息应用软件与网站 | 第31页 |
| 2.4 实验方法 | 第31-40页 |
| 2.4.1 PI染色步骤 | 第31-32页 |
| 2.4.2 DNA提取步骤 | 第32-33页 |
| 2.4.3 DNA重亚硫酸盐处理步骤 | 第33页 |
| 2.4.4 甲基化特异的PCR(MS-PCR) | 第33-34页 |
| 2.4.5 亚硫酸氢盐处理后的PCR(BSP) | 第34-35页 |
| 2.4.6 RNA提取步骤 | 第35页 |
| 2.4.7 基因组DNA消除与cDNA合成 | 第35-36页 |
| 2.4.8 PCR反应体系 | 第36页 |
| 2.4.9 PCR产物的回收纯化 | 第36-37页 |
| 2.4.10 PCR产物连接与克隆 | 第37页 |
| 2.4.11 质粒提取与检测 | 第37-38页 |
| 2.4.12 RT-qPCR标准物的制备 | 第38页 |
| 2.4.13 RT-qPCR | 第38-40页 |
| 第3章 甲基化抑制剂对虫黄藻的生理及DNA甲基化修饰的影响 | 第40-54页 |
| 3.1 摘要 | 第40-41页 |
| 3.2 引言 | 第41-42页 |
| 3.3 方法与材料 | 第42-43页 |
| 3.3.1 藻种培养与试剂处理 | 第42页 |
| 3.3.2 细胞生长速率,细胞大小,内容物含量与DNA含量测定 | 第42-43页 |
| 3.3.3 光合效率测定 | 第43页 |
| 3.3.4 DNA提取进行重亚硫酸盐测序 | 第43页 |
| 3.4 实验结果 | 第43-50页 |
| 3.4.1 甲基化抑制剂5-AZA-CdR处理条件下细胞生长速率变化 | 第43-44页 |
| 3.4.2 甲基化抑制剂5-AZA-CdR处理条件下细胞大小,内容物含量以及细胞内DNA含量变化 | 第44-46页 |
| 3.4.3 不同浓度甲基化抑制剂5-AZA-CdR处理条件下光合作用效率 | 第46-47页 |
| 3.4.4 甲基化抑制剂Zebularine处理条件下细胞生长速率,细胞大小和内容物含量变化 | 第47-49页 |
| 3.4.5 最高浓度条件甲基化抑制剂5-AZA-CdR和Zebularine处理条件下与控制组基因组甲基化水平检测 | 第49-50页 |
| 3.5 讨论 | 第50-53页 |
| 3.5.1 虫黄藻特殊壳结构,甲基化抑制剂的药物毒性与细胞生理反应之间的关系 | 第51-52页 |
| 3.5.2 虫黄藻中是否存在能够与甲基化抑制剂发生反应的甲基化转移酶 | 第52-53页 |
| 3.6 小结 | 第53-54页 |
| 第4章 在不同光照条件下探索虫黄藻光系统基因甲基化、基因表达水平、及甲基化酶的关系 | 第54-78页 |
| 4.1 摘要 | 第54-55页 |
| 4.2 引言 | 第55-56页 |
| 4.3 方法材料 | 第56-64页 |
| 4.3.1 F.kawagutii细胞培养与光合效率的测定 | 第56-57页 |
| 4.3.2 基因序列的注释与RT-qPCR引物设计 | 第57-59页 |
| 4.3.3 DNA提取,重亚硫酸盐处理 | 第59-60页 |
| 4.3.4 甲基化特异性PCR (MSP)与重亚硫酸盐测序PCR(BSP) | 第60-63页 |
| 4.3.5 RNA的提取与cDNA合成以及基因表达分析 | 第63-64页 |
| 4.4 结果 | 第64-73页 |
| 4.4.1 细胞增长速率与光合作用测定 | 第64-65页 |
| 4.4.2 甲基化特异的PCR以及结果与P.tricornutum进行比较 | 第65-68页 |
| 4.4.3 重亚硫酸盐测序PCR (BSP) | 第68-71页 |
| 4.4.4 不同光照条件下三个基因转录水平的差异 | 第71-72页 |
| 4.4.5 Symbio-DIRS-DNMT3基因进化树构建与基因表达分析 | 第72-73页 |
| 4.5 讨论 | 第73-76页 |
| 4.5.1 两种不同的方法探究F.kawagutii基因组甲基化水平 | 第74页 |
| 4.5.2 基因表达与基因体之间甲基化水平的关系 | 第74-75页 |
| 4.5.3 Symbio-DIRS-DNMT3基因表达与基因体甲基化之间的关系 | 第75-76页 |
| 4.6 小结 | 第76-78页 |
| 第5章 实验结论与展望 | 第78-81页 |
| 5.1 实验结果总结 | 第78页 |
| 5.2 主要结果 | 第78-79页 |
| 5.3 论文特色与创新点 | 第79页 |
| 5.4 不足之处与展望 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
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