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四种山雀线粒体基因组测序与雀形目线粒体谱系基因组学分析 |
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| 摘要 | 第1-5页 | | Abstract | 第5-10页 | | 第一部分 前言 | 第10-18页 | | 1 线粒体基因组 | 第10-12页 | | ·线粒体与线粒体基因组 | 第10页 | | ·线粒体基因组的遗传与进化特点 | 第10-12页 | | 2 鸟类线粒体基因组 | 第12-13页 | | ·鸟类线粒体基因组的特点 | 第12页 | | ·鸟类线粒体基因组的研究进展 | 第12-13页 | | ·雀形目分类及分子系统学研究 | 第13页 | | 3 线粒体基因功效与性能 | 第13-15页 | | 4 本研究的目的及意义 | 第15-18页 | | ·研究的物种 | 第15-16页 | | ·研究的目的和意义 | 第16-18页 | | 第二部分 材料与方法 | 第18-30页 | | 1 实验材料 | 第18-20页 | | ·标本采集、鉴定与保存 | 第18页 | | ·实验所用仪器及试剂 | 第18-20页 | | 2 实验方法 | 第20-25页 | | ·物种总DNA提取 | 第20-21页 | | ·物种总DNA检测 | 第21页 | | ·PCR所需引物设计及扩增 | 第21-25页 | | ·扩增产物测序 | 第25页 | | 3 数据处理及结果分析 | 第25-26页 | | ·测序结果的拼接 | 第25页 | | ·线粒体基因组全序列所含基因定位及注释 | 第25-26页 | | ·线粒体全基因组结构与组成情况的分析 | 第26页 | | 4 雀形目鸟类系统发育分析 | 第26-30页 | | ·序列数据来源 | 第26-27页 | | ·序列比对 | 第27-28页 | | ·序列各组成分析 | 第28页 | | ·所选数据集系统发育信号检测 | 第28页 | | ·系统发育树构建方法 | 第28-30页 | | 第三部分 实验结果与分析 | 第30-68页 | | 1 总DNA的提取结果 | 第30页 | | 2 PCR扩增结果 | 第30-32页 | | ·L-PCR扩增结果 | 第30-31页 | | ·Sub-PCR扩增结果 | 第31-32页 | | 3 序列拼接与数据处理结果 | 第32页 | | 4 灰蓝山雀线粒体基因组 | 第32-42页 | | ·基因组注释与基因顺序 | 第32-35页 | | ·基因组特征 | 第35-37页 | | ·RNA及其二级结构 | 第37-41页 | | ·控制区 | 第41-42页 | | 5 大山雀线粒体基因组 | 第42-50页 | | ·基因组注释与基因顺序 | 第42-44页 | | ·基因组特征 | 第44-46页 | | ·RNA及其二级结构 | 第46页 | | ·控制区 | 第46-50页 | | 6 绿背山雀线粒体基因组 | 第50-59页 | | ·基因组注释与基因顺序 | 第50-52页 | | ·基因组特征 | 第52-54页 | | ·RNA及其二级结构 | 第54-57页 | | ·控制区 | 第57-59页 | | 7 沼泽山雀线粒体基因组 | 第59-68页 | | ·基因组注释与基因顺序 | 第59-61页 | | ·基因组特征 | 第61-63页 | | ·RNA及其二级结构 | 第63-66页 | | ·控制区 | 第66-68页 | | 第四部分 雀形目鸟类线粒体基因组比较 | 第68-76页 | | 1 四种山雀科鸟类线粒体基因组比较 | 第68-69页 | | 2 ND3中胞嘧啶插入现象 | 第69-70页 | | 3 超级保守序列 | 第70-72页 | | 4 部分雀形目鸟类的双控制区 | 第72-73页 | | 5 鸟类控制区保守序列 | 第73-76页 | | 第五部分 雀形目系统发育关系分析与讨论 | 第76-86页 | | 1 数据处理及数据集划分 | 第76页 | | 2 简约法构建系统发育树 | 第76-79页 | | 3 似然法构建系统发育树 | 第79-82页 | | 4 贝叶斯法构建系统发育树 | 第82-85页 | | 5 结果讨论 | 第85-86页 | | 第六部分 线粒体基因功效与性能 | 第86-93页 | | 1 系统发育信号评估 | 第86-88页 | | 2 发现真树的能力的评价 | 第88-89页 | | 3 对不同构建系统树方法的敏感性 | 第89-90页 | | 4 不同基因之间的相合性分析 | 第90-92页 | | 5 对不同深度分支的解析能力 | 第92-93页 | | 结论 | 第93-94页 | | 参考文献 | 第94-102页 | | 致谢 | 第102-103页 | | 攻读学位期间的研究成果 | 第103页 |
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论文编号BS147708，这篇论文共103页
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